14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2573 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_2573  hypothetical protein  100 
 
 
341 aa  706    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1886  hypothetical protein  40.62 
 
 
340 aa  270  2e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0649803  hitchhiker  0.00264539 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3771  hypothetical protein  28.7 
 
 
343 aa  79.3  0.00000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0472674  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3991  hypothetical protein  26.28 
 
 
339 aa  74.7  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0100  hypothetical protein  31.58 
 
 
235 aa  74.7  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00486405  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3993  hypothetical protein  27.16 
 
 
341 aa  68.9  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4762  hypothetical protein  24.23 
 
 
338 aa  62.4  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.199256  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0739  hypothetical protein  24.33 
 
 
406 aa  57.4  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3563  hypothetical protein  23.38 
 
 
353 aa  56.2  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.297998 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1586  hypothetical protein  23.69 
 
 
380 aa  56.2  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989603  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1932  hypothetical protein  26.37 
 
 
277 aa  51.2  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.633119  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2532  hypothetical protein  24.45 
 
 
269 aa  50.4  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2429  hypothetical protein  25.6 
 
 
342 aa  44.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5148  hypothetical protein  25.25 
 
 
364 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.978654  normal  0.737903 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>