181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1422 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1422  pyrroline-5-carboxylate reductase  100 
 
 
264 aa  541  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00291687  normal  0.134961 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6863  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.14 
 
 
263 aa  208  6e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00150835  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4127  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.19 
 
 
258 aa  186  3e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4835  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.09 
 
 
261 aa  185  7e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0350204 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4785  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.47 
 
 
260 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0921378 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1041  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.72 
 
 
259 aa  145  9e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.032518  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49658  predicted protein  33.59 
 
 
339 aa  127  1.0000000000000001e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1294  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.38 
 
 
266 aa  68.2  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0466034  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0012  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.3 
 
 
272 aa  67.4  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2833  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.6 
 
 
278 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4246  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.43 
 
 
279 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2357  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.96 
 
 
266 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2417  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.92 
 
 
271 aa  63.9  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1870  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.48 
 
 
260 aa  63.5  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.829834  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3891  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.89 
 
 
279 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3969  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.43 
 
 
279 aa  63.2  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3883  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.53 
 
 
279 aa  62.8  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4160  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.53 
 
 
279 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4045  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.53 
 
 
279 aa  61.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0990  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.07 
 
 
279 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4359  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.53 
 
 
279 aa  61.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3093  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.32 
 
 
273 aa  61.6  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0431736  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1193  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.28 
 
 
272 aa  61.6  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0154607  normal  0.507121 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4031  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.69 
 
 
273 aa  61.6  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00394027 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4207  pyrroline-5-carboxylate reductase  25 
 
 
279 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2273  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.46 
 
 
285 aa  60.8  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.642771  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0165  pyrroline-5-carboxylate reductase  22.9 
 
 
277 aa  61.2  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000543414  hitchhiker  0.0000203969 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1263  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.91 
 
 
272 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00228679  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1680  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  28.46 
 
 
289 aa  60.1  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.185194  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1192  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.91 
 
 
272 aa  60.5  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000775485  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3451  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.79 
 
 
273 aa  60.1  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00381464  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0150  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  28.85 
 
 
266 aa  59.7  0.00000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000260384  normal  0.627515 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03579  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.45 
 
 
272 aa  59.3  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3354  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.4 
 
 
272 aa  59.3  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5047  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.63 
 
 
272 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.518044  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0542  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.2 
 
 
272 aa  58.9  0.00000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0647728  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2788  pyrroline-5-carboxylate reductase  22.73 
 
 
267 aa  58.9  0.00000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.510272  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4968  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.33 
 
 
272 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0129  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.69 
 
 
280 aa  58.9  0.00000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000153189  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0476  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.25 
 
 
272 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0177  pyrroline-5-carboxylate reductase  20.77 
 
 
277 aa  58.5  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0311023  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4270  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.29 
 
 
279 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0193  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.07 
 
 
267 aa  57.4  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5095  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.33 
 
 
272 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1065  pyrroline-5-carboxylate reductase  22.01 
 
 
271 aa  57.4  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.378355  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3719  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.93 
 
 
273 aa  57.4  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0351  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.86 
 
 
280 aa  57.8  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3041  pyrroline-5-carboxylate reductase  25 
 
 
274 aa  57.8  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.439498  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0979  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.66 
 
 
270 aa  57.4  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000628805  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0493  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.27 
 
 
273 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05150  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.91 
 
 
273 aa  57  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59347  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3608  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.3 
 
 
273 aa  57  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0160  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.72 
 
 
267 aa  56.2  0.0000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5145  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.95 
 
 
272 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1535  pyrroline-5-carboxylate reductase  25 
 
 
274 aa  55.8  0.0000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0759  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.38 
 
 
273 aa  55.5  0.0000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2189  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.4 
 
 
274 aa  55.5  0.0000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.334092  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002455  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.82 
 
 
272 aa  55.1  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2416  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.05 
 
 
272 aa  55.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2215  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.4 
 
 
274 aa  54.7  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000657284  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1439  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.84 
 
 
262 aa  54.3  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2688  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.31 
 
 
272 aa  53.5  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.452831  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2920  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.49 
 
 
275 aa  53.9  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.495585  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1755  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.02 
 
 
270 aa  53.9  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0370  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.23 
 
 
272 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0946  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.8 
 
 
276 aa  53.5  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0829  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.98 
 
 
273 aa  53.1  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.814705  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2111  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.42 
 
 
269 aa  52.8  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.778537  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2120  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.97 
 
 
266 aa  52.8  0.000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000342468  normal  0.441838 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0546  pyrroline-5-carboxylate reductase  21.37 
 
 
275 aa  52  0.000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0548  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.09 
 
 
269 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0422  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.23 
 
 
269 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0483  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.23 
 
 
269 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0173  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.03 
 
 
256 aa  52  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0563052  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0441  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.23 
 
 
269 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4718  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.77 
 
 
272 aa  51.6  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.533737  normal  0.734088 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0428  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.23 
 
 
269 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1696  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.42 
 
 
272 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1474  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.69 
 
 
274 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3055  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.41 
 
 
274 aa  51.2  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.145614  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0423  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.23 
 
 
269 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.244975 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_181  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.69 
 
 
267 aa  51.6  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.136848  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1337  pyrroline-5-carboxylate reductase  22.26 
 
 
272 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00148395  hitchhiker  0.00000622504 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0831  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.59 
 
 
273 aa  51.2  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3184  pyrroline-5-carboxylate reductase  22.26 
 
 
272 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000288321  normal  0.0381756 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0581  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.27 
 
 
271 aa  51.2  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.948649  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1715  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.37 
 
 
271 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000826167  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2914  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.7 
 
 
265 aa  51.2  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2080  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.93 
 
 
263 aa  51.2  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0863  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.9 
 
 
267 aa  50.8  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0535  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.91 
 
 
277 aa  50.8  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3026  pyrroline-5-carboxylate reductase  22.26 
 
 
272 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000130483  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1136  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.39 
 
 
272 aa  51.2  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0273851  normal  0.368215 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0857  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.81 
 
 
269 aa  50.8  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.236011 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3041  pyrroline-5-carboxylate reductase  22.26 
 
 
272 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000943261  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3664  pyrroline-5-carboxylate reductase  20.07 
 
 
273 aa  50.4  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.078533  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0139  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.2 
 
 
273 aa  50.4  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00280777 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0337  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.89 
 
 
282 aa  50.4  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000202087  hitchhiker  0.00000000614659 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1378  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.69 
 
 
274 aa  50.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2306  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.69 
 
 
266 aa  49.7  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000136167  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>