121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0468 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0468  hypothetical protein  100 
 
 
165 aa  329  9e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.53229  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1820  hypothetical protein  99.39 
 
 
169 aa  328  3e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.418457  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3057  hypothetical protein  91.52 
 
 
165 aa  282  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.460854  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1136  hypothetical protein  66.67 
 
 
165 aa  223  7e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4791  hypothetical protein  65.64 
 
 
165 aa  214  2.9999999999999998e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4540  protein of unknown function DUF892  63.19 
 
 
165 aa  210  9e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.369842 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4275  protein of unknown function DUF892  62.58 
 
 
165 aa  207  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3491  hypothetical protein  61.25 
 
 
163 aa  204  4e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1446  hypothetical protein  62.42 
 
 
165 aa  203  8e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.187122  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5614  protein of unknown function DUF892  64.1 
 
 
168 aa  201  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.255585 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1730  hypothetical protein  63.41 
 
 
165 aa  200  6e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.666521  decreased coverage  0.00187959 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5596  hypothetical protein  62.11 
 
 
166 aa  196  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.756785  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3526  hypothetical protein  55 
 
 
164 aa  189  2e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5592  protein of unknown function DUF892  60 
 
 
166 aa  188  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.544575  hitchhiker  0.00495302 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4247  protein of unknown function DUF892  64.81 
 
 
166 aa  185  3e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4295  hypothetical protein  62.58 
 
 
167 aa  184  5e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2664  hypothetical protein  65.03 
 
 
165 aa  183  7e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.104786  normal  0.942807 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3563  hypothetical protein  65.24 
 
 
166 aa  183  7e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.892765  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4912  hypothetical protein  65.62 
 
 
164 aa  183  7e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.550913 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2670  hypothetical protein  64.42 
 
 
167 aa  183  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0525668  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2984  hypothetical protein  57.24 
 
 
164 aa  182  2.0000000000000003e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.602458 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1737  hypothetical protein  64.63 
 
 
166 aa  181  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.997374  normal  0.0699743 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0740  hypothetical protein  57.59 
 
 
192 aa  178  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7975  protein of unknown function DUF892  57.89 
 
 
179 aa  176  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3294  hypothetical protein  57.14 
 
 
163 aa  175  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.335875 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0289  protein of unknown function DUF892  53.42 
 
 
162 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.302406 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4465  protein of unknown function DUF892  54.43 
 
 
168 aa  171  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5257  protein of unknown function DUF892  55.9 
 
 
162 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4845  protein of unknown function DUF892  54.43 
 
 
167 aa  170  7.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00641789  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1470  hypothetical protein  54.43 
 
 
168 aa  169  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0321654  normal  0.306321 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9043  hypothetical protein  60.13 
 
 
165 aa  169  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.034068  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2220  protein of unknown function DUF892  56.58 
 
 
175 aa  168  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2862  protein of unknown function DUF892  53.8 
 
 
168 aa  167  5e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.217094  normal  0.674493 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4293  protein of unknown function DUF892  58.55 
 
 
180 aa  166  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3906  protein of unknown function DUF892  58.55 
 
 
180 aa  164  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3614  hypothetical protein  57.89 
 
 
180 aa  164  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1033  hypothetical protein  53.85 
 
 
168 aa  160  1e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.665565  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5347  protein of unknown function DUF892  58.86 
 
 
167 aa  158  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3141  hypothetical protein  51.95 
 
 
189 aa  158  4e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51971  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0993  protein of unknown function DUF892  52.26 
 
 
217 aa  158  4e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4862  hypothetical protein  58.86 
 
 
177 aa  158  4e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3827  hypothetical protein  57.81 
 
 
149 aa  157  6e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3218  hypothetical protein  57.05 
 
 
167 aa  156  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.708155  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5401  protein of unknown function DUF892  58.23 
 
 
167 aa  156  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.949113 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4780  hypothetical protein  51.23 
 
 
183 aa  155  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.786292 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4071  hypothetical protein  52.9 
 
 
168 aa  153  8e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0479613  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1657  hypothetical protein  53.8 
 
 
168 aa  153  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0448276  normal  0.877202 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6464  hypothetical protein  57.59 
 
 
167 aa  152  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.255827  normal  0.636279 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3730  protein of unknown function DUF892  52.14 
 
 
169 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3832  hypothetical protein  53.8 
 
