45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5829 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012853  Rleg_5829  putative cytochrome c protein, class I  100 
 
 		 136 aa  276  5e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5240  putative cytochrome c class I protein  60.34 
 
 		 140 aa  143  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.114895  normal  0.361505 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2986  hypothetical protein  48.85 
 
 		 132 aa  128  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.338294  normal  0.0850747 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2352  hypothetical protein  52.21 
 
 		 133 aa  123  7e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.188456  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0092  hypothetical protein  48.8 
 
 		 134 aa  120  6e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.215485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3893  cytochrome c class I  46.59 
 
 		 165 aa  90.5  6e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.894591  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1994  putative cytochrome c  42.42 
 
 		 132 aa  80.9  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0572463  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3383  cytochrome c class I  44.57 
 
 		 120 aa  73.2  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1995  cytochrome c class I  39.36 
 
 		 293 aa  72.4  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0213556  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1767  cytochrome c oxidase, subunit II  36.45 
 
 		 352 aa  53.9  0.0000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.204958  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4792  cytochrome c oxidase, subunit II  35.29 
 
 		 354 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280165  normal  0.517537 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3540  cytochrome c oxidase, subunit II  35.29 
 
 		 311 aa  51.6  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2792  cytochrome c oxidase, subunit II  36.78 
 
 		 330 aa  50.8  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.625738  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5244  cytochrome c oxidase, subunit II  30.19 
 
 		 326 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0788277  normal  0.868201 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1993  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 		 314 aa  49.7  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0975891  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0118  cytochrome c oxidase, subunit IIC  42.68 
 
 		 324 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.134505  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0697  cytochrome c oxidase, subunit II  37.36 
 
 		 322 aa  47.8  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6354  cytochrome c oxidase subunit II  32.71 
 
 		 334 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4760  cytochrome c oxidase subunit II  35.79 
 
 		 327 aa  46.2  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.723293  normal  0.0836993 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0016  cytochrome c class I  35.65 
 
 		 224 aa  46.2  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.6838  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1705  cytochrome c, monohaem  38.38 
 
 		 324 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.829367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5502  cytochrome c oxidase, subunit II  37.33 
 
 		 370 aa  45.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.535121  normal  0.0572426 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1754  cytochrome c, monohaem  39.02 
 
 		 324 aa  45.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0621  cytochrome c, class I  31.19 
 
 		 212 aa  44.3  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.276705  normal  0.860065 
 
 
-
 
NC_004310  BR0039  cytochrome c, membrane-bound  35.09 
 
 		 202 aa  43.9  0.0008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.450907  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0039  cytochrome c, membrane-bound  34.78 
 
 		 192 aa  43.9  0.0008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6572  cytochrome c, monohaem  36 
 
 		 352 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.381109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0167  putative cytochrome c oxidase subunit II  29.81 
 
 		 371 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.26265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0102  cytochrome c  32.46 
 
 		 185 aa  43.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.108181  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6539  cytochrome c, monohaem  33.33 
 
 		 434 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.537411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1449  cytochrome c oxidase, subunit II  31.37 
 
 		 346 aa  42.4  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.015711 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0460  cytochrome c oxidase, subunit II  34.67 
 
 		 353 aa  42.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.354816  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0771  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 		 381 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0315373  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6146  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 		 353 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.870856  normal  0.304247 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0783  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 		 372 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1292  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 		 354 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493898  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0945  cytochrome oxidase subunit II  33.33 
 
 		 372 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.891376  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3033  cytochrome c class I  31.71 
 
 		 238 aa  41.2  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6286  cytochrome c oxidase, subunit II  34.67 
 
 		 352 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.257472  normal  0.0263748 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1581  PA14 domain protein  22.34 
 
 		 969 aa  40.8  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5826  cytochrome c oxidase, subunit II  32.1 
 
 		 330 aa  40.4  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6289  cytochrome c class I  25 
 
 		 150 aa  40.4  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2183  putative cytochrome c oxidase polypeptide II precursor  33.33 
 
 		 338 aa  40.4  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0732382 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0248  nitric-oxide reductase, small subunit  26.19 
 
 		 150 aa  40.4  0.008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0079  putative cytochrome c oxidase subunit II  32.43 
 
 		 342 aa  40.4  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.917681  hitchhiker  0.00234837 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>