44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3033 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3033  cytochrome c class I  100 
 
 		 238 aa  503  1e-141  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1249  cytochrome c class I  91.6 
 
 		 238 aa  475  1e-133  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2759  cytochrome c class I  40.16 
 
 		 253 aa  181  8.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1256  cytochrome c, class I  34.8 
 
 		 272 aa  128  7.000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0822  nitric oxide reductase, cytochrome c-containing subunit  33.94 
 
 		 277 aa  124  1e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.198002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2768  cytochrome c class I  37.96 
 
 		 290 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.712603  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3436  cytochrome c, class I  37.96 
 
 		 290 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.441606  normal  0.713637 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1469  putative nitric-oxide reductase subunit C  36.23 
 
 		 144 aa  96.7  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0490072 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3190  cytochrome c, class I  34.31 
 
 		 142 aa  91.3  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1850  nitric-oxide reductase  37.93 
 
 		 173 aa  90.5  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0121  nitric-oxide reductase  34.75 
 
 		 146 aa  90.9  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.281519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3114  nitric-oxide reductase  31.94 
 
 		 149 aa  89.7  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.848793  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0624  nitric-oxide reductase subunit C  34.04 
 
 		 146 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.7522  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3183  nitric-oxide reductase subunit C  35.33 
 
 		 150 aa  89.4  5e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0696448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0562  nitric-oxide reductase subunit C  32.61 
 
 		 141 aa  88.6  9e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00000000244582  normal  0.667506 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06810  nitric-oxide reductase subunit C  33.33 
 
 		 146 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2597  cytochrome c class I  37.23 
 
 		 141 aa  85.5  7e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.570262  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2484  nitric-oxide reductase  33.33 
 
 		 150 aa  84  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.595154 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1981  nitric-oxide reductase  32.87 
 
 		 148 aa  84  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1969  nitric-oxide reductase  30 
 
 		 150 aa  84  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6289  cytochrome c class I  32.41 
 
 		 150 aa  83.6  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0324  nitric oxide reductase subunit C, cytochrome c  30 
 
 		 150 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.115359  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0224  nitric-oxide reductase, small subunit  34.01 
 
 		 150 aa  82.8  0.000000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.501338  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0970  hypothetical protein  30.2 
 
 		 147 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4386  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 150 aa  82.4  0.000000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2088  nitric-oxide reductase subunit C  32.87 
 
 		 150 aa  82  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.601343  normal  0.740001 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2117  nitric-oxide reductase  34.72 
 
 		 150 aa  82  0.000000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.916968 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2254  hypothetical protein  34.65 
 
 		 133 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0248  nitric-oxide reductase, small subunit  33.33 
 
 		 150 aa  80.5  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1515  nitric-oxide reductase  33.1 
 
 		 150 aa  80.1  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0600  nitric-oxide reductase, C subunit  29.37 
 
 		 148 aa  78.6  0.00000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1641  nitric-oxide reductase, small subunit  33.33 
 
 		 150 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2401  hypothetical protein  39.42 
 
 		 200 aa  75.1  0.0000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1983  nitric-oxide reductase subunit NorC  34.71 
 
 		 228 aa  64.3  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000092612  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1194  hypothetical protein  22.34 
 
 		 264 aa  49.7  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1298  nitrous-oxide reductase  28.43 
 
 		 865 aa  47.8  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000502464  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0010  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  25.77 
 
 		 863 aa  45.4  0.0008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0271061  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1229  cytochrome c class I  28.21 
 
 		 98 aa  44.3  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3544  cytochrome b/b6 domain-containing protein  36.71 
 
 		 488 aa  44.3  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.148449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5240  putative cytochrome c class I protein  27.62 
 
 		 140 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.114895  normal  0.361505 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1455  cytochrome c class I  25.37 
 
 		 278 aa  43.5  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000371587  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1729  methyl-accepting chemotaxis protein  24.74 
 
 		 862 aa  43.5  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.371209  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1236  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1 subunit  20.39 
 
 		 367 aa  43.1  0.004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0096  cytochrome c oxidase, subunit II  28.46 
 
 		 334 aa  42.4  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.296292  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>