12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2355 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2355  hypothetical protein  100 
 
 		 314 aa  646    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1568  hypothetical protein  65.92 
 
 		 336 aa  410  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2403  hypothetical protein  45.95 
 
 		 333 aa  285  5e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4013  hypothetical protein  47.59 
 
 		 313 aa  281  8.000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1959  hypothetical protein  40.71 
 
 		 337 aa  241  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0625  hypothetical protein  34.94 
 
 		 351 aa  177  3e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.215143 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0601  hypothetical protein  30.09 
 
 		 342 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.755176  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2199  hypothetical protein  33.65 
 
 		 352 aa  142  6e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.736056  normal  0.741615 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4124  hypothetical protein  35.18 
 
 		 347 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.321232  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4226  hypothetical protein  29.07 
 
 		 344 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.544309 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6005  heat shock protein DnaJ-like protein  24.71 
 
 		 645 aa  58.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2086  hypothetical protein  27.97 
 
 		 291 aa  43.9  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>