16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1594 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1586  hypothetical protein  86.84 
 
 		 380 aa  674    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1594  hypothetical protein  100 
 
 		 380 aa  773    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0739  hypothetical protein  52.52 
 
 		 406 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5148  hypothetical protein  51.27 
 
 		 364 aa  345  8e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.978654  normal  0.737903 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3991  hypothetical protein  38.28 
 
 		 339 aa  164  3e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3993  hypothetical protein  36.69 
 
 		 341 aa  150  5e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4762  hypothetical protein  38.85 
 
 		 338 aa  147  4.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.199256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3771  hypothetical protein  34.86 
 
 		 343 aa  140  4.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0472674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2429  hypothetical protein  30.21 
 
 		 342 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3563  hypothetical protein  35.07 
 
 		 353 aa  114  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.297998 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0288  hypothetical protein  27.96 
 
 		 349 aa  100  4e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4108  hypothetical protein  30.03 
 
 		 346 aa  89.7  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.15016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2199  hypothetical protein  28.85 
 
 		 352 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.736056  normal  0.741615 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0100  hypothetical protein  29.82 
 
 		 235 aa  50.1  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00486405  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1886  hypothetical protein  25.38 
 
 		 340 aa  47.4  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0649803  hitchhiker  0.00264539 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0625  hypothetical protein  27.75 
 
 		 351 aa  43.9  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.215143 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>