116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2670 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_2670  hypothetical protein  100 
 
 
167 aa  332  1e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0525668  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1730  hypothetical protein  77.16 
 
 
165 aa  265  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.666521  decreased coverage  0.00187959 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4247  protein of unknown function DUF892  80.12 
 
 
166 aa  250  6e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1737  hypothetical protein  77.71 
 
 
166 aa  243  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.997374  normal  0.0699743 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3563  hypothetical protein  77.71 
 
 
166 aa  242  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.892765  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4540  protein of unknown function DUF892  66.46 
 
 
165 aa  227  5e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.369842 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4275  protein of unknown function DUF892  64.63 
 
 
165 aa  221  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4791  hypothetical protein  64.02 
 
 
165 aa  220  7e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4912  hypothetical protein  73.29 
 
 
164 aa  219  9e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.550913 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5596  hypothetical protein  64.74 
 
 
166 aa  213  7e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.756785  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1446  hypothetical protein  64.81 
 
 
165 aa  213  9.999999999999999e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.187122  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5614  protein of unknown function DUF892  61.73 
 
 
168 aa  211  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.255585 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3491  hypothetical protein  62.11 
 
 
163 aa  209  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1136  hypothetical protein  62.89 
 
 
165 aa  209  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5592  protein of unknown function DUF892  62.66 
 
 
166 aa  209  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.544575  hitchhiker  0.00495302 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2664  hypothetical protein  69.51 
 
 
165 aa  202  2e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.104786  normal  0.942807 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2984  hypothetical protein  59.87 
 
 
164 aa  197  7e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.602458 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4295  hypothetical protein  59.88 
 
 
167 aa  195  3e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3526  hypothetical protein  52.8 
 
 
164 aa  190  6e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1820  hypothetical protein  64.42 
 
 
169 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.418457  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0468  hypothetical protein  64.42 
 
 
165 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.53229  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5257  protein of unknown function DUF892  57.59 
 
 
162 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3057  hypothetical protein  63.19 
 
 
165 aa  181  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.460854  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3294  hypothetical protein  56.96 
 
 
163 aa  177  4e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.335875 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0740  hypothetical protein  51.85 
 
 
192 aa  176  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7975  protein of unknown function DUF892  54.19 
 
 
179 aa  174  5e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3827  hypothetical protein  63.64 
 
 
149 aa  173  9.999999999999999e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2220  protein of unknown function DUF892  51.22 
 
 
175 aa  169  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3906  protein of unknown function DUF892  54.04 
 
 
180 aa  166  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3614  hypothetical protein  53.42 
 
 
180 aa  166  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9043  hypothetical protein  58.86 
 
 
165 aa  165  2.9999999999999998e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.034068  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0289  protein of unknown function DUF892  51.27 
 
 
162 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.302406 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4293  protein of unknown function DUF892  51.55 
 
 
180 aa  161  3e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0993  protein of unknown function DUF892  49.06 
 
 
217 aa  160  6e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2862  protein of unknown function DUF892  50 
 
 
168 aa  160  1e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.217094  normal  0.674493 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2390  protein of unknown function DUF892  50.62 
 
 
196 aa  158  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.421917  normal  0.147329 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4845  protein of unknown function DUF892  51.27 
 
 
167 aa  157  5e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00641789  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1033  hypothetical protein  51.28 
 
 
168 aa  156  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.665565  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1470  hypothetical protein  50 
 
 
168 aa  155  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0321654  normal  0.306321 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1308  protein of unknown function DUF892  48.15 
 
 
191 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.758326  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4780  hypothetical protein  50.31 
 
 
183 aa  153  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.786292 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1727  protein of unknown function DUF892  48.12 
 
 
184 aa  152  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403983  hitchhiker  0.000459015 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4465  protein of unknown function DUF892  49.37 
 
 
168 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2066  hypothetical protein  45 
 
 
195 aa  149  1e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0139243 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4247  hypothetical protein  51.01 
 
 
158 aa  149  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0753724 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4833  protein of unknown function DUF892  50.32 
 
 
180 aa  149  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3218  hypothetical protein  53.42 
 
 
167 aa  148  4e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.708155  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1633  hypothetical protein  54.09 
 
