More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_4204 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_4204  pyrroline-5-carboxylate reductase  100 
 
 
272 aa  547  1e-155  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00182559  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0657  pyrroline-5-carboxylate reductase  50.59 
 
 
266 aa  252  5.000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.620415  normal  0.113485 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0842  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.06 
 
 
258 aa  235  6e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1378  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.59 
 
 
274 aa  151  1e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2480  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.18 
 
 
274 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1474  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.59 
 
 
274 aa  149  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1387  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.6 
 
 
276 aa  149  6e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1478  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.09 
 
 
280 aa  142  7e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1017  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.32 
 
 
282 aa  139  4.999999999999999e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4459  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.99 
 
 
267 aa  136  4e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2111  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.73 
 
 
269 aa  136  5e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.778537  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1570  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.43 
 
 
281 aa  135  8e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0218  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.52 
 
 
274 aa  135  8e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0480  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.5 
 
 
272 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.904578 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4718  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.06 
 
 
272 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.533737  normal  0.734088 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0979  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.46 
 
 
270 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000628805  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1439  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.2 
 
 
262 aa  133  3e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2835  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.22 
 
 
279 aa  132  5e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.159244  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0247  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.69 
 
 
276 aa  132  5e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0642346  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3383  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.21 
 
 
267 aa  132  6e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2581  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.1 
 
 
272 aa  132  6e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0897618  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0863  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.21 
 
 
267 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1615  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.46 
 
 
264 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133748  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4421  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.46 
 
 
271 aa  130  2.0000000000000002e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000164624  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0533  Pyrroline-5-carboxylate reductase  33.88 
 
 
264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0249  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.41 
 
 
264 aa  130  3e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.236328  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2969  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.62 
 
 
266 aa  129  6e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0672  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.6 
 
 
271 aa  128  9.000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000211861  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3055  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.08 
 
 
274 aa  128  9.000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.145614  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2647  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.23 
 
 
266 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2306  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.52 
 
 
266 aa  125  7e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000136167  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1472  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.98 
 
 
257 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000561637  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1715  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.91 
 
 
271 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000826167  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1696  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.38 
 
 
272 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0397  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.12 
 
 
270 aa  123  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0898  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.06 
 
 
270 aa  122  5e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0968  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.81 
 
 
271 aa  122  6e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0150  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  31.62 
 
 
266 aa  122  6e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000260384  normal  0.627515 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4207  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.81 
 
 
279 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4590  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.33 
 
 
276 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2120  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.18 
 
 
266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000342468  normal  0.441838 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01940  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.56 
 
 
266 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2466  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.16 
 
 
266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.391449  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0990  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.31 
 
 
279 aa  120  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2901  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.34 
 
 
270 aa  120  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000081741  unclonable  0.000000152537 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02750  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.98 
 
 
270 aa  120  3e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2357  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.23 
 
 
266 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4246  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.88 
 
 
279 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2833  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.89 
 
 
278 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4270  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.43 
 
 
279 aa  119  7e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0535  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.08 
 
 
277 aa  119  7e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0197  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.94 
 
 
271 aa  119  7e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6140  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.16 
 
 
297 aa  119  7.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.179161  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1168  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.71 
 
 
281 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000092936  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3883  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.41 
 
 
279 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0476  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.71 
 
 
267 aa  118  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0351  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.37 
 
 
280 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2828  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.14 
 
 
270 aa  118  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.137875  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3969  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.52 
 
 
279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3891  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.41 
 
 
279 aa  117  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2995  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.67 
 
 
272 aa  116  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0808412  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6743  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.38 
 
 
270 aa  116  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1990  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.89 
 
 
268 aa  116  3.9999999999999997e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.307416  normal  0.0845217 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0977  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.95 
 
 
271 aa  115  6e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0669061 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3266  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.69 
 
 
272 aa  115  6e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.674816  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1084  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.65 
 
 
272 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000115496  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2416  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.33 
 
 
272 aa  115  8.999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2058  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.38 
 
 
264 aa  115  8.999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.736428  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2273  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.77 
 
 
285 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.642771  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1755  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.68 
 
 
270 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4908  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.58 
 
 
275 aa  114  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0661401  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0955  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.86 
 
 
268 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00507177  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24470  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.6 
 
 
279 aa  114  1.0000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2921  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.76 
 
 
276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2850  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.2 
 
 
272 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00740  pyrroline-5-carboxylate reductase, putative  32.86 
 
 
313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2708  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.04 
 
 
264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.702325  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0946  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.13 
 
 
276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3143  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.76 
 
 
276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0782  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.38 
 
 
271 aa  113  3e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2713  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.88 
 
 
272 aa  113  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8353  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.65 
 
 
268 aa  113  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0732  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.38 
 
 
271 aa  113  3e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2899  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.67 
 
 
272 aa  112  6e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00203272  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2250  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.88 
 
 
272 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00152908  normal  0.0119667 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4045  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.65 
 
 
279 aa  112  9e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4160  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.65 
 
 
279 aa  112  9e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4359  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.65 
 
 
279 aa  112  9e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2541  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.58 
 
 
270 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1440  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.12 
 
 
267 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000312208  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2791  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.05 
 
 
272 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0568  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.2 
 
 
281 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000161588  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3496  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.28 
 
 
272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.231373  normal  0.0164716 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0212  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.2 
 
 
276 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0548  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.04 
 
 
269 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0481  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.54 
 
 
267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.790225  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05150  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.52 
 
 
273 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59347  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3031  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.49 
 
 
272 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.029709  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0476  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.67 
 
 
272 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0974  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.95 
 
 
278 aa  109  4.0000000000000004e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.917408 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>