121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_5097 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_5097  hypothetical protein  100 
 
 
165 aa  325  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4780  hypothetical protein  65.81 
 
 
183 aa  208  3e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.786292 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1856  hypothetical protein  61.82 
 
 
167 aa  198  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.542717 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1417  protein YciF  61.82 
 
 
167 aa  198  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.341518  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1919  hypothetical protein  61.21 
 
 
167 aa  195  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.137818  hitchhiker  0.0000284113 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1861  protein YciF  61.21 
 
 
167 aa  195  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.919479 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1599  hypothetical protein  61.21 
 
 
167 aa  195  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.154464 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1874  YciF protein  60.61 
 
 
173 aa  193  8.000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000112449 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1889  YciF protein  60.61 
 
 
173 aa  193  8.000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0111142 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01232  hypothetical protein  60.61 
 
 
166 aa  193  1e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2390  protein of unknown function DUF892  60.61 
 
 
166 aa  193  1e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0588252  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01242  hypothetical protein  60.61 
 
 
166 aa  193  1e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1367  YciF protein  60.61 
 
 
166 aa  193  1e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.177269  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1456  YciF protein  60.61 
 
 
166 aa  193  1e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000775316  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2369  hypothetical protein  60.61 
 
 
166 aa  193  1e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.820184  hitchhiker  0.000000156892 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1647  YciF protein  60.39 
 
 
166 aa  184  4e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3127  hypothetical protein  61.04 
 
 
164 aa  182  1.0000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.136423 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4247  hypothetical protein  56.52 
 
 
158 aa  172  2.9999999999999996e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0753724 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3186  hypothetical protein  53.7 
 
 
174 aa  166  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4465  protein of unknown function DUF892  46.67 
 
 
168 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0289  protein of unknown function DUF892  45.96 
 
 
162 aa  150  1e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.302406 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1470  hypothetical protein  46.67 
 
 
168 aa  148  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0321654  normal  0.306321 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2066  hypothetical protein  49.35 
 
 
195 aa  148  3e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0139243 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5596  hypothetical protein  48.78 
 
 
166 aa  147  4e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.756785  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1657  hypothetical protein  49.33 
 
 
168 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0448276  normal  0.877202 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1033  hypothetical protein  48.32 
 
 
168 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.665565  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5592  protein of unknown function DUF892  48.37 
 
 
166 aa  144  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.544575  hitchhiker  0.00495302 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5614  protein of unknown function DUF892  48.37 
 
 
168 aa  144  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.255585 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3832  hypothetical protein  49.33 
 
 
168 aa  143  9e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.148177  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3365  hypothetical protein  52.7 
 
 
198 aa  143  9e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.430964  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4845  protein of unknown function DUF892  45.86 
 
 
167 aa  143  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00641789  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4540  protein of unknown function DUF892  45.22 
 
 
165 aa  140  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.369842 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1136  hypothetical protein  46.91 
 
 
165 aa  140  9e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3730  protein of unknown function DUF892  46.45 
 
 
169 aa  140  9e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4071  hypothetical protein  50 
 
 
168 aa  140  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0479613  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0993  protein of unknown function DUF892  47.1 
 
 
217 aa  138  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3623  hypothetical protein  46.45 
 
 
169 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0183446 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3294  hypothetical protein  45.34 
 
 
163 aa  137  7e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.335875 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2984  hypothetical protein  50.67 
 
 
164 aa  136  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.602458 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4862  hypothetical protein  49.68 
 
 
177 aa  135  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5347  protein of unknown function DUF892  49.68 
 
 
167 aa  135  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5401  protein of unknown function DUF892  49.68 
 
 
167 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.949113 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2659  hypothetical protein  49.32 
 
 
217 aa  134  4e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4275  protein of unknown function DUF892  43.31 
 
 
165 aa  134  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1370  protein of unknown function DUF892  42.14 
 
 
168 aa  134  5e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5546  hypothetical protein  46 
 
 
168 aa  133  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.376366  normal  0.380191 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3491  hypothetical protein  45.64 
 
 
163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0196  hypothetical protein  47.02 
 
 
169 aa  132  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5257  protein of unknown function DUF892  44.72 
 
 
162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3141  hypothetical protein  46.67 
 
