More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1424 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02354  malic enzyme  61.09 
 
 		 759 aa  944    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1207  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  61.22 
 
 		 759 aa  946    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.795246  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1700  malic enzyme  49.2 
 
 		 752 aa  711    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2592  malic enzyme  61.22 
 
 		 759 aa  946    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01220  NADP-dependent malate dehydrogenase  47.07 
 
 		 766 aa  654    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.189364  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3123  malic enzyme  65.69 
 
 		 756 aa  1004    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3309  malic enzyme  59.1 
 
 		 769 aa  892    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2123  malic enzyme  74.04 
 
 		 773 aa  1119    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.223978  normal  0.897782 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2767  malic enzyme  62.42 
 
 		 781 aa  942    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0582903  normal  0.182467 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4759  malic enzyme  60.29 
 
 		 770 aa  895    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2741  malic enzyme  61.35 
 
 		 759 aa  946    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1969  malic enzyme  65.69 
 
 		 756 aa  1004    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.725411  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0224  malic enzyme  58.99 
 
 		 773 aa  914    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2224  malic enzyme  54.71 
 
 		 759 aa  815    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1017  malic enzyme  59.87 
 
 		 774 aa  887    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0396  malic enzyme  59.1 
 
 		 769 aa  892    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.113138  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3484  malic enzyme  47.14 
 
 		 749 aa  669    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1095  malic enzyme  81.48 
 
 		 766 aa  1198    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4071  malic enzyme  61.22 
 
 		 776 aa  893    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1010  malic enzyme  85.19 
 
 		 765 aa  1278    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0551739 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3524  malic enzyme  65.69 
 
 		 756 aa  1004    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.753922  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2477  malic enzyme  59.1 
 
 		 769 aa  892    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.622597  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2586  malic enzyme  65.69 
 
 		 756 aa  1004    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0622  malic enzyme  57.84 
 
 		 777 aa  845    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0117628  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1904  malic enzyme  52.85 
 
 		 755 aa  730    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.894987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2289  malic enzyme  54.18 
 
 		 757 aa  805    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.999733  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1367  malic enzyme  58.22 
 
 		 779 aa  901    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0666  malic enzyme  61.64 
 
 		 759 aa  913    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.121288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3943  malic enzyme  64.81 
 
 		 758 aa  998    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00128716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2441  malic enzyme  73.13 
 
 		 777 aa  1124    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2847  malic enzyme  61.09 
 
 		 774 aa  909    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0118  malic enzyme  45.59 
 
 		 763 aa  642    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.964917  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1029  malic enzyme  59.57 
 
 		 764 aa  920    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1587  malic enzyme  56.8 
 
 		 760 aa  815    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0019  malic enzyme  65.69 
 
 		 773 aa  1005    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3474  malic enzyme  59.1 
 
 		 769 aa  894    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4106  malic enzyme  61.09 
 
 		 770 aa  913    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0826  malic enzyme  55.08 
 
 		 759 aa  793    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.214275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2958  malic enzyme  60.82 
 
 		 759 aa  945    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.692294 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3472  malic enzyme  63.21 
 
 		 759 aa  973    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.382642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1593  malic enzyme  54.45 
 
 		 759 aa  799    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3417  malic enzyme  65.25 
 
 		 756 aa  1003    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.154841  normal  0.983896 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3713  malic enzyme  59.23 
 
 		 785 aa  899    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.302892  normal  0.094119 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2662  malic enzyme  60 
 
 		 782 aa  890    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1637  malic enzyme  47.35 
 
 		 752 aa  696    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000270094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2073  malic enzyme  47.14 
 
 		 752 aa  666    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000040152  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3439  malic enzyme  59.1 
 
 		 771 aa  894    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.992172  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1112  malic enzyme  75.52 
 
 		 769 aa  1146    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3849  malic enzyme  65.69 
 
 		 756 aa  1004    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.416227  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1558  malic enzyme  57.97 
 
 		 770 aa  856    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0734911  normal  0.266658 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1189  malic enzyme  58.99 
 
