57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2637 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A2637  hypothetical protein  100 
 
 
449 aa  881    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0655  hypothetical protein  59.19 
 
 
412 aa  400  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.309052 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0599  hypothetical protein  51.39 
 
 
438 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.277534 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6285  hypothetical protein  41.79 
 
 
459 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0304852  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5989  hypothetical protein  41.44 
 
 
459 aa  260  4e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.512618  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5871  hypothetical protein  42.25 
 
 
459 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.265551 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5507  hypothetical protein  42.25 
 
 
459 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6380  hypothetical protein  41.5 
 
 
459 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.939684  normal  0.57119 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2261  hypothetical protein  43.37 
 
 
474 aa  218  2e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1304  hypothetical protein  41.22 
 
 
474 aa  210  5e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2950  hypothetical protein  41.22 
 
 
474 aa  210  5e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3076  hypothetical protein  41.22 
 
 
474 aa  210  5e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.420987  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7209  hypothetical protein  41.19 
 
 
459 aa  202  7e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.87929 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0603  hypothetical protein  37.31 
 
 
442 aa  196  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.321779  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2636  hypothetical protein  38.74 
 
 
412 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0540  hypothetical protein  35.68 
 
 
438 aa  178  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0800499  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0598  hypothetical protein  38.21 
 
 
423 aa  177  4e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.279225 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0657  hypothetical protein  33.84 
 
 
408 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.471986 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0654  hypothetical protein  36.97 
 
 
418 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.301836 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6286  hypothetical protein  32.41 
 
 
469 aa  170  6e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0160508  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5990  hypothetical protein  32.96 
 
 
412 aa  163  6e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.838445  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5848  hypothetical protein  35.7 
 
 
397 aa  159  7e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7208  hypothetical protein  31.74 
 
 
412 aa  155  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.798029  normal  0.91585 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5506  hypothetical protein  32.69 
 
 
412 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5870  hypothetical protein  32.69 
 
 
412 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.26176 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3501  hypothetical protein  33.06 
 
 
415 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.497805  hitchhiker  0.00127671 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2262  hypothetical protein  34.81 
 
 
414 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4343  hypothetical protein  34.34 
 
 
415 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4023  hypothetical protein  34.34 
 
 
415 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.785881  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2951  hypothetical protein  35.46 
 
 
402 aa  140  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3430  hypothetical protein  35.58 
 
 
424 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.133762  normal  0.448059 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6379  hypothetical protein  34.36 
 
 
382 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.526995 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3937  hypothetical protein  35.43 
 
 
391 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.354956  normal  0.157719 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1305  hypothetical protein  35.73 
 
 
402 aa  137  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3077  hypothetical protein  35.73 
 
 
402 aa  137  4e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2048  hypothetical protein  34.65 
 
 
417 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0235283  normal  0.0270325 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1800  hypothetical protein  30.02 
 
 
409 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.916404  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4236  hypothetical protein  30.62 
 
 
421 aa  130  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.046998  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2582  hypothetical protein  32.96 
 
 
399 aa  127  6e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0523  hypothetical protein  32.96 
 
 
399 aa  127  6e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2317  hypothetical protein  33.14 
 
 
405 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6872  hypothetical protein  32.22 
 
 
408 aa  124  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.547088  normal  0.0747883 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0495  hypothetical protein  32.68 
 
 
399 aa  124  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4123  hypothetical protein  32.61 
 
 
414 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.305787  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4366  hypothetical protein  36.02 
 
 
390 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3904  hypothetical protein  35.62 
 
 
390 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2534  hypothetical protein  33.14 
 
 
403 aa  110  6e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2824  hypothetical protein  35.01 
 
 
401 aa  104  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.207622  normal  0.323454 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2994  hypothetical protein  32.29 
 
 
403 aa  103  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.658439  normal  0.272776 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0690  hypothetical protein  29.28 
 
 
413 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.115844  normal  0.126108 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1637  hypothetical protein  29.39 
 
 
428 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0705596  normal  0.0671021 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1919  hypothetical protein  29.39 
 
 
426 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.316747  normal  0.0774503 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1595  hypothetical protein  28.39 
 
 
396 aa  66.6  0.0000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.183842  normal  0.190287 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7358  hypothetical protein  28.76 
 
 
399 aa  64.3  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.930698  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3499  hypothetical protein  31.05 
 
 
397 aa  59.3  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.775188  normal  0.167132 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0727  hypothetical protein  29.68 
 
 
439 aa  57.4  0.0000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.393605  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2110  hypothetical protein  34.1 
 
 
405 aa  53.1  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>