19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0739 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0739  hypothetical protein  100 
 
 
406 aa  837    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5148  hypothetical protein  58 
 
 
364 aa  408  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.978654  normal  0.737903 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1586  hypothetical protein  51.99 
 
 
380 aa  378  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989603  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1594  hypothetical protein  52.52 
 
 
380 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3993  hypothetical protein  39.61 
 
 
341 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3771  hypothetical protein  41.14 
 
 
343 aa  180  4e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0472674  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3991  hypothetical protein  40.13 
 
 
339 aa  157  4e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4762  hypothetical protein  38.16 
 
 
338 aa  152  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.199256  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2429  hypothetical protein  30.79 
 
 
342 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0288  hypothetical protein  29.87 
 
 
349 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4108  hypothetical protein  30.37 
 
 
346 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.15016  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3563  hypothetical protein  31.09 
 
 
353 aa  101  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.297998 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1886  hypothetical protein  26.47 
 
 
340 aa  60.8  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0649803  hitchhiker  0.00264539 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2573  hypothetical protein  24.33 
 
 
341 aa  57.4  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2199  hypothetical protein  26.25 
 
 
352 aa  50.4  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.736056  normal  0.741615 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0100  hypothetical protein  26.14 
 
 
235 aa  50.1  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00486405  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0601  hypothetical protein  23.45 
 
 
342 aa  48.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.755176  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0625  hypothetical protein  26.59 
 
 
351 aa  45.8  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.215143 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4226  hypothetical protein  24.32 
 
 
344 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.544309 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>