 
189 aa  131  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51971  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3526  hypothetical protein  41.4 
 
 
164 aa  131  5e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2646  hypothetical protein  47.3 
 
 
189 aa  131  5e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1308  protein of unknown function DUF892  44.16 
 
 
191 aa  130  6e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.758326  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1727  protein of unknown function DUF892  43.51 
 
 
184 aa  130  9e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403983  hitchhiker  0.000459015 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2256  hypothetical protein  43.87 
 
 
169 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.949168  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1730  hypothetical protein  44.97 
 
 
165 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.666521  decreased coverage  0.00187959 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3218  hypothetical protein  46 
 
 
167 aa  129  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.708155  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6464  hypothetical protein  48.41 
 
 
167 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.255827  normal  0.636279 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4833  protein of unknown function DUF892  49.33 
 
 
180 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4791  hypothetical protein  43.95 
 
 
165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2390  protein of unknown function DUF892  44.37 
 
 
196 aa  127  8.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.421917  normal  0.147329 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4158  protein of unknown function DUF892  43.95 
 
 
162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4912  hypothetical protein  48.32 
 
 
164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.550913 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0740  hypothetical protein  46.31 
 
 
192 aa  124  5e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0036  hypothetical protein  48 
 
 
175 aa  124  6e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0130409 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2487  protein of unknown function DUF892  42.21 
 
 
247 aa  124  7e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.48482  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7975  protein of unknown function DUF892  45.03 
 
 
179 aa  122  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1446  hypothetical protein  42.24 
 
 
165 aa  120  6e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.187122  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1820  hypothetical protein  49.66 
 
 
169 aa  120  7e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.418457  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3563  hypothetical protein  44.94 
 
 
166 aa  120  7e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.892765  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0468  hypothetical protein  49.66 
 
 
165 aa  120  8e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.53229  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3057  hypothetical protein  47.92 
 
 
165 aa  120  8e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.460854  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2220  protein of unknown function DUF892  45.03 
 
 
175 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2489  non-heme manganese-containing catalase  46.62 
 
 
421 aa  118  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4247  protein of unknown function DUF892  45.51 
 
 
166 aa  119  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1737  hypothetical protein  44.59 
 
 
166 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.997374  normal  0.0699743 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2545  hypothetical protein  42.21 
 
 
168 aa  115  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2862  protein of unknown function DUF892  44.37 
 
 
168 aa  115  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.217094  normal  0.674493 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2670  hypothetical protein  44.37 
 
 
167 aa  115  3e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0525668  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2287  hypothetical protein  42.67 
 
 
168 aa  115  3.9999999999999997e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2664  hypothetical protein  45.33 
 
 
165 aa  114  5e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.104786  normal  0.942807 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1026  hypothetical protein  42.48 
 
 
187 aa  112  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.158329  hitchhiker  0.000105516 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1678  hypothetical protein  44.59 
 
 
166 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.108531  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3827  hypothetical protein  47.58 
 
 
149 aa  110  6e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1599  protein of unknown function DUF892  41.56 
 
 
164 aa  110  8.000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0568744  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0088  ycfI, putative structural proteins  43.31 
 
 
166 aa  108  3e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.136593  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1724  hypothetical protein  43.31 
 
 
166 aa  108  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3614  hypothetical protein  42.68 
 
 
180 aa  108  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4295  hypothetical protein  42.68 
 
 
167 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3906  protein of unknown function DUF892  42.68 
 
 
180 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3344  protein of unknown function DUF892  43.33 
 
 
212 aa  106  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0480671 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4293  protein of unknown function DUF892  41.06 
 
 
180 aa  105  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2773  protein of unknown function DUF892  38.06 
 
 
165 aa  104  7e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5574  protein of unknown function DUF892  37.82 
 
 
183 aa  103  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9043  hypothetical protein  42.95 
 
 
165 aa  101  5e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.034068  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2297  hypothetical protein  41.83 
 
 
161 aa  100  7e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5857  protein of unknown function DUF892  36.77 
 
 
174 aa  97.4  7e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0615276  normal  0.702479 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3586  protein of unknown function DUF892  39.35 
 
 
154 aa  95.9  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1633  hypothetical protein  42.28 
 
 
181 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.351952 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2857  hypothetical protein  34.29 
 
 
197 aa  85.5  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>