12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2403 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2403  hypothetical protein  100 
 
 		 333 aa  689    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4013  hypothetical protein  55.41 
 
 		 313 aa  349  4e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1568  hypothetical protein  48.4 
 
 		 336 aa  305  5.0000000000000004e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2355  hypothetical protein  45.95 
 
 		 314 aa  285  5.999999999999999e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1959  hypothetical protein  43.45 
 
 		 337 aa  259  5.0000000000000005e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0625  hypothetical protein  39.54 
 
 		 351 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.215143 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0601  hypothetical protein  32.92 
 
 		 342 aa  163  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.755176  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2199  hypothetical protein  34.62 
 
 		 352 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.736056  normal  0.741615 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4124  hypothetical protein  37.34 
 
 		 347 aa  147  3e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.321232  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4226  hypothetical protein  33.02 
 
 		 344 aa  129  6e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.544309 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6005  heat shock protein DnaJ-like protein  29.06 
 
 		 645 aa  86.7  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2086  hypothetical protein  28.33 
 
 		 291 aa  52.4  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>