60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3937 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3937  hypothetical protein  100 
 
 		 391 aa  761    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.354956  normal  0.157719 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3430  hypothetical protein  95.94 
 
 		 424 aa  632  1e-180  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.133762  normal  0.448059 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2048  hypothetical protein  74.04 
 
 		 417 aa  476  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0235283  normal  0.0270325 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3501  hypothetical protein  62.23 
 
 		 415 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.497805  hitchhiker  0.00127671 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4343  hypothetical protein  61.7 
 
 		 415 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4023  hypothetical protein  61.7 
 
 		 415 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.785881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2951  hypothetical protein  49.04 
 
 		 402 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6286  hypothetical protein  46.84 
 
 		 469 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0160508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2262  hypothetical protein  49.15 
 
 		 414 aa  269  7e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3077  hypothetical protein  49.31 
 
 		 402 aa  267  2e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1305  hypothetical protein  49.31 
 
 		 402 aa  267  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7208  hypothetical protein  46.42 
 
 		 412 aa  264  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.798029  normal  0.91585 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5990  hypothetical protein  46.05 
 
 		 412 aa  259  4e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.838445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6379  hypothetical protein  48.28 
 
 		 382 aa  257  3e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.526995 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5870  hypothetical protein  48.02 
 
 		 412 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.26176 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5506  hypothetical protein  48.02 
 
 		 412 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0540  hypothetical protein  41.09 
 
 		 438 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0800499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2636  hypothetical protein  38.2 
 
 		 412 aa  212  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0598  hypothetical protein  40.27 
 
 		 423 aa  209  8e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.279225 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0654  hypothetical protein  41.48 
 
 		 418 aa  206  8e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.301836 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2637  hypothetical protein  36.28 
 
 		 449 aa  155  8e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0655  hypothetical protein  35.71 
 
 		 412 aa  155  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.309052 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0603  hypothetical protein  31.73 
 
 		 442 aa  149  6e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.321779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5848  hypothetical protein  33.8 
 
 		 397 aa  147  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5989  hypothetical protein  34.5 
 
 		 459 aa  144  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.512618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0657  hypothetical protein  33.51 
 
 		 408 aa  143  5e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.471986 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6285  hypothetical protein  33.96 
 
 		 459 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0304852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4236  hypothetical protein  32.53 
 
 		 421 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.046998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0599  hypothetical protein  35.11 
 
 		 438 aa  126  6e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.277534 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4366  hypothetical protein  34.58 
 
 		 390 aa  123  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6380  hypothetical protein  32.99 
 
 		 459 aa  123  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.939684  normal  0.57119 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1800  hypothetical protein  31.87 
 
 		 409 aa  122  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.916404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3904  hypothetical protein  35.29 
 
 		 390 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0690  hypothetical protein  32.23 
 
 		 413 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.115844  normal  0.126108 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2994  hypothetical protein  33.78 
 
 		 403 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.658439  normal  0.272776 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5507  hypothetical protein  32.91 
 
 		 459 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5871  hypothetical protein  32.91 
 
 		 459 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.265551 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7209  hypothetical protein  33.5 
 
 		 459 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.87929 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0495  hypothetical protein  31.64 
 
 		 399 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6872  hypothetical protein  30.93 
 
 		 408 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.547088  normal  0.0747883 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4123  hypothetical protein  32.82 
 
 		 414 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.305787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2582  hypothetical protein  30.7 
 
 		 399 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0523  hypothetical protein  30.7 
 
 		 399 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2261  hypothetical protein  33.82 
 
 		 474 aa  95.1  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3076  hypothetical protein  32.54 
 
 		 474 aa  94.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.420987  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1304  hypothetical protein  32.54 
 
 		 474 aa  94.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2950  hypothetical protein  32.54 
 
 		 474 aa  94.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2534  hypothetical protein  30.15 
 
 		 403 aa  94.7  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2317  hypothetical protein  29.61 
 
 		 405 aa  89.7  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2824  hypothetical protein  33.12 
 
 		 401 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.207622  normal  0.323454 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7358  hypothetical protein  28.91 
 
 		 399 aa  68.6  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.930698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1637  hypothetical protein  29.1 
 
 		 428 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0705596  normal  0.0671021 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1919  hypothetical protein  29.62 
 
 		 426 aa  66.2  0.0000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.316747  normal  0.0774503 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2110  hypothetical protein  33.71 
 
 		 405 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1595  hypothetical protein  28.34 
 
 		 396 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.183842  normal  0.190287 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3499  hypothetical protein  30.53 
 
 		 397 aa  51.6  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.775188  normal  0.167132 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0727  hypothetical protein  30.08 
 
 		 439 aa  51.2  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.393605  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0479  mannosyltransferase  26.26 
 
 		 422 aa  42.7  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0468  mannosyltransferase  26.26 
 
 		 422 aa  42.7  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0455  mannosyltransferase  26.26 
 
 		 422 aa  42.7  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>