20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5148 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5148  hypothetical protein  100 
 
 
364 aa  736    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.978654  normal  0.737903 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0739  hypothetical protein  58 
 
 
406 aa  408  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1586  hypothetical protein  51.4 
 
 
380 aa  353  2e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989603  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1594  hypothetical protein  51.27 
 
 
380 aa  345  8e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3993  hypothetical protein  38.78 
 
 
341 aa  167  2e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3771  hypothetical protein  38.78 
 
 
343 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0472674  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4762  hypothetical protein  38.18 
 
 
338 aa  146  7.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.199256  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3991  hypothetical protein  38.31 
 
 
339 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2429  hypothetical protein  29.26 
 
 
342 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3563  hypothetical protein  31.92 
 
 
353 aa  115  7.999999999999999e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.297998 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0288  hypothetical protein  28.39 
 
 
349 aa  96.3  7e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4108  hypothetical protein  31.73 
 
 
346 aa  91.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.15016  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2199  hypothetical protein  29.28 
 
 
352 aa  53.5  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.736056  normal  0.741615 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4226  hypothetical protein  28.18 
 
 
344 aa  49.3  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.544309 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0100  hypothetical protein  27.84 
 
 
235 aa  47.8  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00486405  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4124  hypothetical protein  29.41 
 
 
347 aa  46.2  0.0009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.321232  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0601  hypothetical protein  27.05 
 
 
342 aa  45.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.755176  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1886  hypothetical protein  26.11 
 
 
340 aa  45.1  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0649803  hitchhiker  0.00264539 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2573  hypothetical protein  25.25 
 
 
341 aa  44.7  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0625  hypothetical protein  24.8 
 
 
351 aa  43.1  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.215143 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>