34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1194 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1194  hypothetical protein  100 
 
 		 264 aa  541  1e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0460  hypothetical protein  45.28 
 
 		 260 aa  224  1e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4022  hypothetical protein  44.57 
 
 		 274 aa  218  8.999999999999998e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4113  hypothetical protein  45.38 
 
 		 274 aa  214  9e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2930  cytochrome c family protein  43.35 
 
 		 205 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0541  hypothetical protein  45.41 
 
 		 187 aa  166  5e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1835  cytochrome c, class I  34.58 
 
 		 166 aa  50.8  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.315382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4792  cytochrome c oxidase, subunit II  30.63 
 
 		 354 aa  50.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280165  normal  0.517537 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3033  cytochrome c class I  22.34 
 
 		 238 aa  49.7  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1880  cytochrome c, class I  34.02 
 
 		 122 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0174  cytochrome c2  28.72 
 
 		 131 aa  47.8  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.000396379  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0153  cytochrome c heme-binding site:cytochrome c, class IA/ IB:cytochrome c, class I  28.72 
 
 		 131 aa  47.8  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000226956  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1249  cytochrome c class I  22.34 
 
 		 238 aa  47.4  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1469  putative nitric-oxide reductase subunit C  35.14 
 
 		 144 aa  47  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0490072 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2070  cytochrome c2  32.99 
 
 		 122 aa  47  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.170009  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3552  cytochrome c, class I  33.72 
 
 		 128 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0011  cytochrome c class I  30.43 
 
 		 132 aa  46.6  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0697  cytochrome c oxidase, subunit II  31.11 
 
 		 322 aa  45.8  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3076  cytochrome c class I  30.09 
 
 		 165 aa  45.8  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3480  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 127 aa  44.3  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3480  cytochrome c, class I  29.13 
 
 		 154 aa  44.3  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.453541  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6572  cytochrome c, monohaem  35.87 
 
 		 352 aa  43.9  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.381109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4031  class I cytochrome c  31.91 
 
 		 129 aa  43.9  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.586339 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0200  cytochrome c class I  19.93 
 
 		 743 aa  43.5  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1581  PA14 domain protein  24.66 
 
 		 969 aa  43.1  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6323  cytochrome c class I  30.1 
 
 		 130 aa  43.1  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0651  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  31.76 
 
 		 308 aa  43.1  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3540  cytochrome c oxidase, subunit II  32.63 
 
 		 311 aa  42.7  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4583  cytochrome c class I  29.27 
 
 		 118 aa  42.4  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00400374  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0250  cytochrome c class I  28.43 
 
 		 220 aa  42.4  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.312298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3283  cytochrome c, class I  38.98 
 
 		 225 aa  42.4  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86015  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1287  cytochrome c class I  32.1 
 
 		 122 aa  42  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.208797  normal  0.579933 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0167  putative cytochrome c oxidase subunit II  30.49 
 
 		 371 aa  42  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.26265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3893  cytochrome c class I  29.7 
 
 		 165 aa  42  0.01  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.894591  normal  0.203291 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>