55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3499 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_3499  hypothetical protein  100 
 
 
397 aa  777    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.775188  normal  0.167132 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7358  hypothetical protein  35.93 
 
 
399 aa  147  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.930698  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4123  hypothetical protein  35.26 
 
 
414 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.305787  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5848  hypothetical protein  33.93 
 
 
397 aa  109  7.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0690  hypothetical protein  32.53 
 
 
413 aa  102  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.115844  normal  0.126108 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6872  hypothetical protein  32.65 
 
 
408 aa  100  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.547088  normal  0.0747883 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3904  hypothetical protein  32.39 
 
 
390 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4366  hypothetical protein  32.39 
 
 
390 aa  100  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6286  hypothetical protein  31.53 
 
 
469 aa  98.2  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0160508  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2637  hypothetical protein  31.05 
 
 
449 aa  95.1  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0603  hypothetical protein  29.79 
 
 
442 aa  94  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.321779  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6285  hypothetical protein  32.04 
 
 
459 aa  94  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0304852  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0655  hypothetical protein  33.09 
 
 
412 aa  91.7  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.309052 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5989  hypothetical protein  33.33 
 
 
459 aa  90.9  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.512618  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5990  hypothetical protein  30.87 
 
 
412 aa  89  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.838445  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0654  hypothetical protein  31.15 
 
 
418 aa  88.6  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.301836 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1800  hypothetical protein  30.28 
 
 
409 aa  87.8  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.916404  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0657  hypothetical protein  27.4 
 
 
408 aa  87.4  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.471986 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2582  hypothetical protein  31.91 
 
 
399 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0523  hypothetical protein  31.91 
 
 
399 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2994  hypothetical protein  34.89 
 
 
403 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.658439  normal  0.272776 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0495  hypothetical protein  32.34 
 
 
399 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5871  hypothetical protein  31.71 
 
 
459 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.265551 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5507  hypothetical protein  31.71 
 
 
459 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6380  hypothetical protein  32.32 
 
 
459 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.939684  normal  0.57119 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0598  hypothetical protein  33.1 
 
 
423 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.279225 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4236  hypothetical protein  30.39 
 
 
421 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.046998  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5506  hypothetical protein  32.04 
 
 
412 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5870  hypothetical protein  32.04 
 
 
412 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.26176 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7208  hypothetical protein  32.58 
 
 
412 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.798029  normal  0.91585 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2262  hypothetical protein  29.29 
 
 
414 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6379  hypothetical protein  31.82 
 
 
382 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.526995 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7209  hypothetical protein  32.31 
 
 
459 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.87929 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2636  hypothetical protein  29.04 
 
 
412 aa  73.2  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2534  hypothetical protein  28.57 
 
 
403 aa  70.1  0.00000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0599  hypothetical protein  28.49 
 
 
438 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.277534 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0540  hypothetical protein  32.52 
 
 
438 aa  67.8  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0800499  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2950  hypothetical protein  37.34 
 
 
474 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3076  hypothetical protein  37.34 
 
 
474 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.420987  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1304  hypothetical protein  37.34 
 
 
474 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2261  hypothetical protein  35.27 
 
 
474 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2951  hypothetical protein  28.49 
 
 
402 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3077  hypothetical protein  28.44 
 
 
402 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1305  hypothetical protein  28.44 
 
 
402 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0727  hypothetical protein  27.19 
 
 
439 aa  60.1  0.00000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.393605  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3937  hypothetical protein  28.42 
 
 
391 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.354956  normal  0.157719 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3501  hypothetical protein  29.9 
 
 
415 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.497805  hitchhiker  0.00127671 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2317  hypothetical protein  28.47 
 
 
405 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1637  hypothetical protein  30.65 
 
 
428 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0705596  normal  0.0671021 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1919  hypothetical protein  30.65 
 
 
426 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.316747  normal  0.0774503 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3430  hypothetical protein  28.1 
 
 
424 aa  53.9  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.133762  normal  0.448059 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2110  hypothetical protein  30.03 
 
 
405 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4343  hypothetical protein  30.55 
 
 
415 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4023  hypothetical protein  30.55 
 
 
415 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.785881  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1595  hypothetical protein  31.77 
 
 
396 aa  47  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.183842  normal  0.190287 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>