More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2946 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02354  malic enzyme  57.41 
 
 		 759 aa  859    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1207  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  57.54 
 
 		 759 aa  861    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.795246  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1700  malic enzyme  48.19 
 
 		 752 aa  683    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2289  malic enzyme  54.03 
 
 		 757 aa  799    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.999733  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1558  malic enzyme  65.56 
 
 		 770 aa  953    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0734911  normal  0.266658 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1095  malic enzyme  57.07 
 
 		 766 aa  801    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0246  malic enzyme  56.49 
 
 		 759 aa  823    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2123  malic enzyme  56.67 
 
 		 773 aa  836    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.223978  normal  0.897782 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2767  malic enzyme  59.08 
 
 		 781 aa  856    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0582903  normal  0.182467 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4071  malic enzyme  56.1 
 
 		 776 aa  786    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4759  malic enzyme  54.65 
 
 		 770 aa  781    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2754  malic enzyme  56.92 
 
 		 780 aa  822    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.223736  normal  0.851039 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0807  malic enzyme  56.03 
 
 		 768 aa  788    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3524  malic enzyme  56.97 
 
 		 756 aa  859    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.753922  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0220  malic enzyme  57.35 
 
 		 756 aa  853    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.667581  hitchhiker  0.000000000555006 
 
 
-
 
NC_004310  BR1017  malic enzyme  68.1 
 
 		 774 aa  1025    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3788  malic enzyme  56.97 
 
 		 756 aa  859    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0224  malic enzyme  56.01 
 
 		 773 aa  826    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2224  malic enzyme  56.63 
 
 		 759 aa  846    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3484  malic enzyme  46.33 
 
 		 749 aa  652    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1010  malic enzyme  57.79 
 
 		 765 aa  821    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0551739 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1112  malic enzyme  56.13 
 
 		 769 aa  813    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1969  malic enzyme  56.97 
 
 		 756 aa  859    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.725411  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2477  malic enzyme  56.29 
 
 		 769 aa  809    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.622597  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2586  malic enzyme  56.97 
 
 		 756 aa  859    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3533  malic enzyme  56.97 
 
 		 756 aa  859    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78558  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3123  malic enzyme  56.97 
 
 		 756 aa  859    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2958  malic enzyme  56.75 
 
 		 759 aa  855    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.692294 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1367  malic enzyme  53.74 
 
 		 779 aa  829    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0666  malic enzyme  58.36 
 
 		 759 aa  836    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.121288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3943  malic enzyme  57.6 
 
 		 758 aa  858    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00128716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2441  malic enzyme  56.53 
 
 		 777 aa  849    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2847  malic enzyme  58.07 
 
 		 774 aa  817    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3143  malic enzyme  68.46 
 
 		 760 aa  1010    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.231587  normal  0.133413 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1646  malic enzyme  56.12 
 
 		 774 aa  786    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.186396  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1587  malic enzyme  79.34 
 
 		 760 aa  1207    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0019  malic enzyme  56.97 
 
 		 773 aa  859    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3474  malic enzyme  56.29 
 
 		 769 aa  812    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0622  malic enzyme  63.05 
 
 		 777 aa  938    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0117628  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2106  malic enzyme  56.88 
 
 		 765 aa  842    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.12577  normal  0.161239 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3476  malic enzyme  56.29 
 
 		 769 aa  812    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6030  malic enzyme  55.05 
 
 		 769 aa  780    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1593  malic enzyme  56.76 
 
 		 759 aa  826    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3417  malic enzyme  57.09 
 
 		 756 aa  856    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.154841  normal  0.983896 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3713  malic enzyme  57.31 
 
 		 785 aa  827    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.302892  normal  0.094119 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2662  malic enzyme  57.82 
 
 		 782 aa  829    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1637  malic enzyme  47.66 
 
 		 752 aa  692    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000270094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0207  malic enzyme  56.18 
 
 		 764 aa  794    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.850785 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0396  malic enzyme  56.29 
 
 		 769 aa  809    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.113138  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4106  malic enzyme  55.59 
 
