More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1294 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1294  pyrroline-5-carboxylate reductase  100 
 
 		 266 aa  524  1e-148  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0466034  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2452  late competence protein ComER  27.13 
 
 		 273 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00347201  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0999  late competence protein ComER  28.68 
 
 		 272 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1387  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.92 
 
 		 276 aa  115  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0672  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.36 
 
 		 271 aa  112  7.000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000211861  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0397  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.21 
 
 		 270 aa  112  8.000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01940  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.34 
 
 		 266 aa  112  8.000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2969  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.63 
 
 		 266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2647  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.21 
 
 		 266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0150  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  32.05 
 
 		 266 aa  108  1e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000260384  normal  0.627515 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2901  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.84 
 
 		 270 aa  106  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000081741  unclonable  0.000000152537 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4179  late competence protein ComER  23.64 
 
 		 275 aa  106  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.427252  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3093  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.03 
 
 		 273 aa  105  7e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0431736  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0480  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.71 
 
 		 272 aa  104  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.904578 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_13156  predicted protein  29.69 
 
 		 276 aa  104  2e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.37833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1378  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.12 
 
 		 274 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4448  late competence protein ComER  23.64 
 
 		 275 aa  103  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0500501  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3054  late competence protein ComER  23.17 
 
 		 283 aa  103  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.126852  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0789  late competence protein ComER  23.64 
 
 		 275 aa  103  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0125118  hitchhiker  0.000000168646 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2828  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.51 
 
 		 270 aa  103  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.137875  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2480  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.54 
 
 		 274 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2058  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.08 
 
 		 264 aa  102  5e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.736428  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3031  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.64 
 
 		 272 aa  102  7e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.029709  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0390  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.08 
 
 		 272 aa  102  7e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1474  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.12 
 
 		 274 aa  102  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2713  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.64 
 
 		 272 aa  102  9e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3029  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.64 
 
 		 272 aa  102  9e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0010709  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4350  late competence protein ComER  22.87 
 
 		 275 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000932909 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1412  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.74 
 
 		 275 aa  101  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00064101  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4409  late competence protein ComER  23.26 
 
 		 275 aa  101  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4225  late competence protein ComER  22.87 
 
 		 275 aa  101  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.755037  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4461  late competence protein ComER  23.26 
 
 		 275 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000265732  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0218  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.71 
 
 		 274 aa  101  1e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2111  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.34 
 
 		 269 aa  100  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.778537  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2995  pyrroline-5-carboxylate reductase  25 
 
 		 272 aa  100  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0808412  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2783  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.23 
 
 		 272 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2023  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.95 
 
 		 270 aa  100  3e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.720475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2995  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.23 
 
 		 272 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00170119  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0974  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.75 
 
 		 278 aa  100  3e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.917408 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0247  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.02 
 
 		 276 aa  100  3e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0642346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1017  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.79 
 
 		 282 aa  99.4  5e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2791  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.82 
 
 		 272 aa  99.4  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0979  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.8 
 
 		 270 aa  99  8e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000628805  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2732  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.82 
 
 		 272 aa  98.6  9e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00058851  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2250  pyrroline-5-carboxylate reductase  25 
 
 		 272 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00152908  normal  0.0119667 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0212  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.5 
 
 		 276 aa  97.4  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1154  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.73 
 
 		 272 aa  97.4  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1615  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.57 
 
 		 264 aa  97.4  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133748  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2080  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.42 
 
 		 263 aa  97.4  2e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1304  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.46 
 
 		 272 aa  96.7  4e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2914  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.84 
 
 		 265 aa  95.9  6e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0249  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.5 
 
 		 264 aa  95.5  8e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.236328  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2850  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.41 
 
 		 272 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0649  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  33.7 
 
 		 275 aa  94.7  1e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0548  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.73 
 
 		 269 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0351  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.5 
 
 		 280 aa  94.4  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2708  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.18 
 
 		 264 aa  93.6  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.702325  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0955  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.63 
 
 		 268 aa  93.6  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00507177  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5003  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.3 
 
 		 264 aa  93.2  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.102233  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4421  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.95 
 
 		 271 aa  92.4  7e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000164624  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2788  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.92 
 
 		 267 aa  92.4  7e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.510272  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2273  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.66 
 
 		 285 aa  92  9e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.642771  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2120  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.92 
 
 		 266 aa  92  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000342468  normal  0.441838 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4063  late competence protein ComER  21.6 
 
 		 265 aa  91.7  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00294057  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4073  late competence protein ComER  21.6 
 
 		 265 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4554  late competence protein ComER  21.6 
 
 		 265 aa  91.7  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00155928  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16300  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.98 
 
 		 263 aa  91.7  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000034622  hitchhiker  0.000154585 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2500  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.82 
 
 		 267 aa  91.7  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000695337  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4908  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.84 
 
 		 275 aa  91.7  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0661401  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3276  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.24 
 
 		 274 aa  90.9  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215376  hitchhiker  0.00496059 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0968  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.97 
 
 		 271 aa  91.3  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0045  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.04 
 
 		 286 aa  90.5  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.318936 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03931  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  29.5 
 
 		 276 aa  90.1  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0481  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.93 
 
 		 267 aa  90.5  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.790225  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1755  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.87 
 
 		 270 aa  90.5  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0533  Pyrroline-5-carboxylate reductase  29.79 
 
 		 264 aa  90.1  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3969  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.13 
 
 		 279 aa  89.7  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0899  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.25 
 
 		 270 aa  89.7  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000196708 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1478  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.35 
 
 		 280 aa  89.7  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0740  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  28.33 
 
 		 266 aa  89.4  6e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2899  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.59 
 
 		 272 aa  89.4  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00203272  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0459  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.67 
 
 		 263 aa  89  7e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000279105  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1696  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.95 
 
 		 272 aa  89  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4459  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.74 
 
 		 267 aa  87.8  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0535  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.9 
 
 		 277 aa  88.6  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1715  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.81 
 
 		 271 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000826167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2466  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.73 
 
 		 266 aa  88.2  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.391449  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2921  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.19 
 
 		 276 aa  87.8  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1616  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.41 
 
 		 314 aa  87.4  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0170317 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3143  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.19 
 
 		 276 aa  87.8  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1439  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.31 
 
 		 262 aa  87.4  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4246  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.91 
 
 		 279 aa  86.7  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21461  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  30.83 
 
 		 280 aa  87  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3164  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.15 
 
 		 260 aa  87  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1084  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.4 
 
 		 272 aa  86.7  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000115496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0151  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.59 
 
 		 269 aa  87  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.779735  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1570  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.97 
 
 		 281 aa  86.7  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1680  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  27.76 
 
 		 289 aa  86.7  4e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.185194  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0860  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.98 
 
 		 264 aa  86.7  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.012848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4270  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.32 
 
 		 279 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>