57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_3501 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_4343  hypothetical protein  96.39 
 
 
415 aa  696    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3501  hypothetical protein  100 
 
 
415 aa  807    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.497805  hitchhiker  0.00127671 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4023  hypothetical protein  96.39 
 
 
415 aa  696    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.785881  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3430  hypothetical protein  61.82 
 
 
424 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.133762  normal  0.448059 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2048  hypothetical protein  62.96 
 
 
417 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0235283  normal  0.0270325 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3937  hypothetical protein  62.23 
 
 
391 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.354956  normal  0.157719 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6286  hypothetical protein  44.44 
 
 
469 aa  288  1e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0160508  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5990  hypothetical protein  43.96 
 
 
412 aa  273  3e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.838445  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2262  hypothetical protein  45.37 
 
 
414 aa  268  1e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2951  hypothetical protein  46.17 
 
 
402 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5870  hypothetical protein  45.22 
 
 
412 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.26176 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5506  hypothetical protein  45.22 
 
 
412 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7208  hypothetical protein  44.42 
 
 
412 aa  256  6e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.798029  normal  0.91585 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3077  hypothetical protein  46.43 
 
 
402 aa  256  7e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1305  hypothetical protein  46.43 
 
 
402 aa  256  7e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6379  hypothetical protein  47.09 
 
 
382 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.526995 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0540  hypothetical protein  38.78 
 
 
438 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0800499  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2636  hypothetical protein  40.9 
 
 
412 aa  227  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0654  hypothetical protein  39.17 
 
 
418 aa  224  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.301836 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0598  hypothetical protein  38.52 
 
 
423 aa  218  2e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.279225 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0603  hypothetical protein  32.14 
 
 
442 aa  166  8e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.321779  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0655  hypothetical protein  36.41 
 
 
412 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.309052 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0657  hypothetical protein  34.34 
 
 
408 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.471986 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2637  hypothetical protein  32.76 
 
 
449 aa  159  7e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5989  hypothetical protein  33.16 
 
 
459 aa  143  5e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.512618  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5848  hypothetical protein  31.08 
 
 
397 aa  140  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6285  hypothetical protein  32.4 
 
 
459 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0304852  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0599  hypothetical protein  33.89 
 
 
438 aa  137  5e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.277534 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6380  hypothetical protein  31.77 
 
 
459 aa  130  6e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.939684  normal  0.57119 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0523  hypothetical protein  32.09 
 
 
399 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2582  hypothetical protein  32.09 
 
 
399 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4236  hypothetical protein  31.69 
 
 
421 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.046998  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4366  hypothetical protein  33.43 
 
 
390 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0495  hypothetical protein  32.61 
 
 
399 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5507  hypothetical protein  31.03 
 
 
459 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5871  hypothetical protein  31.03 
 
 
459 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.265551 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6872  hypothetical protein  31.05 
 
 
408 aa  121  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.547088  normal  0.0747883 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3904  hypothetical protein  34.15 
 
 
390 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7209  hypothetical protein  32.57 
 
 
459 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.87929 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1800  hypothetical protein  29.07 
 
 
409 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.916404  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2950  hypothetical protein  34.81 
 
 
474 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1304  hypothetical protein  34.81 
 
 
474 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3076  hypothetical protein  34.81 
 
 
474 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.420987  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4123  hypothetical protein  30.43 
 
 
414 aa  113  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.305787  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2994  hypothetical protein  33.23 
 
 
403 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.658439  normal  0.272776 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2534  hypothetical protein  31.69 
 
 
403 aa  109  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0690  hypothetical protein  32.48 
 
 
413 aa  107  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.115844  normal  0.126108 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2261  hypothetical protein  32.6 
 
 
474 aa  104  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2317  hypothetical protein  29.34 
 
 
405 aa  94.4  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2824  hypothetical protein  31.8 
 
 
401 aa  84  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.207622  normal  0.323454 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7358  hypothetical protein  28.03 
 
 
399 aa  67.8  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.930698  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1919  hypothetical protein  29.69 
 
 
426 aa  64.3  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.316747  normal  0.0774503 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1637  hypothetical protein  29.13 
 
 
428 aa  63.5  0.000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0705596  normal  0.0671021 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3499  hypothetical protein  31.75 
 
 
397 aa  57  0.0000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.775188  normal  0.167132 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1595  hypothetical protein  25.58 
 
 
396 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.183842  normal  0.190287 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0727  hypothetical protein  29.56 
 
 
439 aa  48.1  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.393605  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2110  hypothetical protein  35.8 
 
 
405 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>