14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0288 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0288  hypothetical protein  100 
 
 		 349 aa  721    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3563  hypothetical protein  50 
 
 		 353 aa  324  1e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.297998 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2429  hypothetical protein  30.81 
 
 		 342 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3991  hypothetical protein  30.56 
 
 		 339 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0739  hypothetical protein  29.87 
 
 		 406 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4762  hypothetical protein  29.36 
 
 		 338 aa  112  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.199256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1586  hypothetical protein  28.21 
 
 		 380 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1594  hypothetical protein  27.96 
 
 		 380 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5148  hypothetical protein  28.39 
 
 		 364 aa  96.3  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.978654  normal  0.737903 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3993  hypothetical protein  26.9 
 
 		 341 aa  93.2  5e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3771  hypothetical protein  26.9 
 
 		 343 aa  93.2  7e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0472674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4108  hypothetical protein  27.66 
 
 		 346 aa  92.8  8e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.15016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2199  hypothetical protein  24.2 
 
 		 352 aa  45.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.736056  normal  0.741615 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0625  hypothetical protein  23.78 
 
 		 351 aa  44.7  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.215143 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>