 		 770 aa  796    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0826  malic enzyme  56.06 
 
 		 759 aa  813    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.214275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1269  malic enzyme  53.63 
 
 		 779 aa  818    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.525931  normal  0.614845 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1189  malic enzyme  56.56 
 
 		 768 aa  815    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3110  malic enzyme  56.97 
 
 		 756 aa  861    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0827  malic enzyme  68.5 
 
 		 777 aa  986    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.345965 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2497  malic enzyme  96.62 
 
 		 769 aa  1417    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1277  malic enzyme  56.71 
 
 		 759 aa  835    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3876  malic enzyme  82.16 
 
 		 769 aa  1300    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.201393 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3472  malic enzyme  56.76 
 
 		 759 aa  852    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.382642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2786  malic enzyme  56.44 
 
 		 759 aa  830    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0144029 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2989  malic enzyme  54.45 
 
 		 758 aa  773    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.210734  normal  0.136113 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0093  malic enzyme  55.34 
 
 		 769 aa  822    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.351367  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1424  malic enzyme  56.86 
 
 		 771 aa  824    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2337  malic enzyme  87.37 
 
 		 769 aa  1293    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.59426 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1421  malic enzyme  56.82 
 
 		 767 aa  821    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4858  malic enzyme  56.63 
 
 		 772 aa  798    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.633507  normal  0.0500953 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0283  malic enzyme  57.01 
 
 		 760 aa  868    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00767286 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0557  malic enzyme  55.32 
 
 		 779 aa  811    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.214152 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3355  malic enzyme  54.95 
 
 		 772 aa  810    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1256  malic enzyme  56.29 
 
 		 769 aa  809    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2946  malic enzyme  100 
 
 		 769 aa  1553    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.542462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2741  malic enzyme  57.28 
 
 		 759 aa  857    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2110  malic enzyme  79.79 
 
 		 765 aa  1223    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0997  malic enzyme  53.6 
 
 		 777 aa  822    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.158987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0878  malic enzyme  56.59 
 
 		 773 aa  853    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.716606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3046  malic enzyme  58.07 
 
 		 774 aa  810    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.472837  normal  0.553113 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1573  malic enzyme  56.49 
 
 		 759 aa  832    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2100  malic enzyme  68.28 
 
 		 774 aa  1005    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.921998  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2592  malic enzyme  57.54 
 
 		 759 aa  861    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0148  malic enzyme  57.31 
 
 		 785 aa  823    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.723527  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2788  malic enzyme  56.95 
 
 		 756 aa  852    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2073  malic enzyme  47.26 
 
 		 752 aa  663    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000040152  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1536  malic enzyme  66.62 
 
 		 770 aa  951    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0027  malic enzyme  46.82 
 
 		 757 aa  639    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.376486  normal  0.721374 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0465  malic enzyme  52.58 
 
 		 755 aa  765    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00312155  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3849  malic enzyme  56.97 
 
 		 756 aa  859    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.416227  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3309  malic enzyme  56.29 
 
 		 769 aa  809    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0246  malic enzyme  59.52 
 
 		 776 aa  905    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.838857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1029  malic enzyme  59.84 
 
 		 764 aa  912    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1904  malic enzyme  53.64 
 
 		 755 aa  724    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.894987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0984  malic enzyme  68.24 
 
 		 774 aa  1026    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0237  malic enzyme  56.85 
 
 		 756 aa  847    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0532  malic enzyme  57.18 
 
 		 766 aa  823    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4462  malic enzyme  57.78 
 
 		 766 aa  824    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.668544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0274  malic enzyme  56.63 
 
 		 759 aa  825    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0318  malic enzyme  56.95 
 
 		 756 aa  852    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0631  malic enzyme  57.31 
 
 		 785 aa  823    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3496  malic enzyme  57.78 
 
 		 766 aa  832    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.404926 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2777  malic enzyme  48.73 
 
 		 757 aa  651    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0405643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3439  malic enzyme  56.29 
 
 		 771 aa  812    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.992172  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>