16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2429 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2429  hypothetical protein  100 
 
 
342 aa  704    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3563  hypothetical protein  31.87 
 
 
353 aa  172  5e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.297998 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0288  hypothetical protein  30.81 
 
 
349 aa  153  2.9999999999999998e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0739  hypothetical protein  30.79 
 
 
406 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5148  hypothetical protein  29.26 
 
 
364 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.978654  normal  0.737903 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3991  hypothetical protein  30.74 
 
 
339 aa  119  6e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1594  hypothetical protein  30.21 
 
 
380 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1586  hypothetical protein  30.21 
 
 
380 aa  113  6e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989603  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4762  hypothetical protein  29.74 
 
 
338 aa  110  4.0000000000000004e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.199256  normal 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3771  hypothetical protein  27.74 
 
 
343 aa  96.3  7e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0472674  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3993  hypothetical protein  27.12 
 
 
341 aa  90.5  4e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4108  hypothetical protein  25.57 
 
 
346 aa  87.4  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.15016  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0625  hypothetical protein  25 
 
 
351 aa  67  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.215143 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0601  hypothetical protein  23.3 
 
 
342 aa  55.8  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.755176  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2199  hypothetical protein  26.35 
 
 
352 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.736056  normal  0.741615 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2573  hypothetical protein  25.6 
 
 
341 aa  44.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>