225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1366 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1366  hypothetical protein  100 
 
 		 490 aa  1018    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1268  hypothetical protein  60.95 
 
 		 525 aa  664    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000935353  normal  0.269332 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0998  hypothetical protein  93.27 
 
 		 488 aa  955    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.418553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01411  hypothetical protein  42.63 
 
 		 489 aa  368  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004051  UPF0061 domain-containing protein  42.32 
 
 		 489 aa  362  8e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.243743  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1520  hypothetical protein  42.54 
 
 		 508 aa  349  7e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2210  hypothetical protein  42.31 
 
 		 485 aa  348  1e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0842577  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1828  hypothetical protein  40.37 
 
 		 480 aa  344  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1440  hypothetical protein  40.17 
 
 		 480 aa  343  4e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0641647 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1474  hypothetical protein  40.37 
 
 		 480 aa  343  4e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2000  hypothetical protein  40.37 
 
 		 480 aa  343  5e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.407713 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1456  hypothetical protein  40.37 
 
 		 480 aa  343  5e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1924  hypothetical protein  42.17 
 
 		 478 aa  341  2e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0996685  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01675  hypothetical protein  42.17 
 
 		 478 aa  339  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0763449  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01664  hypothetical protein  42.17 
 
 		 478 aa  339  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.049992  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1836  hypothetical protein  40.58 
 
 		 497 aa  339  5.9999999999999996e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.421405 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2424  hypothetical protein  42.17 
 
 		 478 aa  338  9e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1910  hypothetical protein  41.96 
 
 		 478 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1925  hypothetical protein  41.96 
 
 		 478 aa  337  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.369744 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1786  hypothetical protein  41.75 
 
 		 478 aa  336  5.999999999999999e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1936  protein of unknown function UPF0061  41.75 
 
 		 478 aa  336  7e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1768  hypothetical protein  39.76 
 
 		 507 aa  335  7.999999999999999e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0126151 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1484  hypothetical protein  41.75 
 
 		 478 aa  333  3e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2120  hypothetical protein  40.61 
 
 		 473 aa  333  5e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120704 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1840  hypothetical protein  40.96 
 
 		 487 aa  333  5e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1734  hypothetical protein  40.96 
 
 		 483 aa  332  7.000000000000001e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1736  hypothetical protein  41.25 
 
 		 480 aa  331  1e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.106684 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2164  hypothetical protein  41.06 
 
 		 480 aa  330  3e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.649385  normal  0.541556 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4941  hypothetical protein  38.66 
 
 		 486 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2569  hypothetical protein  38.52 
 
 		 484 aa  328  1.0000000000000001e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000577129  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2576  hypothetical protein  38.52 
 
 		 484 aa  328  1.0000000000000001e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00357647  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2583  hypothetical protein  38.52 
 
 		 484 aa  328  1.0000000000000001e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.109639  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5118  hypothetical protein  38.87 
 
 		 486 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.380647  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5068  hypothetical protein  38.66 
 
 		 540 aa  326  5e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2765  hypothetical protein  40.79 
 
 		 483 aa  326  5e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.862973  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1192  protein of unknown function UPF0061  39.68 
 
 		 492 aa  324  2e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1659  hypothetical protein  40.32 
 
 		 483 aa  325  2e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2463  hypothetical protein  40.24 
 
 		 483 aa  323  5e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0398  hypothetical protein  38.1 
 
 		 486 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2581  hypothetical protein  38.88 
 
 		 496 aa  321  1.9999999999999998e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0720636 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1366  hypothetical protein  38.25 
 
 		 522 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.389221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2495  hypothetical protein  39.88 
 
 		 494 aa  320  3.9999999999999996e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1931  hypothetical protein  37.85 
 
 		 522 aa  319  7e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0356725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2514  hypothetical protein  40.4 
 
 		 490 aa  318  2e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6171  hypothetical protein  37.65 
 
 		 522 aa  318  2e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1908  hypothetical protein  37.65 
 
 		 522 aa  318  2e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0738688  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5209  hypothetical protein  37.85 
 
 		 540 aa  317  4e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.356256 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3959  hypothetical protein  39.34 
 
 		 480 aa  317  4e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.901643  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1826  hypothetical protein  37.65 
 
 		 522 aa  316  6e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.469331  normal  0.512842 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4038  hypothetical protein  38.43 
 
 		 499 aa  313  3.9999999999999997e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3302  hypothetical protein  39.41 
 
