55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2317 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_2317  hypothetical protein  100 
 
 
405 aa  763    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4236  hypothetical protein  35.42 
 
 
421 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.046998  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4123  hypothetical protein  35.86 
 
 
414 aa  176  5e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.305787  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1800  hypothetical protein  32.65 
 
 
409 aa  154  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.916404  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2637  hypothetical protein  33.43 
 
 
449 aa  139  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0655  hypothetical protein  35.17 
 
 
412 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.309052 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2994  hypothetical protein  40.07 
 
 
403 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.658439  normal  0.272776 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6285  hypothetical protein  31.36 
 
 
459 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0304852  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5848  hypothetical protein  33.33 
 
 
397 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5989  hypothetical protein  31.36 
 
 
459 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.512618  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6872  hypothetical protein  34.11 
 
 
408 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.547088  normal  0.0747883 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2636  hypothetical protein  32.82 
 
 
412 aa  114  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0657  hypothetical protein  28.93 
 
 
408 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.471986 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0654  hypothetical protein  35.61 
 
 
418 aa  112  9e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.301836 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0690  hypothetical protein  33.13 
 
 
413 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.115844  normal  0.126108 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0603  hypothetical protein  31.14 
 
 
442 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.321779  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0540  hypothetical protein  30.89 
 
 
438 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0800499  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0599  hypothetical protein  31.25 
 
 
438 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.277534 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7208  hypothetical protein  30.65 
 
 
412 aa  100  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.798029  normal  0.91585 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6286  hypothetical protein  28.23 
 
 
469 aa  99  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0160508  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5506  hypothetical protein  31.37 
 
 
412 aa  95.9  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5870  hypothetical protein  31.37 
 
 
412 aa  95.9  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.26176 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3501  hypothetical protein  30.27 
 
 
415 aa  95.1  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.497805  hitchhiker  0.00127671 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5507  hypothetical protein  30.32 
 
 
459 aa  94.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5871  hypothetical protein  30.32 
 
 
459 aa  94.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.265551 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3904  hypothetical protein  32.94 
 
 
390 aa  93.6  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6380  hypothetical protein  30.41 
 
 
459 aa  92.8  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.939684  normal  0.57119 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2950  hypothetical protein  34.12 
 
 
474 aa  92.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3076  hypothetical protein  34.12 
 
 
474 aa  92.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.420987  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4366  hypothetical protein  32.16 
 
 
390 aa  92.4  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1304  hypothetical protein  34.12 
 
 
474 aa  92.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0598  hypothetical protein  32 
 
 
423 aa  91.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.279225 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6379  hypothetical protein  32.22 
 
 
382 aa  89.4  9e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.526995 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0495  hypothetical protein  30.71 
 
 
399 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2262  hypothetical protein  29.5 
 
 
414 aa  88.2  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5990  hypothetical protein  27.97 
 
 
412 aa  87  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.838445  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0523  hypothetical protein  29.95 
 
 
399 aa  86.3  8e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2582  hypothetical protein  29.95 
 
 
399 aa  86.3  8e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2951  hypothetical protein  30.1 
 
 
402 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2534  hypothetical protein  31.79 
 
 
403 aa  84.3  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3077  hypothetical protein  30.35 
 
 
402 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1305  hypothetical protein  30.35 
 
 
402 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2261  hypothetical protein  34.33 
 
 
474 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7209  hypothetical protein  31.25 
 
 
459 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.87929 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4023  hypothetical protein  30.65 
 
 
415 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.785881  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4343  hypothetical protein  30.65 
 
 
415 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3937  hypothetical protein  29.85 
 
 
391 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.354956  normal  0.157719 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3430  hypothetical protein  29.04 
 
 
424 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.133762  normal  0.448059 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2110  hypothetical protein  31.56 
 
 
405 aa  63.9  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7358  hypothetical protein  26.94 
 
 
399 aa  62.8  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.930698  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2824  hypothetical protein  30.39 
 
 
401 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.207622  normal  0.323454 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2048  hypothetical protein  29.3 
 
 
417 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0235283  normal  0.0270325 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0727  hypothetical protein  32.12 
 
 
439 aa  51.2  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.393605  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1595  hypothetical protein  28.93 
 
 
396 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.183842  normal  0.190287 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0229  hypothetical protein  25.35 
 
 
393 aa  44.3  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>