 
168 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.148177  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3623  hypothetical protein  52.14 
 
 
169 aa  151  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0183446 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2646  hypothetical protein  49.04 
 
 
189 aa  151  4e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5546  hypothetical protein  51.9 
 
 
168 aa  151  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.376366  normal  0.380191 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1633  hypothetical protein  57.96 
 
 
181 aa  150  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.351952 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2066  hypothetical protein  45.57 
 
 
195 aa  150  1e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0139243 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2659  hypothetical protein  49.34 
 
 
217 aa  149  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1856  hypothetical protein  48.77 
 
 
167 aa  149  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.542717 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1417  protein YciF  48.77 
 
 
167 aa  149  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.341518  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2256  hypothetical protein  49.03 
 
 
169 aa  147  5e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.949168  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4247  hypothetical protein  52.26 
 
 
158 aa  147  7e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0753724 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2287  hypothetical protein  54.55 
 
 
168 aa  147  7e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1919  hypothetical protein  48.15 
 
 
167 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.137818  hitchhiker  0.0000284113 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1861  protein YciF  48.15 
 
 
167 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.919479 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1599  hypothetical protein  48.15 
 
 
167 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.154464 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3365  hypothetical protein  49.66 
 
 
198 aa  145  3e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.430964  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2390  protein of unknown function DUF892  50.33 
 
 
196 aa  144  5e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.421917  normal  0.147329 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3127  hypothetical protein  49.1 
 
 
164 aa  143  9e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.136423 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01232  hypothetical protein  49.7 
 
 
166 aa  143  1e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2390  protein of unknown function DUF892  49.7 
 
 
166 aa  143  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0588252  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1367  YciF protein  49.7 
 
 
166 aa  143  1e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.177269  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1456  YciF protein  49.7 
 
 
166 aa  143  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000775316  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2369  hypothetical protein  49.7 
 
 
166 aa  143  1e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.820184  hitchhiker  0.000000156892 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1874  YciF protein  49.7 
 
 
173 aa  143  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000112449 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1647  YciF protein  48.77 
 
 
166 aa  143  1e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1889  YciF protein  49.7 
 
 
173 aa  143  1e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0111142 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1370  protein of unknown function DUF892  47.4 
 
 
168 aa  143  1e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01242  hypothetical protein  49.7 
 
 
166 aa  143  1e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1678  hypothetical protein  53.16 
 
 
166 aa  142  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.108531  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0088  ycfI, putative structural proteins  53.16 
 
 
166 aa  141  3e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.136593  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1724  hypothetical protein  53.16 
 
 
166 aa  141  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4833  protein of unknown function DUF892  49.07 
 
 
180 aa  141  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1727  protein of unknown function DUF892  45.73 
 
 
184 aa  141  4e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403983  hitchhiker  0.000459015 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1308  protein of unknown function DUF892  44.51 
 
 
191 aa  140  8e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.758326  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0196  hypothetical protein  46.31 
 
 
169 aa  136  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2487  protein of unknown function DUF892  44.59 
 
 
247 aa  130  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.48482  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4158  protein of unknown function DUF892  45.27 
 
 
162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3186  hypothetical protein  45.06 
 
 
174 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0036  hypothetical protein  49.03 
 
 
175 aa  125  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0130409 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5097  hypothetical protein  49.66 
 
 
165 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2545  hypothetical protein  43.9 
 
 
168 aa  124  4.0000000000000003e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2489  non-heme manganese-containing catalase  46.48 
 
 
421 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5574  protein of unknown function DUF892  42.76 
 
 
183 aa  117  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5857  protein of unknown function DUF892  40.13 
 
 
174 aa  116  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0615276  normal  0.702479 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1026  hypothetical protein  46.3 
 
 
187 aa  112  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.158329  hitchhiker  0.000105516 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1599  protein of unknown function DUF892  42.76 
 
 
164 aa  110  7.000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0568744  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2773  protein of unknown function DUF892  42.31 
 
 
165 aa  109  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2297  hypothetical protein  40.15 
 
 
161 aa  102  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3344  protein of unknown function DUF892  40.52 
 
 
212 aa  99  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0480671 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5840  protein of unknown function DUF892  56.67 
 
 
253 aa  99.8  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.197691  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3586  protein of unknown function DUF892  37.76 
 
 
154 aa  92.4  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>