57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_4343 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_4343  hypothetical protein  100 
 
 
415 aa  803    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3501  hypothetical protein  96.39 
 
 
415 aa  717    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.497805  hitchhiker  0.00127671 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4023  hypothetical protein  100 
 
 
415 aa  803    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.785881  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3430  hypothetical protein  61.58 
 
 
424 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.133762  normal  0.448059 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2048  hypothetical protein  62.22 
 
 
417 aa  404  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0235283  normal  0.0270325 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3937  hypothetical protein  61.7 
 
 
391 aa  388  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.354956  normal  0.157719 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6286  hypothetical protein  43.96 
 
 
469 aa  282  9e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0160508  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5990  hypothetical protein  43.48 
 
 
412 aa  268  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.838445  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2262  hypothetical protein  46.06 
 
 
414 aa  261  1e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2951  hypothetical protein  45.66 
 
 
402 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5870  hypothetical protein  45.57 
 
 
412 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.26176 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7208  hypothetical protein  44.66 
 
 
412 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.798029  normal  0.91585 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5506  hypothetical protein  45.57 
 
 
412 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3077  hypothetical protein  45.92 
 
 
402 aa  250  3e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1305  hypothetical protein  45.92 
 
 
402 aa  250  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6379  hypothetical protein  46.47 
 
 
382 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.526995 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0540  hypothetical protein  39.55 
 
 
438 aa  236  4e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0800499  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0654  hypothetical protein  39.56 
 
 
418 aa  226  6e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.301836 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2636  hypothetical protein  40.1 
 
 
412 aa  224  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0598  hypothetical protein  39.3 
 
 
423 aa  220  3.9999999999999997e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.279225 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0655  hypothetical protein  37.54 
 
 
412 aa  170  4e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.309052 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0657  hypothetical protein  34.61 
 
 
408 aa  168  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.471986 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0603  hypothetical protein  33.58 
 
 
442 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.321779  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2637  hypothetical protein  34.1 
 
 
449 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5989  hypothetical protein  33.25 
 
 
459 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.512618  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5848  hypothetical protein  31.09 
 
 
397 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6285  hypothetical protein  32.48 
 
 
459 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0304852  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0599  hypothetical protein  34.44 
 
 
438 aa  133  6e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.277534 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6380  hypothetical protein  32.59 
 
 
459 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.939684  normal  0.57119 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4236  hypothetical protein  32.15 
 
 
421 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.046998  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0523  hypothetical protein  33.15 
 
 
399 aa  126  7e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2582  hypothetical protein  33.15 
 
 
399 aa  126  7e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6872  hypothetical protein  31.7 
 
 
408 aa  124  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.547088  normal  0.0747883 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5507  hypothetical protein  31.85 
 
 
459 aa  124  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5871  hypothetical protein  31.85 
 
 
459 aa  124  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.265551 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4366  hypothetical protein  34.88 
 
 
390 aa  123  6e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0495  hypothetical protein  32.87 
 
 
399 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1800  hypothetical protein  30.25 
 
 
409 aa  121  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.916404  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4123  hypothetical protein  31.79 
 
 
414 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.305787  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7209  hypothetical protein  33.71 
 
 
459 aa  119  7e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.87929 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3904  hypothetical protein  33.85 
 
 
390 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2950  hypothetical protein  35.73 
 
 
474 aa  113  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1304  hypothetical protein  35.73 
 
 
474 aa  113  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3076  hypothetical protein  35.73 
 
 
474 aa  113  5e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.420987  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2994  hypothetical protein  34.7 
 
 
403 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.658439  normal  0.272776 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2534  hypothetical protein  32.29 
 
 
403 aa  110  6e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0690  hypothetical protein  33.33 
 
 
413 aa  109  9.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.115844  normal  0.126108 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2261  hypothetical protein  33.75 
 
 
474 aa  102  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2317  hypothetical protein  29.48 
 
 
405 aa  90.5  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2824  hypothetical protein  32.86 
 
 
401 aa  86.3  9e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.207622  normal  0.323454 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7358  hypothetical protein  29.05 
 
 
399 aa  69.3  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.930698  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1637  hypothetical protein  28.69 
 
 
428 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0705596  normal  0.0671021 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1919  hypothetical protein  28.98 
 
 
426 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.316747  normal  0.0774503 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3499  hypothetical protein  32.04 
 
 
397 aa  57.8  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.775188  normal  0.167132 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1595  hypothetical protein  26.16 
 
 
396 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.183842  normal  0.190287 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2110  hypothetical protein  37.5 
 
 
405 aa  50.4  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0727  hypothetical protein  29.56 
 
 
439 aa  48.1  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.393605  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>