12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4108 on replicon NC_009430
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009430  Rsph17025_4108  hypothetical protein  100 
 
 		 346 aa  704    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.15016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3993  hypothetical protein  33.74 
 
 		 341 aa  156  4e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3771  hypothetical protein  33.43 
 
 		 343 aa  154  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0472674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3991  hypothetical protein  34.77 
 
 		 339 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4762  hypothetical protein  34.31 
 
 		 338 aa  138  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.199256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3563  hypothetical protein  30.65 
 
 		 353 aa  113  5e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.297998 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0739  hypothetical protein  30.37 
 
 		 406 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1586  hypothetical protein  30.59 
 
 		 380 aa  96.3  8e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0288  hypothetical protein  27.66 
 
 		 349 aa  92.8  8e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5148  hypothetical protein  31.73 
 
 		 364 aa  91.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.978654  normal  0.737903 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1594  hypothetical protein  30.03 
 
 		 380 aa  89.7  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2429  hypothetical protein  25.57 
 
 		 342 aa  87.4  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>