22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2199 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_2199  hypothetical protein  100 
 
 
352 aa  702    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.736056  normal  0.741615 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0601  hypothetical protein  40.53 
 
 
342 aa  256  4e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.755176  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4226  hypothetical protein  39.18 
 
 
344 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.544309 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4124  hypothetical protein  42.64 
 
 
347 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.321232  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0625  hypothetical protein  39.56 
 
 
351 aa  211  2e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.215143 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2403  hypothetical protein  34.62 
 
 
333 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4013  hypothetical protein  35.06 
 
 
313 aa  150  3e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2355  hypothetical protein  33.65 
 
 
314 aa  142  8e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1568  hypothetical protein  34.07 
 
 
336 aa  138  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1959  hypothetical protein  34.29 
 
 
337 aa  135  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1594  hypothetical protein  28.85 
 
 
380 aa  64.3  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1586  hypothetical protein  27.6 
 
 
380 aa  59.7  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989603  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2086  hypothetical protein  27.95 
 
 
291 aa  59.3  0.00000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2429  hypothetical protein  26.35 
 
 
342 aa  55.5  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5148  hypothetical protein  29.28 
 
 
364 aa  53.5  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.978654  normal  0.737903 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0739  hypothetical protein  26.25 
 
 
406 aa  50.4  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6005  heat shock protein DnaJ-like protein  27.23 
 
 
645 aa  49.7  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3991  hypothetical protein  27.07 
 
 
339 aa  47.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0288  hypothetical protein  24.2 
 
 
349 aa  45.4  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4868  hypothetical protein  41.79 
 
 
72 aa  44.3  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.611676  normal  0.256759 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3993  hypothetical protein  27.44 
 
 
341 aa  43.9  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3563  hypothetical protein  25.25 
 
 
353 aa  42.7  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.297998 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>