154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5524 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5524  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  100 
 
 		 328 aa  620  1e-177  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0122129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8008  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  73.51 
 
 		 303 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3054  late competence protein ComER  24.11 
 
 		 283 aa  86.7  5e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.126852  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0740  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.42 
 
 		 266 aa  83.6  0.000000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4409  late competence protein ComER  26.24 
 
 		 275 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4225  late competence protein ComER  25.23 
 
 		 275 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.755037  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4350  late competence protein ComER  25.23 
 
 		 275 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000932909 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4461  late competence protein ComER  24.89 
 
 		 275 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000265732  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4179  late competence protein ComER  24.23 
 
 		 275 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.427252  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0789  late competence protein ComER  24.23 
 
 		 275 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0125118  hitchhiker  0.000000168646 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4448  late competence protein ComER  24.23 
 
 		 275 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0500501  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0999  late competence protein ComER  28.16 
 
 		 272 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2080  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.06 
 
 		 263 aa  75.1  0.000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4073  late competence protein ComER  24.06 
 
 		 265 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2452  late competence protein ComER  25.31 
 
 		 273 aa  72  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00347201  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0677  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.12 
 
 		 260 aa  70.1  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4063  late competence protein ComER  24.06 
 
 		 265 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00294057  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4554  late competence protein ComER  24.06 
 
 		 265 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00155928  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5103  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.35 
 
 		 267 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02750  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.55 
 
 		 270 aa  67.8  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0898  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.2 
 
 		 270 aa  65.1  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0198  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.95 
 
 		 245 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1570  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.78 
 
 		 281 aa  65.1  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6140  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.85 
 
 		 297 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.179161  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0217  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.35 
 
 		 267 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0182  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.24 
 
 		 267 aa  63.9  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6743  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.28 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0185  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.95 
 
 		 267 aa  63.2  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0240  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.35 
 
 		 269 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2250  pyrroline-5-carboxylate reductase  20.51 
 
 		 272 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00152908  normal  0.0119667 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0188  pyrroline-5-carboxylate reductase  22.96 
 
 		 267 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0150  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  27.09 
 
 		 266 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000260384  normal  0.627515 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0351  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.29 
 
 		 280 aa  61.2  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0937  pyrroline-5-carboxylate reductase  22.48 
 
 		 268 aa  61.2  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2995  pyrroline-5-carboxylate reductase  20.51 
 
 		 272 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0808412  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0223  pyrroline-5-carboxylate reductase  22.45 
 
 		 253 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2732  pyrroline-5-carboxylate reductase  18.38 
 
 		 272 aa  59.7  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00058851  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1294  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.17 
 
 		 266 aa  59.7  0.00000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0466034  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0217  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.67 
 
 		 253 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0197  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.02 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2783  pyrroline-5-carboxylate reductase  18.75 
 
 		 272 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2995  pyrroline-5-carboxylate reductase  18.75 
 
 		 272 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00170119  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2120  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.72 
 
 		 266 aa  58.9  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000342468  normal  0.441838 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0212  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.17 
 
 		 276 aa  58.9  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3029  pyrroline-5-carboxylate reductase  19.56 
 
 		 272 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0010709  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2899  pyrroline-5-carboxylate reductase  17.41 
 
 		 272 aa  57.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00203272  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2713  pyrroline-5-carboxylate reductase  19.78 
 
 		 272 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1478  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.81 
 
 		 280 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0974  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.33 
 
 		 278 aa  57.4  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.917408 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0247  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.03 
 
 		 276 aa  57  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0642346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0546  pyrroline-5-carboxylate reductase  22.99 
 
 		 275 aa  57  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3031  pyrroline-5-carboxylate reductase  18.75 
 
 		 272 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.029709  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4908  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.09 
 
 		 275 aa  56.6  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0661401  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2757  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.65 
 
 		 274 aa  57  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.447369  decreased coverage  0.0000025495 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0946  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.01 
 
 		 261 aa  56.2  0.0000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0408643  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2833  pyrroline-5-carboxylate reductase  21.32 
 
 		 278 aa  55.1  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2791  pyrroline-5-carboxylate reductase  20.65 
 
 		 272 aa  55.8  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0249  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.69 
 
 		 264 aa  55.5  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.236328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2357  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.02 
 
 		 266 aa  55.8  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2273  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.02 
 
 		 285 aa  53.9  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.642771  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0533  Pyrroline-5-carboxylate reductase  26.83 
 
 		 264 aa  53.9  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49658  predicted protein  26.61 
 
 		 339 aa  53.5  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24470  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.15 
 
 		 279 aa  53.5  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2920  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.52 
 
 		 289 aa  53.1  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.935383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9249  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.61 
 
 		 300 aa  53.1  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0562195  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4590  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.36 
 
 		 276 aa  52.8  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0218  pyrroline-5-carboxylate reductase  22.31 
 
 		 274 aa  52.8  0.000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2684  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.46 
 
 		 274 aa  52.4  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0480  pyrroline-5-carboxylate reductase  22.64 
 
 		 272 aa  52.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.904578 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3146  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.2 
 
 		 277 aa  52  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.363144 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2508  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.9 
 
 		 274 aa  52  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2306  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.64 
 
 		 266 aa  52  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000136167  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2889  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.8 
 
 		 263 aa  52  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.792584  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2921  pyrroline-5-carboxylate reductase  17.56 
 
 		 276 aa  51.2  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3143  pyrroline-5-carboxylate reductase  17.56 
 
 		 276 aa  51.2  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2058  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.34 
 
 		 264 aa  51.6  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.736428  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2850  pyrroline-5-carboxylate reductase  18.68 
 
 		 272 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0428  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.85 
 
 		 269 aa  50.4  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0483  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.85 
 
 		 269 aa  50.4  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0441  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.85 
 
 		 269 aa  50.4  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0422  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.85 
 
 		 269 aa  50.4  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0423  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.85 
 
 		 269 aa  50.4  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.244975 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0340  pyrroline-5-carboxylate reductase  22.4 
 
 		 255 aa  50.1  0.00005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1560  pyrroline-5-carboxylate reductase  20.34 
 
 		 271 aa  50.1  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1591  pyrroline-5-carboxylate reductase  20.34 
 
 		 271 aa  50.1  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.542634  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0660  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.62 
 
 		 271 aa  49.7  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1412  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.24 
 
 		 275 aa  49.7  0.00007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00064101  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_181  pyrroline-5-carboxylate reductase  22.13 
 
 		 267 aa  49.3  0.00008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.136848  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3778  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.84 
 
 		 264 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00156911 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1304  pyrroline-5-carboxylate reductase  20.69 
 
 		 272 aa  49.7  0.00008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18050  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.77 
 
 		 276 aa  49.3  0.00008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1017  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.2 
 
 		 282 aa  49.3  0.00009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3513  pyrroline-5-carboxylate reductase  19.44 
 
 		 267 aa  48.5  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3521  Pyrroline-5-carboxylate reductase  32.65 
 
 		 243 aa  48.9  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0358  pyrroline-5-carboxylate reductase  21.86 
 
 		 255 aa  48.9  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0193  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.86 
 
 		 267 aa  48.1  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2708  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.48 
 
 		 264 aa  47.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.702325  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0045  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.5 
 
 		 286 aa  48.5  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.318936 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2466  pyrroline-5-carboxylate reductase  21.43 
 
 		 266 aa  48.1  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.391449  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1339  pyrroline-5-carboxylate reductase  18.18 
 
 		 260 aa  47.8  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000013369  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>