57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6285 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_6285  hypothetical protein  100 
 
 		 459 aa  906    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0304852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5989  hypothetical protein  95.86 
 
 		 459 aa  872    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.512618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5507  hypothetical protein  76.69 
 
 		 459 aa  634  1e-180  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5871  hypothetical protein  76.69 
 
 		 459 aa  634  1e-180  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.265551 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6380  hypothetical protein  76.25 
 
 		 459 aa  633  1e-180  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.939684  normal  0.57119 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7209  hypothetical protein  76.18 
 
 		 459 aa  589  1e-167  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.87929 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2950  hypothetical protein  58.42 
 
 		 474 aa  360  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3076  hypothetical protein  58.42 
 
 		 474 aa  360  2e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.420987  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1304  hypothetical protein  58.42 
 
 		 474 aa  360  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2261  hypothetical protein  58.44 
 
 		 474 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2637  hypothetical protein  41.79 
 
 		 449 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0599  hypothetical protein  40.59 
 
 		 438 aa  211  3e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.277534 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0655  hypothetical protein  41.43 
 
 		 412 aa  203  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.309052 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0603  hypothetical protein  36.32 
 
 		 442 aa  182  8.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.321779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0598  hypothetical protein  36.27 
 
 		 423 aa  160  4e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.279225 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4123  hypothetical protein  33.06 
 
 		 414 aa  159  8e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.305787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2636  hypothetical protein  33.98 
 
 		 412 aa  159  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0540  hypothetical protein  32.68 
 
 		 438 aa  155  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0800499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0654  hypothetical protein  35.79 
 
 		 418 aa  153  7e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.301836 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0657  hypothetical protein  33.83 
 
 		 408 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.471986 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6286  hypothetical protein  31.71 
 
 		 469 aa  146  9e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0160508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4236  hypothetical protein  30.17 
 
 		 421 aa  143  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.046998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6872  hypothetical protein  34.94 
 
 		 408 aa  142  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.547088  normal  0.0747883 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7208  hypothetical protein  32.84 
 
 		 412 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.798029  normal  0.91585 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5848  hypothetical protein  33.51 
 
 		 397 aa  139  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5990  hypothetical protein  31.71 
 
 		 412 aa  137  5e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.838445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1800  hypothetical protein  28.28 
 
 		 409 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.916404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5870  hypothetical protein  32.52 
 
 		 412 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.26176 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3501  hypothetical protein  31.97 
 
 		 415 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.497805  hitchhiker  0.00127671 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5506  hypothetical protein  32.52 
 
 		 412 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2048  hypothetical protein  32.48 
 
 		 417 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0235283  normal  0.0270325 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3937  hypothetical protein  33.96 
 
 		 391 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.354956  normal  0.157719 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0495  hypothetical protein  34.44 
 
 		 399 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2994  hypothetical protein  35.15 
 
 		 403 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.658439  normal  0.272776 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6379  hypothetical protein  33.33 
 
 		 382 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.526995 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3430  hypothetical protein  32.93 
 
 		 424 aa  117  6e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.133762  normal  0.448059 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2582  hypothetical protein  33.42 
 
 		 399 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0523  hypothetical protein  33.42 
 
 		 399 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4366  hypothetical protein  39.16 
 
 		 390 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4343  hypothetical protein  32.05 
 
 		 415 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2534  hypothetical protein  33.33 
 
 		 403 aa  108  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4023  hypothetical protein  32.05 
 
 		 415 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.785881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2262  hypothetical protein  29.23 
 
 		 414 aa  107  6e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3904  hypothetical protein  38.46 
 
 		 390 aa  103  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2317  hypothetical protein  31.7 
 
 		 405 aa  103  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0690  hypothetical protein  32.11 
 
 		 413 aa  100  6e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.115844  normal  0.126108 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2951  hypothetical protein  29.89 
 
 		 402 aa  98.6  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1637  hypothetical protein  34.42 
 
 		 428 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0705596  normal  0.0671021 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1305  hypothetical protein  29.95 
 
 		 402 aa  92.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3077  hypothetical protein  29.95 
 
 		 402 aa  92.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1919  hypothetical protein  34.42 
 
 		 426 aa  91.7  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.316747  normal  0.0774503 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2824  hypothetical protein  31.91 
 
 		 401 aa  90.5  6e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.207622  normal  0.323454 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7358  hypothetical protein  29.64 
 
 		 399 aa  85.1  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.930698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0727  hypothetical protein  31.78 
 
 		 439 aa  80.9  0.00000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.393605  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1595  hypothetical protein  31.97 
 
 		 396 aa  80.1  0.00000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.183842  normal  0.190287 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2110  hypothetical protein  29.97 
 
 		 405 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3499  hypothetical protein  30.91 
 
 		 397 aa  57  0.0000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.775188  normal  0.167132 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>