More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4049 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4049  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  100 
 
 		 231 aa  472  1e-132  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5130  OmpR/winged helix family two component transcriptional regulator  81.63 
 
 		 223 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.76336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1358  two component response regulator  64 
 
 		 224 aa  211  5.999999999999999e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4988  two component transcriptional regulator  64.52 
 
 		 225 aa  211  7e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000131605 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3067  two component transcriptional regulator  64.9 
 
 		 224 aa  209  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.43316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1407  two component transcriptional regulator, winged helix family  63.06 
 
 		 225 aa  210  2e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.440596  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0894  two component transcriptional regulator  64.86 
 
 		 222 aa  209  3e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1685  two component transcriptional regulator, winged helix family  62.99 
 
 		 225 aa  207  1e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00118059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1411  response regulator receiver  62.99 
 
 		 225 aa  207  1e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.110033 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2126  two component transcriptional regulator, winged helix family  65.1 
 
 		 224 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.245988  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0917  two component transcriptional regulator, winged helix family  64.63 
 
 		 223 aa  206  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.349593 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1997  winged helix family two component transcriptional regulator  63.82 
 
 		 224 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.981118  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1066  two component transcriptional regulator, winged helix family  63.95 
 
 		 223 aa  206  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3454  two component transcriptional regulator  65.1 
 
 		 257 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.215717 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0801  two component transcriptional regulator  64.86 
 
 		 221 aa  206  3e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0203691 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0630  two component transcriptional regulator  64.19 
 
 		 223 aa  205  4e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0672917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1433  two component transcriptional regulator  64.19 
 
 		 223 aa  205  6e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4171  two component transcriptional regulator, winged helix family  63.33 
 
 		 225 aa  204  7e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2066  two component transcriptional regulator  64.67 
 
 		 225 aa  204  1e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3444  two component transcriptional regulator  64.86 
 
 		 220 aa  203  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112849  normal  0.384843 
 
 
-
 
NC_004310  BR0604  DNA-binding response regulator  61.22 
 
 		 229 aa  203  2e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.121209  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0603  DNA-binding response regulator  61.22 
 
 		 229 aa  203  2e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2674  two component transcriptional regulator  61.74 
 
 		 230 aa  203  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238816  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0434  two component transcriptional regulator, winged helix family  64.43 
 
 		 236 aa  202  3e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.569156 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4436  two component transcriptional regulator  62.67 
 
 		 227 aa  202  3e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.177006  normal  0.889846 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1187  two component transcriptional regulatory protein  62.84 
 
 		 223 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0428  transcriptional regulator FeuP  63.89 
 
 		 221 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.461578  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0936  two component transcriptional regulator  62 
 
 		 225 aa  194  8.000000000000001e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.966492  normal  0.099028 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02836  two-component system regulatory protein (response regulator) required for AvrXa21 activity R2 (raxR2)  61.54 
 
 		 223 aa  191  8e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1842  response regulator receiver protein  63.95 
 
 		 227 aa  191  1e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1773  two component transcriptional regulator  63.95 
 
 		 227 aa  191  1e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.894508  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3176  two component transcriptional regulator  66.44 
 
 		 223 aa  188  5e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.987704  normal  0.0233237 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0229  two component transcriptional regulator, winged helix family  60.9 
 
 		 227 aa  188  7e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.069189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2228  two component transcriptional regulator  62.18 
 
 		 235 aa  187  8e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0928  two component transcriptional regulator  65.31 
 
 		 223 aa  185  6e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2840  two component transcriptional regulator  58.28 
 
 		 226 aa  184  7e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1244  DNA-binding response regulator  57.82 
 
 		 219 aa  183  2.0000000000000003e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000551267  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02297  response regulator in two-component regulatory system with PhoQ  56.05 
 
 		 224 aa  182  5.0000000000000004e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1830  two component transcriptional regulator  62.59 
 
 		 229 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000334727  normal  0.705517 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003784  two-component system response regulator QseB  56.46 
 
 		 219 aa  180  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000147394  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0282  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  56.13 
 
 		 230 aa  179  2.9999999999999997e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0932199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02658  hypothetical protein  55.1 
 
 		 219 aa  179  2.9999999999999997e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1388  transcriptional regulatory protein PhoP  58.39 
 
 		 224 aa  178  8e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2935  two component transcriptional regulator  56.21 
 
 		 229 aa  177  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000047512  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1132  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  55.63 
 
 		 227 aa  177  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.12057  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3303  response regulator receiver protein  59.18 
 
