14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4226 on replicon NC_009430
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009430  Rsph17025_4226  hypothetical protein  100 
 
 
344 aa  697    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.544309 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2199  hypothetical protein  39.18 
 
 
352 aa  223  4e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.736056  normal  0.741615 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0601  hypothetical protein  34.88 
 
 
342 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.755176  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0625  hypothetical protein  33.82 
 
 
351 aa  157  2e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.215143 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4124  hypothetical protein  36.63 
 
 
347 aa  155  9e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.321232  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2403  hypothetical protein  33.02 
 
 
333 aa  129  6e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1959  hypothetical protein  31.37 
 
 
337 aa  116  5e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2355  hypothetical protein  29.07 
 
 
314 aa  113  5e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1568  hypothetical protein  28.53 
 
 
336 aa  112  9e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4013  hypothetical protein  30.53 
 
 
313 aa  107  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1586  hypothetical protein  25.93 
 
 
380 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989603  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3991  hypothetical protein  27.21 
 
 
339 aa  49.7  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5148  hypothetical protein  28.18 
 
 
364 aa  49.3  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.978654  normal  0.737903 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0739  hypothetical protein  24.32 
 
 
406 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>