88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_49658 on replicon NC_011691
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011691  PHATRDRAFT_49658  predicted protein  100 
 
 		 339 aa  700    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1422  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.59 
 
 		 264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00291687  normal  0.134961 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4835  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.34 
 
 		 261 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0350204 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6863  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.25 
 
 		 263 aa  124  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00150835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4127  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.7 
 
 		 258 aa  116  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4785  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.68 
 
 		 260 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0921378 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1041  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.39 
 
 		 259 aa  90.1  5e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.032518  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0303  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.74 
 
 		 269 aa  72.4  0.000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3222  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.74 
 
 		 269 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0454  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.74 
 
 		 269 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0413  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.74 
 
 		 269 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3246  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.74 
 
 		 269 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0855673 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0416  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.74 
 
 		 269 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0460  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.74 
 
 		 269 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00337  hypothetical protein  27.74 
 
 		 269 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00333  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.74 
 
 		 269 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0428  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.71 
 
 		 269 aa  66.6  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0483  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.71 
 
 		 269 aa  66.6  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0441  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.71 
 
 		 269 aa  66.6  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0422  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.71 
 
 		 269 aa  66.6  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0423  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.71 
 
 		 269 aa  66.6  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.244975 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0857  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.67 
 
 		 269 aa  65.9  0.0000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.236011 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1084  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.01 
 
 		 272 aa  61.6  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000115496  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0459  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.63 
 
 		 263 aa  59.7  0.00000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000279105  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2889  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.17 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.792584  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0955  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.81 
 
 		 268 aa  55.1  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00507177  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2833  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.24 
 
 		 278 aa  54.7  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2647  pyrroline-5-carboxylate reductase  21.84 
 
 		 266 aa  54.3  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2969  pyrroline-5-carboxylate reductase  21.84 
 
 		 266 aa  54.3  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0197  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.33 
 
 		 271 aa  52  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0535  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.09 
 
 		 277 aa  52  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0480  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.81 
 
 		 272 aa  52.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.904578 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3151  pyrroline-5-carboxylate reductase  22.81 
 
 		 265 aa  52.4  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.232227  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1570  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.22 
 
 		 281 aa  51.2  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2417  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.66 
 
 		 271 aa  51.2  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2995  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.23 
 
 		 272 aa  50.8  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00170119  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2783  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.23 
 
 		 272 aa  50.8  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3891  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.33 
 
 		 279 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_13156  predicted protein  25.1 
 
 		 276 aa  50.8  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.37833  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2835  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.48 
 
 		 279 aa  50.4  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.159244  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1615  pyrroline-5-carboxylate reductase  21.64 
 
 		 264 aa  50.4  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133748  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2732  pyrroline-5-carboxylate reductase  22.83 
 
 		 272 aa  49.7  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00058851  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5103  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.65 
 
 		 267 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2273  pyrroline-5-carboxylate reductase  22.54 
 
 		 285 aa  48.9  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.642771  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0197  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.2 
 
 		 267 aa  49.3  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3883  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.95 
 
 		 279 aa  48.5  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0647  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.09 
 
 		 267 aa  48.9  0.0001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.381317 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0999  late competence protein ComER  26.98 
 
 		 272 aa  48.9  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1755  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.43 
 
 		 270 aa  48.5  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3029  pyrroline-5-carboxylate reductase  21.2 
 
 		 272 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0010709  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2713  pyrroline-5-carboxylate reductase  21.2 
 
 		 272 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23950  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.01 
 
 		 275 aa  48.1  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.264409  normal  0.813225 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0218  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.05 
 
 		 274 aa  48.1  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4718  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.36 
 
 		 272 aa  47.4  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.533737  normal  0.734088 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2788  pyrroline-5-carboxylate reductase  21.35 
 
 		 267 aa  47.4  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.510272  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0182  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.99 
 
 		 267 aa  47.4  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0217  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.65 
 
 		 267 aa  47  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2111  pyrroline-5-carboxylate reductase  22.01 
 
 		 269 aa  47  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.778537  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0842  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.67 
 
 		 258 aa  46.6  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3031  pyrroline-5-carboxylate reductase  21.2 
 
 		 272 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.029709  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2995  pyrroline-5-carboxylate reductase  20.4 
 
 		 272 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0808412  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4207  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.95 
 
 		 279 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2914  pyrroline-5-carboxylate reductase  20.38 
 
 		 265 aa  46.2  0.0009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0657  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.59 
 
 		 266 aa  46.2  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.620415  normal  0.113485 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1535  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.07 
 
 		 274 aa  45.8  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4160  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.57 
 
 		 279 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4359  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.57 
 
 		 279 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3969  pyrroline-5-carboxylate reductase  22.52 
 
 		 279 aa  45.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4204  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.47 
 
 		 272 aa  44.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00182559  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4045  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.57 
 
 		 279 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0351  pyrroline-5-carboxylate reductase  22.42 
 
 		 280 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4246  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.75 
 
 		 279 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1839  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.88 
 
 		 282 aa  44.3  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2850  pyrroline-5-carboxylate reductase  19.6 
 
 		 272 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0198  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.61 
 
 		 245 aa  43.9  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2250  pyrroline-5-carboxylate reductase  20 
 
 		 272 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00152908  normal  0.0119667 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002455  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.91 
 
 		 272 aa  43.5  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0990  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.37 
 
 		 279 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4270  pyrroline-5-carboxylate reductase  22.9 
 
 		 279 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25379  predicted protein  25 
 
 		 289 aa  43.1  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1475  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.91 
 
 		 274 aa  42.7  0.008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2791  pyrroline-5-carboxylate reductase  19.92 
 
 		 272 aa  42.7  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0546  pyrroline-5-carboxylate reductase  22.27 
 
 		 275 aa  42.7  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3055  pyrroline-5-carboxylate reductase  22.74 
 
 		 274 aa  42.7  0.008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.145614  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2080  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.82 
 
 		 263 aa  42.7  0.008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0672  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.86 
 
 		 271 aa  42.7  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000211861  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0968  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.14 
 
 		 271 aa  42.4  0.01  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5524  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  26.53 
 
 		 328 aa  42.7  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0122129  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>