221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4785 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_4785  pyrroline-5-carboxylate reductase  100 
 
 		 260 aa  526  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0921378 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4835  pyrroline-5-carboxylate reductase  86.1 
 
 		 261 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0350204 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4127  pyrroline-5-carboxylate reductase  56.86 
 
 		 258 aa  292  4e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1041  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.15 
 
 		 259 aa  189  5e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.032518  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1422  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.47 
 
 		 264 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00291687  normal  0.134961 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6863  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.61 
 
 		 263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00150835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49658  predicted protein  28.68 
 
 		 339 aa  115  7.999999999999999e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5145  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.83 
 
 		 272 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3354  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.54 
 
 		 272 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05150  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.42 
 
 		 273 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0535  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.7 
 
 		 277 aa  74.7  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5047  pyrroline-5-carboxylate reductase  27 
 
 		 272 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.518044  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1193  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.91 
 
 		 272 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0154607  normal  0.507121 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2688  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.19 
 
 		 272 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.452831  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1192  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.54 
 
 		 272 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000775485  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5095  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.18 
 
 		 272 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4968  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.18 
 
 		 272 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1263  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.54 
 
 		 272 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00228679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2417  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.07 
 
 		 271 aa  71.2  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0646  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.64 
 
 		 270 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0620  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.64 
 
 		 270 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2833  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.05 
 
 		 278 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0012  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.37 
 
 		 272 aa  70.9  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0493  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.32 
 
 		 273 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0370  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.14 
 
 		 272 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2684  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.57 
 
 		 274 aa  69.7  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0581  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.41 
 
 		 271 aa  69.3  0.00000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.948649  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0476  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.72 
 
 		 272 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3184  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.18 
 
 		 272 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000288321  normal  0.0381756 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1337  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.18 
 
 		 272 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00148395  hitchhiker  0.00000622504 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0829  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.28 
 
 		 273 aa  69.3  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.814705  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3041  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.18 
 
 		 272 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000943261  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3026  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.18 
 
 		 272 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000130483  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0929  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.39 
 
 		 273 aa  68.2  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3816  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.23 
 
 		 270 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.495016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2656  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.82 
 
 		 270 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0469003 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0139  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.51 
 
 		 273 aa  66.6  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280777 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0831  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.91 
 
 		 273 aa  67  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3719  pyrroline-5-carboxylate reductase  21.19 
 
 		 273 aa  66.2  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2647  pyrroline-5-carboxylate reductase  21.48 
 
 		 266 aa  66.2  0.0000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0990  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.72 
 
 		 279 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2969  pyrroline-5-carboxylate reductase  21.48 
 
 		 266 aa  65.9  0.0000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4160  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.75 
 
 		 279 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4045  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.75 
 
 		 279 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4359  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.75 
 
 		 279 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3093  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.34 
 
 		 273 aa  65.5  0.0000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0431736  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0546  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.69 
 
 		 275 aa  65.5  0.0000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0397  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.14 
 
 		 270 aa  65.1  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1287  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.57 
 
 		 270 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0698  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.41 
 
 		 270 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.362648  normal  0.291858 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0246  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.41 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0759  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.9 
 
 		 273 aa  64.7  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0730  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.41 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.370104  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4246  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.46 
 
 		 279 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4207  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.46 
 
 		 279 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3883  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.75 
 
 		 279 aa  63.5  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2273  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.02 
 
 		 285 aa  63.5  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.642771  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0340  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.05 
 
 		 275 aa  63.5  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4031  pyrroline-5-carboxylate reductase  22.88 
 
 		 273 aa  63.9  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394027 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3608  pyrroline-5-carboxylate reductase  22.1 
 
 		 273 aa  63.2  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3969  pyrroline-5-carboxylate reductase  22.5 
 
 		 279 aa  62.8  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1755  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.83 
 
 		 270 aa  62.8  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3383  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.8 
 
 		 267 aa  62.8  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2508  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.44 
 
 		 274 aa  62.4  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03070  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.92 
 
 		 272 aa  62.4  0.000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0995956  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1535  pyrroline-5-carboxylate reductase  22.87 
 
 		 274 aa  62.4  0.000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0542  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.05 
 
 		 272 aa  62.4  0.000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0647728  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4270  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.05 
 
 		 279 aa  62  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0774  pyrroline-5-carboxylate reductase  22.59 
 
 		 272 aa  62  0.000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.222339  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5320  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.97 
 
 		 272 aa  62  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0863  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.17 
 
 		 267 aa  60.8  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1084  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.7 
 
 		 272 aa  60.8  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000115496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3982  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.81 
 
 		 271 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.401857 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2920  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.28 
 
 		 275 aa  60.8  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.495585  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4472  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.13 
 
 		 268 aa  61.2  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.432942  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3891  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.05 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2518  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.1 
 
 		 271 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.554672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1136  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.42 
 
 		 272 aa  60.1  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0273851  normal  0.368215 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01991  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.51 
 
 		 286 aa  60.1  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0946  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.08 
 
 		 276 aa  60.1  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0303  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.81 
 
 		 269 aa  59.7  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3451  pyrroline-5-carboxylate reductase  22.1 
 
 		 273 aa  58.9  0.00000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00381464  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2410  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.75 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0327  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.75 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1188  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.75 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2597  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.75 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.483806  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3347  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.75 
 
 		 270 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3300  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.75 
 
 		 270 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.249402  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3334  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.75 
 
 		 270 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002455  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.88 
 
 		 272 aa  58.5  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3222  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.81 
 
 		 269 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2215  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.84 
 
 		 274 aa  58.2  0.0000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000657284  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2920  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.64 
 
 		 289 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.935383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0454  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.81 
 
 		 269 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0413  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.81 
 
 		 269 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2111  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.24 
 
 		 269 aa  58.2  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.778537  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0460  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.81 
 
 		 269 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00337  hypothetical protein  24.81 
 
 		 269 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0416  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.81 
 
 		 269 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3246  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.81 
 
 		 269 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0855673 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>