11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_4013 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_4013  hypothetical protein  100 
 
 		 313 aa  640    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2403  hypothetical protein  55.41 
 
 		 333 aa  349  4e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2355  hypothetical protein  47.59 
 
 		 314 aa  281  8.000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1568  hypothetical protein  47.12 
 
 		 336 aa  280  3e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1959  hypothetical protein  43.04 
 
 		 337 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0625  hypothetical protein  35.37 
 
 		 351 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.215143 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2199  hypothetical protein  35.06 
 
 		 352 aa  150  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.736056  normal  0.741615 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0601  hypothetical protein  29.06 
 
 		 342 aa  141  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.755176  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4124  hypothetical protein  33.33 
 
 		 347 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.321232  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4226  hypothetical protein  30.53 
 
 		 344 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.544309 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6005  heat shock protein DnaJ-like protein  27.8 
 
 		 645 aa  73.2  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>