More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1444 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_3509  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding protein  55.27 
 
 
577 aa  637    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0871  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding protein  55.71 
 
 
576 aa  651    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1444  thiamine pyrophosphate protein central region  100 
 
 
581 aa  1149    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0135797  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2503  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.6 
 
 
566 aa  249  7e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000132944  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1692  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.58 
 
 
563 aa  246  6e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3720  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.04 
 
 
566 aa  240  4e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104335  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0408  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.47 
 
 
562 aa  239  1e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2122  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  33.13 
 
 
625 aa  238  3e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.522117  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2746  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.84 
 
 
566 aa  237  5.0000000000000005e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0153  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.89 
 
 
562 aa  236  8e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0209009 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1903  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.89 
 
 
563 aa  236  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1495  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.04 
 
 
566 aa  234  3e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.433241 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4239  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  33.47 
 
 
620 aa  233  8.000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.302024 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2168  acetolactate synthase, large subunit  32.22 
 
 
562 aa  231  3e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0281  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.2 
 
 
554 aa  230  4e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1911  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.2 
 
 
566 aa  229  9e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.500204  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4356  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  32.22 
 
 
597 aa  228  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0195043  normal  0.165363 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0741  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.11 
 
 
573 aa  228  2e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2821  acetolactate synthase large subunit  32.93 
 
 
581 aa  228  3e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0218  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.26 
 
 
588 aa  228  3e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0158938 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1260  acetolactate synthase, large subunit  31.6 
 
 
566 aa  227  4e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00775476  hitchhiker  0.00000116322 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1662  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.96 
 
 
564 aa  227  4e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3430  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.37 
 
 
574 aa  227  5.0000000000000005e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.646845  normal  0.0217288 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1072  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  30.56 
 
 
566 aa  226  6e-58  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2168  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.67 
 
 
573 aa  226  9e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0624  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.78 
 
 
574 aa  225  1e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.146468 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1888  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.52 
 
 
570 aa  225  2e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1714  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.52 
 
 
570 aa  225  2e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1691  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.52 
 
 
570 aa  225  2e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0594  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.29 
 
 
557 aa  225  2e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000784156  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1170  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.08 
 
 
583 aa  225  2e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1850  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.52 
 
 
570 aa  225  2e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0722574  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08850  acetolactate synthase, large subunit  30.52 
 
 
623 aa  225  2e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.369585  normal  0.232213 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2558  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.22 
 
 
566 aa  225  2e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0505809  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1070  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.77 
 
 
558 aa  225  2e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0531725  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1906  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  31.5 
 
 
619 aa  224  4e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.365234  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1952  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  31.5 
 
 
619 aa  224  4e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.338885  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2624  acetolactate synthase catalytic subunit  33.76 
 
 
563 aa  224  4e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1886  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  31.5 
 
 
619 aa  224  4e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0490387  normal  0.105007 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3554  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.71 
 
 
581 aa  223  6e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.743835  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3347  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.42 
 
 
561 aa  223  8e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.18132  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1187  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.25 
 
 
557 aa  223  9.999999999999999e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0736  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.13 
 
 
597 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.591869  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1620  acetolactate synthase catalytic subunit  32.86 
 
 
556 aa  222  9.999999999999999e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.546066  normal  0.5994 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1905  acetolactate synthase large subunit biosynthetic type  29.13 
 
 
573 aa  223  9.999999999999999e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3401  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.57 
 
 
575 aa  221  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3531  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.57 
 
 
575 aa  221  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1910  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.97 
 
 
565 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0608  acetolactate synthase large subunit biosynthetic type  30.04 
 
 
566 aa  222  1.9999999999999999e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0581  acetolactate synthase catalytic subunit  32.73 
 
 
554 aa  222  1.9999999999999999e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.188542  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2932  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.57 
 
 
593 aa  221  1.9999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1547  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  34.34 
 
 
569 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.272513  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1443  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.18 
 
 
559 aa  221  3e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0306105  hitchhiker  0.00417959 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0019  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.96 
 
 
554 aa  221  3e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8059  acetolactate synthase, large subunit  31.59 
 
 
578 aa  221  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.634605  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3108  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.66 
 
 
571 aa  221  3e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3813  acetolactate synthase catalytic subunit  31.72 
 
 
554 aa  221  3e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2516  acetolactate synthase, large subunit  29.64 
 
 
542 aa  221  3e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000744784  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0325  thiamine pyrophosphate protein central region  33.45 
 
 
576 aa  220  6e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.555432  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2714  acetolactate synthase, large subunit  29.09 
 
 
555 aa  220  6e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3230  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.54 
 
 
644 aa  219  8.999999999999998e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0596  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.22 
 
 
573 aa  219  1e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.793346  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1519  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  30.05 
 
 
595 aa  219  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2059  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30 
 
 
573 aa  219  1e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6310  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  30.05 
 
 
595 aa  219  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.683934  normal  0.626612 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0110  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.84 
 
 
557 aa  219  1e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6968  thiamine pyrophosphate protein central region  29.88 
 
 
595 aa  219  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0284  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.2 
 
 
555 aa  218  2e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1592  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.79 
 
 
569 aa  218  2e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3023  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.42 
 
 
561 aa  218  2e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000478309  normal  0.133355 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2520  acetolactate synthase large subunit biosynthetic type  29.52 
 
 
582 aa  218  2.9999999999999998e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00825  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.39 
 
 
574 aa  218  2.9999999999999998e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2981  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.42 
 
 
556 aa  218  2.9999999999999998e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0018312  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1092  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  32.19 
 
 
600 aa  218  2.9999999999999998e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0748  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.09 
 
 
572 aa  217  4e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.651563  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0083  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.16 
 
 
604 aa  216  9e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2666  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.55 
 
 
573 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000302703  decreased coverage  0.000148215 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2401  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.75 
 
 
558 aa  216  9.999999999999999e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1929  acetolactate synthase catalytic subunit  31.6 
 
 
572 aa  216  9.999999999999999e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1242  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.28 
 
 
563 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3624  acetolactate synthase catalytic subunit  31.3 
 
 
554 aa  216  9.999999999999999e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2122  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.35 
 
 
572 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3605  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.95 
 
 
572 aa  215  9.999999999999999e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1851  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.28 
 
 
573 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842705  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00079  acetolactate synthase III large subunit  30 
 
 
574 aa  215  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0303  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.04 
 
 
559 aa  215  1.9999999999999998e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.296158  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00078  hypothetical protein  30 
 
 
574 aa  215  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0947  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.53 
 
 
587 aa  215  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0634  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.27 
 
 
573 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0951931  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001649  acetolactate synthase large subunit  29.86 
 
 
574 aa  214  1.9999999999999998e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.546971  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0666  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.57 
 
 
552 aa  215  1.9999999999999998e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0294  putative pyruvate decarboxylase  31.66 
 
 
590 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4046  thiamine pyrophosphate protein central region  33.07 
 
 
587 aa  215  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.26689  normal  0.848458 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3793  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.86 
 
 
572 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1955  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.24 
 
 
618 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0672621 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1643  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.29 
 
 
572 aa  214  3.9999999999999995e-54  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.169007  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08870  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  31.85 
 
 
620 aa  214  3.9999999999999995e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2256  acetolactate synthase, large subunit  31.6 
 
 
560 aa  214  3.9999999999999995e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0079  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30 
 
 
574 aa  214  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1123  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  33.47 
 
 
629 aa  214  3.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.425518  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>