 
181 aa  148  4e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.351952 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2659  hypothetical protein  46.79 
 
 
217 aa  146  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3365  hypothetical protein  49.36 
 
 
198 aa  146  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.430964  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5401  protein of unknown function DUF892  55.7 
 
 
167 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.949113 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3832  hypothetical protein  50 
 
 
168 aa  145  3e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.148177  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4862  hypothetical protein  54.43 
 
 
177 aa  145  3e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5347  protein of unknown function DUF892  54.43 
 
 
167 aa  145  3e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1657  hypothetical protein  49.37 
 
 
168 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0448276  normal  0.877202 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4071  hypothetical protein  47.74 
 
 
168 aa  142  3e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0479613  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0036  hypothetical protein  46.45 
 
 
175 aa  142  3e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0130409 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1370  protein of unknown function DUF892  43.75 
 
 
168 aa  140  7e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5546  hypothetical protein  47.47 
 
 
168 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.376366  normal  0.380191 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0196  hypothetical protein  46 
 
 
169 aa  138  3e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6464  hypothetical protein  53.16 
 
 
167 aa  137  6e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.255827  normal  0.636279 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3141  hypothetical protein  43.51 
 
 
189 aa  137  8.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51971  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2646  hypothetical protein  42.04 
 
 
189 aa  137  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1856  hypothetical protein  45.28 
 
 
167 aa  136  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.542717 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1417  protein YciF  45.28 
 
 
167 aa  136  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.341518  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3127  hypothetical protein  44.79 
 
 
164 aa  135  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.136423 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3730  protein of unknown function DUF892  44.59 
 
 
169 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1647  YciF protein  47.17 
 
 
166 aa  136  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2287  hypothetical protein  47.5 
 
 
168 aa  134  5e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3623  hypothetical protein  43.4 
 
 
169 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0183446 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1919  hypothetical protein  44.65 
 
 
167 aa  133  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.137818  hitchhiker  0.0000284113 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1861  protein YciF  44.65 
 
 
167 aa  133  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.919479 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1599  hypothetical protein  44.65 
 
 
167 aa  133  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.154464 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2487  protein of unknown function DUF892  42.68 
 
 
247 aa  132  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.48482  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1678  hypothetical protein  49.37 
 
 
166 aa  131  5e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.108531  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2256  hypothetical protein  43.23 
 
 
169 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.949168  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01232  hypothetical protein  44.03 
 
 
166 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2390  protein of unknown function DUF892  44.03 
 
 
166 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0588252  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0088  ycfI, putative structural proteins  49.37 
 
 
166 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.136593  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1724  hypothetical protein  49.37 
 
 
166 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1367  YciF protein  44.03 
 
 
166 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.177269  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1456  YciF protein  44.03 
 
 
166 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000775316  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2369  hypothetical protein  44.03 
 
 
166 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.820184  hitchhiker  0.000000156892 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1874  YciF protein  44.03 
 
 
173 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000112449 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1889  YciF protein  44.03 
 
 
173 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0111142 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01242  hypothetical protein  44.03 
 
 
166 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5574  protein of unknown function DUF892  39.63 
 
 
183 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2545  hypothetical protein  40.12 
 
 
168 aa  126  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2489  non-heme manganese-containing catalase  42.77 
 
 
421 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5097  hypothetical protein  44.37 
 
 
165 aa  122  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5857  protein of unknown function DUF892  37.58 
 
 
174 aa  117  9e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0615276  normal  0.702479 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4158  protein of unknown function DUF892  36.65 
 
 
162 aa  116  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1026  hypothetical protein  45.34 
 
 
187 aa  115  1.9999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.158329  hitchhiker  0.000105516 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3186  hypothetical protein  40.88 
 
 
174 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5840  protein of unknown function DUF892  57.78 
 
 
253 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.197691  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1599  protein of unknown function DUF892  38.82 
 
 
164 aa  107  6e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0568744  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2297  hypothetical protein  40.13 
 
 
161 aa  105  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3344  protein of unknown function DUF892  38.31 
 
 
212 aa  104  6e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0480671 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2773  protein of unknown function DUF892  34.23 
 
 
165 aa  101  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2857  hypothetical protein  35.81 
 
 
197 aa  88.6  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>