More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0826 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02354  malic enzyme  54.21 
 
 		 759 aa  820    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1207  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  54.34 
 
 		 759 aa  822    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.795246  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1700  malic enzyme  45.71 
 
 		 752 aa  644    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0274  malic enzyme  79.31 
 
 		 759 aa  1213    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0984  malic enzyme  58.47 
 
 		 774 aa  848    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2123  malic enzyme  55.29 
 
 		 773 aa  821    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.223978  normal  0.897782 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2767  malic enzyme  56.03 
 
 		 781 aa  822    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0582903  normal  0.182467 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1010  malic enzyme  54.36 
 
 		 765 aa  777    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0551739 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3788  malic enzyme  54.17 
 
 		 756 aa  819    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3533  malic enzyme  54.17 
 
 		 756 aa  819    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78558  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1256  malic enzyme  55.94 
 
 		 769 aa  818    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1112  malic enzyme  54.99 
 
 		 769 aa  807    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1017  malic enzyme  58.33 
 
 		 774 aa  848    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1969  malic enzyme  54.17 
 
 		 756 aa  819    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.725411  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3598  malic enzyme  45.21 
 
 		 754 aa  637    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1646  malic enzyme  55.24 
 
 		 774 aa  773    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.186396  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4759  malic enzyme  55.51 
 
 		 770 aa  800    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4071  malic enzyme  54.84 
 
 		 776 aa  770    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0207  malic enzyme  55.14 
 
 		 764 aa  786    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.850785 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2477  malic enzyme  55.94 
 
 		 769 aa  818    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.622597  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2586  malic enzyme  54.17 
 
 		 756 aa  819    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2289  malic enzyme  52.65 
 
 		 757 aa  781    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.999733  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0396  malic enzyme  55.94 
 
 		 769 aa  818    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.113138  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2754  malic enzyme  55.97 
 
 		 780 aa  822    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.223736  normal  0.851039 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1367  malic enzyme  50.53 
 
 		 779 aa  790    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0666  malic enzyme  55.42 
 
 		 759 aa  790    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.121288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3943  malic enzyme  56.57 
 
 		 758 aa  843    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00128716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2441  malic enzyme  54.48 
 
 		 777 aa  826    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2847  malic enzyme  54.97 
 
 		 774 aa  787    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0118  malic enzyme  44.81 
 
 		 763 aa  640    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.964917  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3123  malic enzyme  54.17 
 
 		 756 aa  819    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1587  malic enzyme  55.72 
 
 		 760 aa  815    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0019  malic enzyme  53.96 
 
 		 773 aa  820    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3474  malic enzyme  55.94 
 
 		 769 aa  821    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4106  malic enzyme  55.51 
 
 		 770 aa  797    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3143  malic enzyme  56.78 
 
 		 760 aa  812    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.231587  normal  0.133413 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2958  malic enzyme  54.87 
 
 		 759 aa  837    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.692294 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0826  malic enzyme  100 
 
 		 759 aa  1551    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.214275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1593  malic enzyme  79.31 
 
 		 759 aa  1216    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3417  malic enzyme  53.65 
 
 		 756 aa  822    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.154841  normal  0.983896 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3713  malic enzyme  55.17 
 
 		 785 aa  816    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.302892  normal  0.094119 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2662  malic enzyme  52.65 
 
 		 782 aa  764    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1637  malic enzyme  46.78 
 
 		 752 aa  672    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000270094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0224  malic enzyme  54.48 
 
 		 773 aa  810    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3309  malic enzyme  55.94 
 
 		 769 aa  818    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0807  malic enzyme  53.76 
 
 		 768 aa  770    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1095  malic enzyme  54.42 
 
 		 766 aa  775    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2741  malic enzyme  54.47 
 
 		 759 aa  823    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1189  malic enzyme  56.21 
 
 		 768 aa  824    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3110  malic enzyme  54.17 
 
 		 756 aa  821    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1269  malic enzyme  51.59 
 
