57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6379 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008062  Bcen_5506  hypothetical protein  99.21 
 
 
412 aa  734    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6379  hypothetical protein  100 
 
 
382 aa  737    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.526995 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5870  hypothetical protein  99.21 
 
 
412 aa  734    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.26176 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7208  hypothetical protein  86.65 
 
 
412 aa  594  1e-169  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.798029  normal  0.91585 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6286  hypothetical protein  74.61 
 
 
469 aa  519  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0160508  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5990  hypothetical protein  74.08 
 
 
412 aa  499  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.838445  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2262  hypothetical protein  53.85 
 
 
414 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2951  hypothetical protein  54.42 
 
 
402 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1305  hypothetical protein  54.69 
 
 
402 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3077  hypothetical protein  54.69 
 
 
402 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3937  hypothetical protein  48.28 
 
 
391 aa  276  6e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.354956  normal  0.157719 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3430  hypothetical protein  48.55 
 
 
424 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.133762  normal  0.448059 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2048  hypothetical protein  47.03 
 
 
417 aa  257  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0235283  normal  0.0270325 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3501  hypothetical protein  46.5 
 
 
415 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.497805  hitchhiker  0.00127671 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0598  hypothetical protein  46.52 
 
 
423 aa  253  3e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.279225 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0540  hypothetical protein  45.81 
 
 
438 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0800499  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2636  hypothetical protein  43.8 
 
 
412 aa  248  9e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4023  hypothetical protein  45.93 
 
 
415 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.785881  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4343  hypothetical protein  45.93 
 
 
415 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0654  hypothetical protein  45 
 
 
418 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.301836 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0655  hypothetical protein  35.92 
 
 
412 aa  157  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.309052 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0603  hypothetical protein  34.9 
 
 
442 aa  152  8.999999999999999e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.321779  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2637  hypothetical protein  34.41 
 
 
449 aa  151  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5989  hypothetical protein  33.05 
 
 
459 aa  146  5e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.512618  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0657  hypothetical protein  35.04 
 
 
408 aa  145  8.000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.471986 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6285  hypothetical protein  33.05 
 
 
459 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0304852  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4236  hypothetical protein  34.3 
 
 
421 aa  137  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.046998  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4123  hypothetical protein  34.84 
 
 
414 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.305787  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0599  hypothetical protein  34.78 
 
 
438 aa  134  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.277534 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5507  hypothetical protein  35.36 
 
 
459 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5871  hypothetical protein  35.36 
 
 
459 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.265551 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6380  hypothetical protein  35.08 
 
 
459 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.939684  normal  0.57119 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1800  hypothetical protein  32.8 
 
 
409 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.916404  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5848  hypothetical protein  30.53 
 
 
397 aa  123  7e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2261  hypothetical protein  37.22 
 
 
474 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0690  hypothetical protein  31.88 
 
 
413 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.115844  normal  0.126108 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2994  hypothetical protein  33.55 
 
 
403 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.658439  normal  0.272776 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3904  hypothetical protein  34.75 
 
 
390 aa  109  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4366  hypothetical protein  34.5 
 
 
390 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1304  hypothetical protein  36.1 
 
 
474 aa  107  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3076  hypothetical protein  36.1 
 
 
474 aa  107  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.420987  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2950  hypothetical protein  36.1 
 
 
474 aa  107  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6872  hypothetical protein  32.9 
 
 
408 aa  106  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.547088  normal  0.0747883 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7209  hypothetical protein  33.96 
 
 
459 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.87929 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2582  hypothetical protein  33.92 
 
 
399 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0523  hypothetical protein  33.92 
 
 
399 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0495  hypothetical protein  33.42 
 
 
399 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2317  hypothetical protein  31.53 
 
 
405 aa  92.4  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2534  hypothetical protein  32.68 
 
 
403 aa  90.1  5e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2824  hypothetical protein  34.98 
 
 
401 aa  79.7  0.00000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.207622  normal  0.323454 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0727  hypothetical protein  30.06 
 
 
439 aa  72.8  0.000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.393605  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1637  hypothetical protein  32.88 
 
 
428 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0705596  normal  0.0671021 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1919  hypothetical protein  31.85 
 
 
426 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.316747  normal  0.0774503 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7358  hypothetical protein  29.81 
 
 
399 aa  67.8  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.930698  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1595  hypothetical protein  30.61 
 
 
396 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.183842  normal  0.190287 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3499  hypothetical protein  33.49 
 
 
397 aa  62.8  0.000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.775188  normal  0.167132 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2110  hypothetical protein  32.09 
 
 
405 aa  57.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>