58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2352 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2352  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  267  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.188456  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2986  hypothetical protein  74.44 
 
 		 132 aa  190  5e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.338294  normal  0.0850747 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0092  hypothetical protein  68.18 
 
 		 134 aa  187  5e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.215485  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5829  putative cytochrome c protein, class I  49.61 
 
 		 136 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5240  putative cytochrome c class I protein  54.37 
 
 		 140 aa  120  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.114895  normal  0.361505 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3893  cytochrome c class I  53.06 
 
 		 165 aa  110  5e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.894591  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1994  putative cytochrome c  49.43 
 
 		 132 aa  87.4  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0572463  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3383  cytochrome c class I  43.75 
 
 		 120 aa  84  6e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1995  cytochrome c class I  43.16 
 
 		 293 aa  80.5  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0213556  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3540  cytochrome c oxidase, subunit II  40.45 
 
 		 311 aa  60.8  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0697  cytochrome c oxidase, subunit II  36.89 
 
 		 322 aa  57  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6572  cytochrome c, monohaem  41.46 
 
 		 352 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.381109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4792  cytochrome c oxidase, subunit II  41.33 
 
 		 354 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280165  normal  0.517537 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5502  cytochrome c oxidase, subunit II  41.46 
 
 		 370 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.535121  normal  0.0572426 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0783  cytochrome c oxidase, subunit II  39.24 
 
 		 372 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0945  cytochrome oxidase subunit II  39.24 
 
 		 372 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.891376  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0771  cytochrome c oxidase, subunit II  39.24 
 
 		 381 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0315373  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3770  cytochrome c oxidase subunit II  31.65 
 
 		 349 aa  53.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6286  cytochrome c oxidase, subunit II  40 
 
 		 352 aa  51.6  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.257472  normal  0.0263748 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2646  cytochrome c oxidase subunit II  31.65 
 
 		 349 aa  51.6  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0991495  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4046  cytochrome c oxidase, subunit II  31.65 
 
 		 349 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1193  cytochrome c oxidase, subunit II  31.65 
 
 		 349 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3856  cytochrome c oxidase subunit II  31.65 
 
 		 349 aa  51.2  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.15254  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4062  cytochrome c oxidase, subunit II  31.65 
 
 		 349 aa  50.8  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3959  cytochrome c oxidase, subunit II  31.65 
 
 		 349 aa  50.8  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4154  cytochrome c oxidase subunit II  31.65 
 
 		 349 aa  51.2  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3704  cytochrome c oxidase, subunit II  31.65 
 
 		 349 aa  50.8  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.136015  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3991  cytochrome c oxidase, subunit II  31.65 
 
 		 349 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3687  cytochrome c oxidase, subunit II  31.65 
 
 		 349 aa  50.8  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6146  cytochrome c oxidase, subunit II  38.96 
 
 		 353 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.870856  normal  0.304247 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0460  cytochrome c oxidase, subunit II  36 
 
 		 353 aa  49.7  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.354816  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0167  putative cytochrome c oxidase subunit II  39.47 
 
 		 371 aa  49.7  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.26265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6539  cytochrome c, monohaem  37.8 
 
 		 434 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.537411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1292  cytochrome c oxidase, subunit II  38.96 
 
 		 354 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493898  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0628  cytochrome c oxidase, subunit II  35 
 
 		 351 aa  48.9  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.197881 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6354  cytochrome c oxidase subunit II  31.91 
 
 		 334 aa  48.5  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1993  cytochrome c oxidase, subunit II  28.89 
 
 		 314 aa  47.8  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0975891  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1767  cytochrome c oxidase, subunit II  33.72 
 
 		 352 aa  46.2  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.204958  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2792  cytochrome c oxidase, subunit II  32.26 
 
 		 330 aa  46.2  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.625738  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5244  cytochrome c oxidase, subunit II  32 
 
 		 326 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0788277  normal  0.868201 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5826  cytochrome c oxidase, subunit II  32.91 
 
 		 330 aa  45.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0079  putative cytochrome c oxidase subunit II  35.37 
 
 		 342 aa  44.3  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.917681  hitchhiker  0.00234837 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2183  putative cytochrome c oxidase polypeptide II precursor  33.75 
 
 		 338 aa  43.9  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0732382 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0983  cytochrome c oxidase, subunit II  26.51 
 
 		 356 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0709  cytochrome c oxidase subunit II  32.93 
 
 		 355 aa  43.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.669005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3379  cytochrome c oxidase, subunit II  34.67 
 
 		 318 aa  43.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3892  cytochrome c oxidase subunit II  32.94 
 
 		 345 aa  43.5  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.740774  normal  0.178097 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0011  cytochrome c class I  34.09 
 
 		 132 aa  42.7  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3864  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 170 aa  42.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.166005  normal  0.942386 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1449  cytochrome c oxidase, subunit II  26.21 
 
 		 346 aa  42.4  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.015711 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2991  cytochrome c oxidase, subunit II  32.97 
 
 		 338 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336386  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1855  cytochrome c oxidase, subunit II  27.71 
 
 		 356 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5491  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 		 355 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4687  cytochrome c, class I  34.86 
 
 		 209 aa  41.6  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0285175  normal  0.266621 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1194  hypothetical protein  28.07 
 
 		 264 aa  41.2  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2347  cytochrome c oxidase, subunit II  30 
 
 		 334 aa  40.8  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0096  cytochrome c oxidase, subunit II  28.75 
 
 		 334 aa  40.4  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.296292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2800  cytochrome c  33.65 
 
 		 235 aa  40.4  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.318955 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>