90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4209 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4209  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  100 
 
 		 162 aa  336  9.999999999999999e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176397  normal  0.786094 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1775  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  55.49 
 
 		 165 aa  199  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0032  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  57.86 
 
 		 158 aa  191  3e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.630723  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2152  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  56.25 
 
 		 162 aa  185  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.740142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5105  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  48.75 
 
 		 162 aa  154  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.113344  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3485  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  47.5 
 
 		 163 aa  152  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.492834 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01291  DUF636 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G09754)  44.58 
 
 		 164 aa  135  2e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1629  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  46.54 
 
 		 161 aa  131  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0163  hypothetical protein  30.3 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0830  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  31.65 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2000  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  31.78 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.385456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3511  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  27.4 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1447  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  27.56 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.724218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1582  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  27.14 
 
 		 135 aa  52.8  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.625923  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2632  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  27.61 
 
 		 137 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0579  hypothetical protein  28.91 
 
 		 141 aa  50.8  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3388  hypothetical protein  27.21 
 
 		 135 aa  50.4  0.000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1659  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  26.92 
 
 		 137 aa  50.4  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2294  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  29.53 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.267657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43799  predicted protein  31.68 
 
 		 149 aa  49.7  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7106  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  35.71 
 
 		 125 aa  48.9  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.221304 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2421  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  33.71 
 
 		 146 aa  48.9  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2864  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  28.8 
 
 		 143 aa  48.5  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.567755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2224  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  26.92 
 
 		 153 aa  48.5  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.124259  normal  0.831461 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0987  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  25.76 
 
 		 137 aa  48.5  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0500  hypothetical protein  26.15 
 
 		 137 aa  48.1  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4439  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  27.56 
 
 		 132 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0661  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  26.15 
 
 		 137 aa  48.1  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2827  putative lipoprotein  24.03 
 
 		 139 aa  47.8  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0331828  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0374  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  33.33 
 
 		 138 aa  47  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4168  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  29.81 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4581  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  31.31 
 
 		 153 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.3716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2353  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  28 
 
 		 143 aa  47  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0485749  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2806  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  28.26 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.22176  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1005  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  27.13 
 
 		 161 aa  47  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2904  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  21.68 
 
 		 140 aa  47  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.347392  normal  0.579092 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3057  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  27.1 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2005  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  30.69 
 
 		 132 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1362  hypothetical protein  26.62 
 
 		 137 aa  46.2  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.98535e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1825  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  27.27 
 
 		 135 aa  46.2  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.893199  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2364  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  31.43 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29150  hypothetical protein  34.11 
 
 		 131 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0146992 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3056  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  26.36 
 
 		 134 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00204984  hitchhiker  0.00341554 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0916  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  26.36 
 
 		 134 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.403663 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3921  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  28.04 
 
 		 175 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3548  hypothetical protein  27.46 
 
 		 129 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3339  hypothetical protein  29.01 
 
 		 137 aa  45.4  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3983  hypothetical protein  33.33 
 
 		 131 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1962  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  26.39 
 
 		 160 aa  45.1  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.72415  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1877  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  26.56 
 
 		 134 aa  45.1  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.798516 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2924  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  27.27 
 
 		 132 aa  45.4  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00417585  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0713  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  28.78 
 
 		 136 aa  45.1  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0221  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  29.13 
 
 		 135 aa  45.1  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3022  hypothetical protein  31.63 
 
 		 154 aa  44.7  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.548087 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72130  hypothetical protein  27.45 
 
 		 139 aa  44.3  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0102273  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2224  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  32.61 
 
 		 140 aa  43.9  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.622287  normal  0.335155 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0883  hypothetical protein  27.08 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0409  hypothetical protein  27.35 
 
 		 137 aa  43.9  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.834181  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5412  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  34.78 
 
 		 125 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.162493 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1698  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  30.93 
 
 		 133 aa  43.9  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3283  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  25.87 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1324  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  25.38 
 
 		 137 aa  43.1  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0763  hypothetical protein  25.95 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.202538 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5167  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  26.12 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.578961 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3845  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  29.75 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2755  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  47.92 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.811781  normal  0.919097 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0450  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  29.23 
 
 		 134 aa  43.1  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000000104305  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0739  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  26.03 
 
 		 136 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0424  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  31.07 
 
 		 139 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.155822  normal  0.516828 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2367  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  25.34 
 
 		 142 aa  42.4  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.703282  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07594  DUF636 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G15290)  25.66 
 
 		 136 aa  42  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.651423 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2041  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  28.04 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000392642 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0854  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  28.26 
 
 		 135 aa  42  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3020  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  29.32 
 
 		 151 aa  41.6  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.082898  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0499  hypothetical protein  28.44 
 
 		 123 aa  41.6  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0603  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  24.81 
 
 		 139 aa  42  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.791565 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3395  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  26.57 
 
 		 136 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0078  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  35.63 
 
 		 139 aa  41.6  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.55179 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3911  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  27.27 
 
 		 175 aa  41.6  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0706653  normal  0.116642 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1907  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  23.61 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.39902  hitchhiker  0.0000265119 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3282  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  27.48 
 
 		 131 aa  41.2  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.347186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1980  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  21.71 
 
 		 143 aa  41.2  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504481 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2410  hypothetical protein  27.27 
 
 		 158 aa  41.2  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0334  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  29.41 
 
 		 134 aa  41.2  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1514  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  28.89 
 
 		 149 aa  41.2  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3850  hypothetical protein  28.67 
 
 		 133 aa  40.8  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3257  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  27.69 
 
 		 131 aa  40.8  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.158594  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05940  DUF636 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G03180)  27.91 
 
 		 142 aa  40.4  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3119  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  25.87 
 
 		 136 aa  40.4  0.01  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1480  hypothetical protein  32.98 
 
 		 164 aa  40.4  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.412839  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>