223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4127 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4127  pyrroline-5-carboxylate reductase  100 
 
 		 258 aa  512  1e-144  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4835  pyrroline-5-carboxylate reductase  59.45 
 
 		 261 aa  305  4.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0350204 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4785  pyrroline-5-carboxylate reductase  56.86 
 
 		 260 aa  292  4e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0921378 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1422  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.19 
 
 		 264 aa  186  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00291687  normal  0.134961 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1041  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.31 
 
 		 259 aa  177  2e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.032518  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6863  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.46 
 
 		 263 aa  156  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00150835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49658  predicted protein  29.7 
 
 		 339 aa  116  3e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2969  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.02 
 
 		 266 aa  86.7  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2647  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.02 
 
 		 266 aa  87  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2416  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.15 
 
 		 272 aa  70.1  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3719  pyrroline-5-carboxylate reductase  22.52 
 
 		 273 aa  70.1  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2417  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.02 
 
 		 271 aa  69.7  0.00000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1084  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.12 
 
 		 272 aa  69.3  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000115496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1337  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.71 
 
 		 272 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00148395  hitchhiker  0.00000622504 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3041  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.71 
 
 		 272 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000943261  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3184  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.71 
 
 		 272 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000288321  normal  0.0381756 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3055  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.92 
 
 		 274 aa  67.8  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.145614  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0535  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.43 
 
 		 277 aa  67.4  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3026  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.71 
 
 		 272 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000130483  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5145  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.14 
 
 		 272 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4968  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.52 
 
 		 272 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5095  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.52 
 
 		 272 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05150  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.39 
 
 		 273 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0546  pyrroline-5-carboxylate reductase  21.67 
 
 		 275 aa  65.5  0.0000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3093  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.28 
 
 		 273 aa  65.1  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0431736  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3354  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.57 
 
 		 272 aa  63.9  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1287  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.16 
 
 		 270 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1192  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.81 
 
 		 272 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000775485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1193  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.81 
 
 		 272 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0154607  normal  0.507121 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002455  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.4 
 
 		 272 aa  64.7  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4045  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.36 
 
 		 279 aa  63.9  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4359  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.36 
 
 		 279 aa  63.9  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01991  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.1 
 
 		 286 aa  63.5  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1263  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.43 
 
 		 272 aa  63.9  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00228679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2833  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.09 
 
 		 278 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0493  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.2 
 
 		 273 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4160  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.36 
 
 		 279 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5320  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.51 
 
 		 272 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2518  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.36 
 
 		 271 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.554672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0476  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.02 
 
 		 272 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3969  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.42 
 
 		 279 aa  62.8  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2080  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.66 
 
 		 263 aa  62.8  0.000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5047  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.29 
 
 		 272 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.518044  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0646  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.06 
 
 		 270 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3883  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.4 
 
 		 279 aa  62  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2995  pyrroline-5-carboxylate reductase  22.39 
 
 		 272 aa  62  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0808412  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0397  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.52 
 
 		 270 aa  62  0.000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4151  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.71 
 
 		 273 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2688  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.48 
 
 		 272 aa  61.6  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.452831  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0946  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.73 
 
 		 276 aa  62  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0370  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.08 
 
 		 272 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1535  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.81 
 
 		 274 aa  60.5  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3891  pyrroline-5-carboxylate reductase  22.55 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0012  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.3 
 
 		 272 aa  60.1  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0620  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.67 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2791  pyrroline-5-carboxylate reductase  22.01 
 
 		 272 aa  60.5  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3816  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.8 
 
 		 270 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.495016  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2410  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.83 
 
 		 270 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0327  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.83 
 
 		 270 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1188  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.83 
 
 		 270 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2597  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.83 
 
 		 270 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.483806  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3151  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.22 
 
 		 265 aa  59.3  0.00000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.232227  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3146  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.45 
 
 		 277 aa  58.9  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.363144 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0542  pyrroline-5-carboxylate reductase  22.22 
 
 		 272 aa  58.9  0.00000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0647728  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0990  pyrroline-5-carboxylate reductase  25 
 
 		 279 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3347  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.83 
 
 		 270 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3300  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.83 
 
 		 270 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.249402  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3334  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.83 
 
 		 270 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2273  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.57 
 
 		 285 aa  58.2  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.642771  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2861  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.33 
 
 		 272 aa  58.5  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0351901  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4246  pyrroline-5-carboxylate reductase  25 
 
 		 279 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0459  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.19 
 
 		 263 aa  58.2  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000279105  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3029  pyrroline-5-carboxylate reductase  21.76 
 
 		 272 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0010709  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1870  pyrroline-5-carboxylate reductase  22.91 
 
 		 260 aa  57.8  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.829834  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2921  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.57 
 
 		 276 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4270  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.37 
 
 		 279 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1331  pyrroline-5-carboxylate reductase  21.67 
 
 		 272 aa  57.4  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00987807 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3143  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.57 
 
 		 276 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0761  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.89 
 
 		 292 aa  57.4  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2250  pyrroline-5-carboxylate reductase  21.62 
 
 		 272 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00152908  normal  0.0119667 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4207  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.31 
 
 		 279 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2783  pyrroline-5-carboxylate reductase  22.01 
 
 		 272 aa  57  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2899  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.94 
 
 		 272 aa  57  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00203272  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2995  pyrroline-5-carboxylate reductase  22.01 
 
 		 272 aa  57  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00170119  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3031  pyrroline-5-carboxylate reductase  21.62 
 
 		 272 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.029709  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3564  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.53 
 
 		 271 aa  56.2  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000486618  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1136  pyrroline-5-carboxylate reductase  21.67 
 
 		 272 aa  56.2  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0273851  normal  0.368215 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0759  pyrroline-5-carboxylate reductase  22.93 
 
 		 273 aa  55.8  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1412  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.57 
 
 		 275 aa  55.8  0.0000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00064101  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1837  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.53 
 
 		 285 aa  55.8  0.0000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000989753  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2732  pyrroline-5-carboxylate reductase  21.62 
 
 		 272 aa  55.8  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00058851  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2713  pyrroline-5-carboxylate reductase  21.24 
 
 		 272 aa  55.5  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2656  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.5 
 
 		 270 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0469003 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0390  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.87 
 
 		 272 aa  55.5  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0340  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.9 
 
 		 275 aa  55.5  0.0000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2189  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.86 
 
 		 274 aa  54.7  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.334092  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0647  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.89 
 
 		 267 aa  54.7  0.000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.381317 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1387  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.57 
 
 		 276 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3608  pyrroline-5-carboxylate reductase  20.38 
 
 		 273 aa  53.9  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0246  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.16 
 
 		 270 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>