18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_B0625 on replicon NC_008826
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008826  Mpe_B0625  hypothetical protein  100 
 
 		 351 aa  720    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.215143 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2199  hypothetical protein  40.19 
 
 		 352 aa  211  2e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.736056  normal  0.741615 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2403  hypothetical protein  39.54 
 
 		 333 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0601  hypothetical protein  33.23 
 
 		 342 aa  187  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.755176  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4013  hypothetical protein  35.37 
 
 		 313 aa  180  4e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2355  hypothetical protein  34.94 
 
 		 314 aa  177  3e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1959  hypothetical protein  35.44 
 
 		 337 aa  172  9e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1568  hypothetical protein  33.76 
 
 		 336 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4226  hypothetical protein  33.82 
 
 		 344 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.544309 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4124  hypothetical protein  32.25 
 
 		 347 aa  134  3e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.321232  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2429  hypothetical protein  25 
 
 		 342 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0739  hypothetical protein  26.59 
 
 		 406 aa  46.2  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3991  hypothetical protein  26.22 
 
 		 339 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0288  hypothetical protein  23.78 
 
 		 349 aa  44.3  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1594  hypothetical protein  27.75 
 
 		 380 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1586  hypothetical protein  24.79 
 
 		 380 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5148  hypothetical protein  24.8 
 
 		 364 aa  42.7  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.978654  normal  0.737903 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6005  heat shock protein DnaJ-like protein  23.58 
 
 		 645 aa  42.7  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>