18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1586 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1586  hypothetical protein  100 
 
 		 380 aa  780    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1594  hypothetical protein  86.84 
 
 		 380 aa  674    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0739  hypothetical protein  51.99 
 
 		 406 aa  378  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5148  hypothetical protein  51.4 
 
 		 364 aa  353  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.978654  normal  0.737903 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3991  hypothetical protein  38.86 
 
 		 339 aa  170  4e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4762  hypothetical protein  40.98 
 
 		 338 aa  159  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.199256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3993  hypothetical protein  37.72 
 
 		 341 aa  157  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3771  hypothetical protein  37.58 
 
 		 343 aa  151  1e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0472674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2429  hypothetical protein  30.21 
 
 		 342 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3563  hypothetical protein  32.36 
 
 		 353 aa  108  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.297998 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0288  hypothetical protein  28.21 
 
 		 349 aa  103  4e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4108  hypothetical protein  30.59 
 
 		 346 aa  96.3  9e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.15016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2199  hypothetical protein  27.6 
 
 		 352 aa  59.7  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.736056  normal  0.741615 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2573  hypothetical protein  23.69 
 
 		 341 aa  56.2  0.0000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0100  hypothetical protein  31.36 
 
 		 235 aa  52.4  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00486405  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4226  hypothetical protein  25.93 
 
 		 344 aa  50.8  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.544309 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1886  hypothetical protein  25.66 
 
 		 340 aa  46.2  0.0009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0649803  hitchhiker  0.00264539 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0625  hypothetical protein  24.79 
 
 		 351 aa  44.3  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.215143 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>