 		 510 aa  311  1e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.232274 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1631  hypothetical protein  39.4 
 
 		 483 aa  311  2e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1026  hypothetical protein  38.43 
 
 		 505 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.260579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1842  hypothetical protein  37.57 
 
 		 503 aa  310  2.9999999999999997e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0596  hypothetical protein  37.58 
 
 		 517 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2947  hypothetical protein  38.61 
 
 		 498 aa  310  4e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.497677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1045  hypothetical protein  38.4 
 
 		 494 aa  310  5.9999999999999995e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0432954 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1896  hypothetical protein  37.05 
 
 		 522 aa  310  5.9999999999999995e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5028  hypothetical protein  39.96 
 
 		 487 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1167  hypothetical protein  36.96 
 
 		 494 aa  308  2.0000000000000002e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1924  hypothetical protein  36.79 
 
 		 518 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.064946  normal  0.732324 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1396  hypothetical protein  37.08 
 
 		 520 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2395  hypothetical protein  38.4 
 
 		 496 aa  303  6.000000000000001e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.39187  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0444  hypothetical protein  39.44 
 
 		 487 aa  301  2e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.734273  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1864  hypothetical protein  38.22 
 
 		 544 aa  299  8e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.236339 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2140  hypothetical protein  36.06 
 
 		 521 aa  298  1e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0423999  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1440  hypothetical protein  36.12 
 
 		 525 aa  298  2e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.558637  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2457  hypothetical protein  36.12 
 
 		 521 aa  298  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1204  hypothetical protein  36.12 
 
 		 525 aa  298  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2297  hypothetical protein  36.12 
 
 		 525 aa  298  2e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.398806  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2276  hypothetical protein  36.78 
 
 		 518 aa  298  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.391464  normal  0.115261 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1931  hypothetical protein  36.12 
 
 		 525 aa  298  2e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.904611  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5760  hypothetical protein  39.47 
 
 		 486 aa  297  2e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3374  hypothetical protein  36.12 
 
 		 521 aa  298  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0971  hypothetical protein  38.11 
 
 		 488 aa  296  4e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.803854  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2336  hypothetical protein  36.12 
 
 		 521 aa  296  5e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2948  hypothetical protein  36.55 
 
 		 492 aa  296  5e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0585  hypothetical protein  38.21 
 
 		 504 aa  296  7e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.473998  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1748  hypothetical protein  37.45 
 
 		 525 aa  296  8e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0735869  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0982  hypothetical protein  35.56 
 
 		 500 aa  295  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66410  hypothetical protein  38.46 
 
 		 486 aa  294  2e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1677  hypothetical protein  38.33 
 
 		 495 aa  294  2e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1800  hypothetical protein  38.15 
 
 		 476 aa  294  2e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0997  hypothetical protein  36.29 
 
 		 491 aa  294  3e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2495  hypothetical protein  36.65 
 
 		 492 aa  293  3e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.469671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0823  hypothetical protein  37.55 
 
 		 493 aa  293  3e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3863  hypothetical protein  37.57 
 
 		 491 aa  294  3e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4892  hypothetical protein  37.11 
 
 		 491 aa  293  3e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.856599  hitchhiker  0.00960553 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3269  hypothetical protein  36.8 
 
 		 483 aa  293  4e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2335  hypothetical protein  36.2 
 
 		 491 aa  293  4e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.331723 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1497  hypothetical protein  37.83 
 
 		 529 aa  293  4e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0834231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2027  protein of unknown function UPF0061  38.33 
 
 		 495 aa  292  1e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4843  protein of unknown function UPF0061  37.61 
 
 		 502 aa  291  1e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.287354  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1456  hypothetical protein  37.83 
 
 		 529 aa  290  3e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0629194  hitchhiker  0.0000911668 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0017  protein of unknown function UPF0061  37.95 
 
 		 500 aa  290  5.0000000000000004e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.394227  normal  0.227022 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0494  hypothetical protein  38.06 
 
 		 487 aa  290  6e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1019  hypothetical protein  36.13 
 
 		 488 aa  288  1e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00586805 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2019  hypothetical protein  38.55 
 
 		 481 aa  288  1e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0857  hypothetical protein  35.96 
 
 		 500 aa  288  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.220495  normal  0.340098 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0558  hypothetical protein  38.38 
 
 		 487 aa  287  2e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000359024 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>