15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4762 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_4762  hypothetical protein  100 
 
 		 338 aa  675    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.199256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3771  hypothetical protein  59.1 
 
 		 343 aa  389  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0472674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3993  hypothetical protein  58.68 
 
 		 341 aa  387  1e-106  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3991  hypothetical protein  54.32 
 
 		 339 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1586  hypothetical protein  40.98 
 
 		 380 aa  159  8e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989603  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0739  hypothetical protein  38.16 
 
 		 406 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1594  hypothetical protein  38.85 
 
 		 380 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5148  hypothetical protein  38.18 
 
 		 364 aa  146  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.978654  normal  0.737903 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4108  hypothetical protein  34.31 
 
 		 346 aa  138  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.15016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3563  hypothetical protein  28.62 
 
 		 353 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.297998 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0288  hypothetical protein  29.36 
 
 		 349 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2429  hypothetical protein  29.74 
 
 		 342 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2573  hypothetical protein  24.23 
 
 		 341 aa  62.4  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0100  hypothetical protein  28.43 
 
 		 235 aa  45.4  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00486405  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1886  hypothetical protein  25.08 
 
 		 340 aa  45.8  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0649803  hitchhiker  0.00264539 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>