 		 779 aa  824    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.525931  normal  0.614845 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2497  malic enzyme  56.32 
 
 		 769 aa  789    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2106  malic enzyme  55.21 
 
 		 765 aa  820    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.12577  normal  0.161239 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1904  malic enzyme  50.93 
 
 		 755 aa  701    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.894987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0175  malic enzyme  45.58 
 
 		 758 aa  646    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3472  malic enzyme  54.07 
 
 		 759 aa  835    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.382642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2989  malic enzyme  78.79 
 
 		 758 aa  1191    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.210734  normal  0.136113 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0093  malic enzyme  54.85 
 
 		 769 aa  808    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.351367  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1424  malic enzyme  55.08 
 
 		 771 aa  798    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2337  malic enzyme  56.32 
 
 		 769 aa  813    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.59426 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1421  malic enzyme  54.01 
 
 		 767 aa  794    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4858  malic enzyme  55.24 
 
 		 772 aa  791    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.633507  normal  0.0500953 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0283  malic enzyme  53.94 
 
 		 760 aa  824    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00767286 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0557  malic enzyme  55.89 
 
 		 779 aa  827    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.214152 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3355  malic enzyme  56.28 
 
 		 772 aa  825    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0622  malic enzyme  55.01 
 
 		 777 aa  801    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0117628  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2946  malic enzyme  56.06 
 
 		 769 aa  788    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.542462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0246  malic enzyme  79.31 
 
 		 759 aa  1216    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2110  malic enzyme  56.25 
 
 		 765 aa  827    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0997  malic enzyme  50.66 
 
 		 777 aa  786    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.158987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0878  malic enzyme  53.6 
 
 		 773 aa  812    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.716606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3046  malic enzyme  54.7 
 
 		 774 aa  787    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.472837  normal  0.553113 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1573  malic enzyme  76.68 
 
 		 759 aa  1188    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1558  malic enzyme  56.8 
 
 		 770 aa  813    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0734911  normal  0.266658 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2592  malic enzyme  54.34 
 
 		 759 aa  822    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0148  malic enzyme  55.57 
 
 		 785 aa  822    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.723527  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2788  malic enzyme  53.78 
 
 		 756 aa  824    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2224  malic enzyme  79.29 
 
 		 759 aa  1265    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3876  malic enzyme  56.04 
 
 		 769 aa  848    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.201393 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1536  malic enzyme  55.84 
 
 		 770 aa  810    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3467  malic enzyme  45.6 
 
 		 752 aa  641    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0220  malic enzyme  54.58 
 
 		 756 aa  830    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.667581  hitchhiker  0.000000000555006 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0465  malic enzyme  50.2 
 
 		 755 aa  749    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00312155  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3439  malic enzyme  55.94 
 
 		 771 aa  821    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.992172  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6030  malic enzyme  54.86 
 
 		 769 aa  789    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0246  malic enzyme  57.37 
 
 		 776 aa  882    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.838857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1029  malic enzyme  55.36 
 
 		 764 aa  853    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0827  malic enzyme  56.03 
 
 		 777 aa  808    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.345965 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2100  malic enzyme  57.77 
 
 		 774 aa  828    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.921998  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0237  malic enzyme  54.5 
 
 		 756 aa  826    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0532  malic enzyme  55.31 
 
 		 766 aa  817    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4462  malic enzyme  53.18 
 
 		 766 aa  775    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.668544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3476  malic enzyme  55.94 
 
 		 769 aa  821    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0318  malic enzyme  53.78 
 
 		 756 aa  824    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0631  malic enzyme  55.57 
 
 		 785 aa  822    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3496  malic enzyme  52.79 
 
 		 766 aa  771    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.404926 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1277  malic enzyme  54.61 
 
 		 759 aa  825    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3524  malic enzyme  54.17 
 
 		 756 aa  819    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.753922  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3849  malic enzyme  54.17 
 
 		 756 aa  819    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.416227  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2786  malic enzyme  54.34 
 
 		 759 aa  820    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0144029 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>