57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7208 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7208  hypothetical protein  100 
 
 
412 aa  801    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.798029  normal  0.91585 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5506  hypothetical protein  87.14 
 
 
412 aa  630  1e-179  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5870  hypothetical protein  87.14 
 
 
412 aa  630  1e-179  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.26176 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6379  hypothetical protein  86.65 
 
 
382 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.526995 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6286  hypothetical protein  75.49 
 
 
469 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0160508  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5990  hypothetical protein  75.24 
 
 
412 aa  557  1e-157  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.838445  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2262  hypothetical protein  50.37 
 
 
414 aa  332  9e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2951  hypothetical protein  52.3 
 
 
402 aa  325  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1305  hypothetical protein  52.55 
 
 
402 aa  319  6e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3077  hypothetical protein  52.55 
 
 
402 aa  319  6e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3430  hypothetical protein  46.8 
 
 
424 aa  272  9e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.133762  normal  0.448059 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3937  hypothetical protein  45.71 
 
 
391 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.354956  normal  0.157719 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0540  hypothetical protein  46.21 
 
 
438 aa  259  6e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0800499  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3501  hypothetical protein  44.42 
 
 
415 aa  257  3e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.497805  hitchhiker  0.00127671 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2636  hypothetical protein  43.73 
 
 
412 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2048  hypothetical protein  43.48 
 
 
417 aa  254  3e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0235283  normal  0.0270325 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0598  hypothetical protein  44.19 
 
 
423 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.279225 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4023  hypothetical protein  44.66 
 
 
415 aa  242  7e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.785881  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4343  hypothetical protein  44.66 
 
 
415 aa  242  7e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0654  hypothetical protein  43.58 
 
 
418 aa  237  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.301836 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0655  hypothetical protein  34.79 
 
 
412 aa  168  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.309052 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5989  hypothetical protein  32.76 
 
 
459 aa  156  7e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.512618  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2637  hypothetical protein  31.81 
 
 
449 aa  155  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6285  hypothetical protein  32.84 
 
 
459 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0304852  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0599  hypothetical protein  35.28 
 
 
438 aa  147  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.277534 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1800  hypothetical protein  32.92 
 
 
409 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.916404  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0603  hypothetical protein  32.18 
 
 
442 aa  145  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.321779  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4123  hypothetical protein  33.6 
 
 
414 aa  142  8e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.305787  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6380  hypothetical protein  34.15 
 
 
459 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.939684  normal  0.57119 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0657  hypothetical protein  33.92 
 
 
408 aa  140  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.471986 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5507  hypothetical protein  33.41 
 
 
459 aa  141  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5871  hypothetical protein  33.41 
 
 
459 aa  141  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.265551 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2261  hypothetical protein  35.38 
 
 
474 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4236  hypothetical protein  32.35 
 
 
421 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.046998  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5848  hypothetical protein  28.83 
 
 
397 aa  125  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2950  hypothetical protein  35 
 
 
474 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1304  hypothetical protein  35 
 
 
474 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3076  hypothetical protein  35 
 
 
474 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.420987  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7209  hypothetical protein  32.78 
 
 
459 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.87929 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2582  hypothetical protein  32.13 
 
 
399 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0523  hypothetical protein  32.13 
 
 
399 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3904  hypothetical protein  34.15 
 
 
390 aa  110  6e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4366  hypothetical protein  33.63 
 
 
390 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0495  hypothetical protein  32.32 
 
 
399 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0690  hypothetical protein  31.54 
 
 
413 aa  106  6e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.115844  normal  0.126108 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6872  hypothetical protein  32.55 
 
 
408 aa  103  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.547088  normal  0.0747883 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2994  hypothetical protein  32.57 
 
 
403 aa  101  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.658439  normal  0.272776 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2317  hypothetical protein  31.1 
 
 
405 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2534  hypothetical protein  29.22 
 
 
403 aa  89  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1637  hypothetical protein  32.65 
 
 
428 aa  76.6  0.0000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0705596  normal  0.0671021 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0727  hypothetical protein  30.72 
 
 
439 aa  75.1  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.393605  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1919  hypothetical protein  32.99 
 
 
426 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.316747  normal  0.0774503 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2824  hypothetical protein  34.16 
 
 
401 aa  70.1  0.00000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.207622  normal  0.323454 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7358  hypothetical protein  30.9 
 
 
399 aa  68.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.930698  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1595  hypothetical protein  29.73 
 
 
396 aa  66.2  0.0000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.183842  normal  0.190287 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3499  hypothetical protein  33.81 
 
 
397 aa  60.8  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.775188  normal  0.167132 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2110  hypothetical protein  32.55 
 
 
405 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>