14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1886 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1886  hypothetical protein  100 
 
 		 340 aa  703    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0649803  hitchhiker  0.00264539 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2573  hypothetical protein  40.62 
 
 		 341 aa  270  2e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0100  hypothetical protein  30.57 
 
 		 235 aa  91.7  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00486405  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3991  hypothetical protein  30 
 
 		 339 aa  75.9  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3563  hypothetical protein  27.08 
 
 		 353 aa  60.8  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.297998 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3771  hypothetical protein  27.34 
 
 		 343 aa  61.2  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0472674  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0739  hypothetical protein  26.47 
 
 		 406 aa  60.8  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3993  hypothetical protein  25.44 
 
 		 341 aa  59.3  0.00000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1594  hypothetical protein  25.38 
 
 		 380 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1932  hypothetical protein  26.82 
 
 		 277 aa  46.6  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.633119  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1586  hypothetical protein  25.66 
 
 		 380 aa  46.2  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4762  hypothetical protein  25.08 
 
 		 338 aa  45.8  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.199256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5148  hypothetical protein  26.11 
 
 		 364 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.978654  normal  0.737903 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5223  hypothetical protein  25.13 
 
 		 281 aa  43.5  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>