 		 224 aa  176  3e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4311  two component transcriptional regulator  60.42 
 
 		 221 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0333339  normal  0.0442497 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3246  two component transcriptional regulator  52.87 
 
 		 231 aa  175  5e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000050319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3896  two component transcriptional regulator  60 
 
 		 226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.253425  normal  0.177785 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1264  response regulator receiver  56.21 
 
 		 243 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000227049  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6194  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.09 
 
 		 222 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3380  two component transcriptional regulator  54.97 
 
 		 230 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000549651  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4647  DNA-binding response regulator  57.43 
 
 		 231 aa  171  6.999999999999999e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2695  two component transcriptional regulator  54.61 
 
 		 226 aa  170  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000581772  normal  0.101861 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3353  response regulator receiver domain-containing protein  55.63 
 
 		 225 aa  171  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000371413  normal  0.100473 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0312  two component transcriptional regulator  56.49 
 
 		 221 aa  170  2e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1884  two component transcriptional regulator  55.92 
 
 		 222 aa  169  4e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0239131 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3187  two component transcriptional regulator  54.72 
 
 		 229 aa  168  7e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1979  putative transcriptional regulator  52.74 
 
 		 219 aa  167  1e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3817  two component transcriptional regulator  56.76 
 
 		 227 aa  167  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000444115  decreased coverage  0.00121668 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3908  two component transcriptional regulator  56.76 
 
 		 227 aa  167  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000011766  normal  0.487109 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4140  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.67 
 
 		 231 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0944225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3852  two component transcriptional regulator  54 
 
 		 231 aa  166  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.15775  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4344  two component transcriptional regulator  54.67 
 
 		 231 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000925591  normal  0.608954 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3765  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.35 
 
 		 219 aa  166  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.757734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4212  two component transcriptional regulator  54.67 
 
 		 231 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000202187  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4025  two component transcriptional regulator  56.08 
 
 		 227 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4595  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.56 
 
 		 224 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4114  response regulator receiver  54.11 
 
 		 221 aa  161  7e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.584042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4482  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.11 
 
 		 221 aa  161  7e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.273549  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28580  Response regulator  54.55 
 
 		 221 aa  161  7e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3381  DNA-binding response regulator  58.45 
 
 		 222 aa  161  8.000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.060909  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4083  two component transcriptional regulator  60 
 
 		 223 aa  161  8.000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.193454 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1995  two component transcriptional regulator  55.33 
 
 		 222 aa  161  8.000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.21218 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3212  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  57.04 
 
 		 222 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.326214 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5099  two component transcriptional regulator  61.11 
 
 		 223 aa  160  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.620422  normal  0.120293 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2347  winged helix family two component transcriptional regulator  56.76 
 
 		 222 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000302018 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3349  two component transcriptional regulator  56.76 
 
 		 222 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1947  two component transcriptional regulator  56.08 
 
 		 222 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.421076  normal  0.0119241 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29730  putative two-component response regulator  56.64 
 
 		 223 aa  159  5e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2543  putative two-component response regulator  56.64 
 
 		 223 aa  158  6e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0177943  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4326  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  51.33 
 
 		 222 aa  158  7e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0885545 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3431  two component transcriptional regulator, winged helix family  60.4 
 
 		 223 aa  158  8e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.866455  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0357  two component transcriptional regulator  55.78 
 
 		 219 aa  157  1e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0242  two component transcriptional regulator  55.78 
 
 		 219 aa  157  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0239  two component transcriptional regulator  55.78 
 
 		 219 aa  157  1e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0245  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.78 
 
 		 219 aa  157  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117592 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0239  two component transcriptional regulator  55.1 
 
 		 219 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3060  two component transcriptional regulator  52.05 
 
 		 223 aa  157  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1787  two component transcriptional regulator  55.41 
 
 		 222 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.132601  normal  0.0795693 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1913  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.48 
 
 		 221 aa  156  3e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4487  DNA-binding response regulator  55.48 
 
 		 220 aa  155  4e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3772  two component transcriptional regulator  54.73 
 
 		 222 aa  155  4e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.701851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5304  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.32 
 
 		 221 aa  155  4e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2976  two component transcriptional regulator  52.38 
 
 		 225 aa  155  7e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.176642 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5125  two component response regulator  50 
 
 		 222 aa  154  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1885  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 221 aa  153  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2505  two component transcriptional regulator  52.67 
 
 		 226 aa  153  2e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.457878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0240  two component transcriptional regulator  54.79 
 
 		 220 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000039366 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3781  two component transcriptional regulator  54.79 
 
 		 220 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>