57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A2951 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A1305  hypothetical protein  99.75 
 
 
402 aa  776    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2951  hypothetical protein  100 
 
 
402 aa  779    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3077  hypothetical protein  99.75 
 
 
402 aa  776    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2262  hypothetical protein  91.81 
 
 
414 aa  633  1e-180  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7208  hypothetical protein  52.3 
 
 
412 aa  362  8e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.798029  normal  0.91585 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6286  hypothetical protein  51.12 
 
 
469 aa  362  8e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0160508  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5506  hypothetical protein  53.71 
 
 
412 aa  344  2e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5870  hypothetical protein  53.71 
 
 
412 aa  344  2e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.26176 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5990  hypothetical protein  50.12 
 
 
412 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.838445  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6379  hypothetical protein  54.42 
 
 
382 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.526995 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3430  hypothetical protein  47.31 
 
 
424 aa  293  3e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.133762  normal  0.448059 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3937  hypothetical protein  49.04 
 
 
391 aa  293  4e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.354956  normal  0.157719 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2048  hypothetical protein  50 
 
 
417 aa  291  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0235283  normal  0.0270325 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3501  hypothetical protein  46.17 
 
 
415 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.497805  hitchhiker  0.00127671 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4343  hypothetical protein  45.66 
 
 
415 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4023  hypothetical protein  45.66 
 
 
415 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.785881  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0598  hypothetical protein  44.17 
 
 
423 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.279225 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2636  hypothetical protein  42.09 
 
 
412 aa  248  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0540  hypothetical protein  41.28 
 
 
438 aa  242  9e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0800499  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0654  hypothetical protein  42.93 
 
 
418 aa  231  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.301836 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0603  hypothetical protein  36.78 
 
 
442 aa  195  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.321779  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2637  hypothetical protein  35.53 
 
 
449 aa  164  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0657  hypothetical protein  35.28 
 
 
408 aa  163  6e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.471986 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0655  hypothetical protein  36.16 
 
 
412 aa  161  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.309052 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5848  hypothetical protein  34.18 
 
 
397 aa  161  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2994  hypothetical protein  38.53 
 
 
403 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.658439  normal  0.272776 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0599  hypothetical protein  34.55 
 
 
438 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.277534 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4366  hypothetical protein  35.17 
 
 
390 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4123  hypothetical protein  34.7 
 
 
414 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.305787  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2582  hypothetical protein  34.87 
 
 
399 aa  137  5e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0523  hypothetical protein  34.87 
 
 
399 aa  137  5e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5989  hypothetical protein  30.05 
 
 
459 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.512618  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1800  hypothetical protein  32.06 
 
 
409 aa  135  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.916404  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3904  hypothetical protein  34.86 
 
 
390 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6285  hypothetical protein  30.94 
 
 
459 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0304852  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0495  hypothetical protein  35.29 
 
 
399 aa  133  6e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4236  hypothetical protein  32.17 
 
 
421 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.046998  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1304  hypothetical protein  35.67 
 
 
474 aa  124  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2950  hypothetical protein  35.67 
 
 
474 aa  124  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3076  hypothetical protein  35.67 
 
 
474 aa  124  4e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.420987  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5507  hypothetical protein  32.06 
 
 
459 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5871  hypothetical protein  32.06 
 
 
459 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.265551 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6380  hypothetical protein  31.55 
 
 
459 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.939684  normal  0.57119 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2261  hypothetical protein  35.07 
 
 
474 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6872  hypothetical protein  31.8 
 
 
408 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.547088  normal  0.0747883 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7209  hypothetical protein  32.66 
 
 
459 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.87929 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0690  hypothetical protein  33.56 
 
 
413 aa  106  7e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.115844  normal  0.126108 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2317  hypothetical protein  31.27 
 
 
405 aa  99.8  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2534  hypothetical protein  32.33 
 
 
403 aa  91.3  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2824  hypothetical protein  34.75 
 
 
401 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.207622  normal  0.323454 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7358  hypothetical protein  30.77 
 
 
399 aa  81.3  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.930698  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3499  hypothetical protein  29.04 
 
 
397 aa  63.5  0.000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.775188  normal  0.167132 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1919  hypothetical protein  31.76 
 
 
426 aa  63.5  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.316747  normal  0.0774503 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2110  hypothetical protein  33.7 
 
 
405 aa  63.2  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1637  hypothetical protein  30.59 
 
 
428 aa  62  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0705596  normal  0.0671021 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1595  hypothetical protein  28.12 
 
 
396 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.183842  normal  0.190287 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0727  hypothetical protein  27.88 
 
 
439 aa  48.5  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.393605  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>