 		 768 aa  896    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3110  malic enzyme  65.56 
 
 		 756 aa  1007    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3930  malic enzyme  47.94 
 
 		 771 aa  659    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2497  malic enzyme  56.77 
 
 		 769 aa  800    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0502  malic enzyme  47.29 
 
 		 773 aa  652    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.214908  normal  0.395596 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3876  malic enzyme  57.12 
 
 		 769 aa  867    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.201393 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0175  malic enzyme  45.32 
 
 		 758 aa  635    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2100  malic enzyme  59.43 
 
 		 774 aa  863    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.921998  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2989  malic enzyme  53.48 
 
 		 758 aa  765    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.210734  normal  0.136113 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0093  malic enzyme  61.01 
 
 		 769 aa  932    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.351367  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1424  malic enzyme  100 
 
 		 771 aa  1564    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2337  malic enzyme  56.33 
 
 		 769 aa  802    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.59426 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1421  malic enzyme  85.85 
 
 		 767 aa  1318    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4858  malic enzyme  60.58 
 
 		 772 aa  910    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.633507  normal  0.0500953 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0283  malic enzyme  65.21 
 
 		 760 aa  1005    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00767286 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0557  malic enzyme  59.05 
 
 		 779 aa  905    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.214152 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3355  malic enzyme  58.79 
 
 		 772 aa  902    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1646  malic enzyme  60.82 
 
 		 774 aa  879    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.186396  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2946  malic enzyme  56.86 
 
 		 769 aa  799    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.542462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3788  malic enzyme  65.69 
 
 		 756 aa  1004    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2110  malic enzyme  56.37 
 
 		 765 aa  810    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0997  malic enzyme  58.36 
 
 		 777 aa  899    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.158987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0878  malic enzyme  71.96 
 
 		 773 aa  1119    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.716606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3046  malic enzyme  61.09 
 
 		 774 aa  901    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.472837  normal  0.553113 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1573  malic enzyme  51.27 
 
 		 759 aa  754    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2877  malic enzyme  47.53 
 
 		 751 aa  637    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.857329 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3143  malic enzyme  57.98 
 
 		 760 aa  820    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.231587  normal  0.133413 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0148  malic enzyme  59.36 
 
 		 785 aa  900    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.723527  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2788  malic enzyme  64.72 
 
 		 756 aa  997    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0246  malic enzyme  54.45 
 
 		 759 aa  800    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1536  malic enzyme  59.97 
 
 		 770 aa  871    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0984  malic enzyme  60 
 
 		 774 aa  888    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0027  malic enzyme  47.88 
 
 		 757 aa  660    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.376486  normal  0.721374 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0465  malic enzyme  58.15 
 
 		 755 aa  858    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00312155  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0807  malic enzyme  76.59 
 
 		 768 aa  1159    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3533  malic enzyme  65.69 
 
 		 756 aa  1004    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78558  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0246  malic enzyme  61.84 
 
 		 776 aa  962    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.838857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1256  malic enzyme  59.1 
 
 		 769 aa  892    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1269  malic enzyme  59.04 
 
 		 779 aa  929    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.525931  normal  0.614845 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1277  malic enzyme  61.89 
 
 		 759 aa  934    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0237  malic enzyme  65.23 
 
 		 756 aa  994    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0532  malic enzyme  58.99 
 
 		 766 aa  898    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4462  malic enzyme  60 
 
 		 766 aa  888    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.668544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0274  malic enzyme  54.18 
 
 		 759 aa  797    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0318  malic enzyme  64.72 
 
 		 756 aa  997    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0631  malic enzyme  59.36 
 
 		 785 aa  900    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3496  malic enzyme  59.92 
 
 		 766 aa  892    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.404926 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2777  malic enzyme  49.74 
 
 		 757 aa  678    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0405643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0207  malic enzyme  61.15 
 
 		 764 aa  905    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.850785 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3476  malic enzyme  59.1 
 
 		 769 aa  894    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>