More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0168 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0168  A/G-specific adenine glycosylase  100 
 
 
424 aa  882    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000132987  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1984  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  63.01 
 
 
453 aa  567  1e-160  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.328101  normal  0.393206 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2284  A/G-specific adenine glycosylase  62.33 
 
 
453 aa  556  1e-157  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0648198 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1003  A/G-specific adenine glycosylase  42.78 
 
 
354 aa  290  2e-77  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0662317  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1133  A/G-specific adenine DNA glycosylase  42.78 
 
 
354 aa  290  5.0000000000000004e-77  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.893564  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0755  A/G-specific adenine glycosylase  41.9 
 
 
350 aa  288  9e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3366  adenine DNA glycosylase  44.38 
 
 
352 aa  281  2e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0209119 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3307  adenine DNA glycosylase  42.3 
 
 
360 aa  280  3e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3122  adenine DNA glycosylase  42.3 
 
 
360 aa  280  4e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3394  adenine DNA glycosylase  42.02 
 
 
360 aa  280  5e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0076  A/G-specific adenine glycosylase  43.18 
 
 
354 aa  280  5e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.80443  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2490  A/G-specific adenine glycosylase  42.08 
 
 
368 aa  278  1e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.646812  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3104  adenine DNA glycosylase  43.31 
 
 
350 aa  277  3e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00400976 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02791  adenine DNA glycosylase  43.02 
 
 
350 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0610871  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0734  A/G-specific adenine glycosylase  43.02 
 
 
350 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02754  hypothetical protein  43.02 
 
 
350 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0736099  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3358  adenine DNA glycosylase  43.77 
 
 
350 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.173815 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3284  adenine DNA glycosylase  43.77 
 
 
350 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0228526 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2873  A/G-specific adenine glycosylase  39.54 
 
 
357 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0753  adenine DNA glycosylase  43.02 
 
 
350 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.852915  normal  0.0133097 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3274  adenine DNA glycosylase  43.77 
 
 
350 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4265  adenine DNA glycosylase  42.73 
 
 
350 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.528078  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3176  A/G-specific adenine glycosylase  42.52 
 
 
354 aa  274  2.0000000000000002e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3453  adenine DNA glycosylase  44.19 
 
 
350 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.849569 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3350  adenine DNA glycosylase  44.19 
 
 
350 aa  273  5.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.443349 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0522  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.06 
 
 
353 aa  271  1e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000130755  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00282  A/G-specific adenine glycosylase  50.57 
 
 
355 aa  271  1e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.274494  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0306  A/G-specific adenine glycosylase  50 
 
 
355 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0367853 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3368  A/G-specific adenine glycosylase  43.11 
 
 
365 aa  269  7e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4922  A/G-specific adenine glycosylase  49.62 
 
 
355 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000208141 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1181  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  43.27 
 
 
372 aa  268  1e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000011452  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0286  A/G-specific adenine glycosylase  49.62 
 
 
355 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000160369 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1180  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  43.27 
 
 
372 aa  267  2e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000236828  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0882  adenine DNA glycosylase  41.49 
 
 
368 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0311  A/G-specific adenine glycosylase  49.24 
 
 
355 aa  266  4e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.354771  normal  0.798997 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1108  A/G-specific adenine glycosylase  40.16 
 
 
354 aa  266  4e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000562379  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1251  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  43.27 
 
 
372 aa  266  4e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000556638  normal  0.540816 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1851  A/G-specific adenine glycosylase  41.72 
 
 
381 aa  266  5e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.641505  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2945  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.37 
 
 
348 aa  266  7e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4259  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  48.86 
 
 
355 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000489397 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2695  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  49.04 
 
 
361 aa  265  1e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.375064 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1123  A/G-specific adenine glycosylase  42.82 
 
 
368 aa  264  2e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000383287  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3407  adenine DNA glycosylase  41.75 
 
 
368 aa  264  3e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0148197  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4148  A/G-specific adenine glycosylase  42.94 
 
 
362 aa  263  4e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04530  A/G-specific adenine glycosylase  48.86 
 
 
362 aa  263  4.999999999999999e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5884  A/G-specific adenine glycosylase  48.86 
 
 
355 aa  262  1e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4043  adenine DNA glycosylase  41.09 
 
 
381 aa  261  1e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0975151 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1545  A/G-specific adenine glycosylase  46.98 
 
 
374 aa  262  1e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.151581  normal  0.696978 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0064  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.9 
 
 
345 aa  260  3e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000461825  normal  0.645907 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0820  adenine DNA glycosylase  50.18 
 
 
419 aa  259  4e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.746728  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0320  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  49.24 
 
 
355 aa  259  6e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0253407  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0819  adenine DNA glycosylase  50.18 
 
 
371 aa  259  7e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0151  adenine DNA glycosylase  49.82 
 
 
372 aa  258  1e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.523345  hitchhiker  0.00000764149 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4901  A/G-specific adenine glycosylase MutY  48.11 
 
 
355 aa  258  1e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0534  A/G-specific adenine glycosylase  40.72 
 
 
350 aa  258  1e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000506444  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1219  A/G-specific adenine glycosylase  41.87 
 
 
370 aa  258  2e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000411331  normal  0.458065 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0320  A/G-specific adenine glycosylase  38.78 
 
 
369 aa  256  4e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3026  adenine DNA glycosylase  39.95 
 
 
363 aa  256  4e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5342  A/G-specific adenine glycosylase  47.73 
 
 
355 aa  256  6e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1319  A/G-specific adenine glycosylase  46.69 
 
 
382 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.565336  normal  0.399065 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0120  A/G-specific adenine glycosylase  41.35 
 
 
350 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000558564  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3206  adenine DNA glycosylase  40.21 
 
 
361 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141745  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03591  A/G-specific adenine glycosylase  50 
 
 
358 aa  253  6e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2700  A/G-specific adenine glycosylase  40.05 
 
 
362 aa  252  7e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.469189  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0930  hypothetical protein  45.08 
 
 
355 aa  251  1e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4128  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  38.27 
 
 
375 aa  251  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0003  A/G-specific adenine glycosylase  45.61 
 
 
353 aa  251  2e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000019513  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3053  A/G-specific adenine glycosylase  39.79 
 
 
363 aa  250  4e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000966997  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2484  A/G-specific adenine glycosylase  39.12 
 
 
351 aa  250  4e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.054376  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0960  hypothetical protein  44.7 
 
 
355 aa  249  6e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2698  A/G-specific adenine glycosylase  38.66 
 
 
357 aa  249  6e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.285763  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0937  A/G-specific adenine glycosylase  38.97 
 
 
349 aa  248  1e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1325  A/G-specific adenine glycosylase  40.83 
 
 
363 aa  248  2e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00655288  hitchhiker  0.00812067 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3196  A/G-specific adenine glycosylase  39.28 
 
 
363 aa  247  2e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000131734  normal  0.644967 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67990  A/G-specific adenine glycosylase  48.86 
 
 
355 aa  248  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.259301  normal  0.0147952 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0590  A/G-specific adenine glycosylase  45.02 
 
 
353 aa  247  3e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.123434  decreased coverage  0.000793491 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01430  A/G-specific adenine glycosylase  47.46 
 
 
357 aa  246  6e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.229953  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3039  A/G-specific adenine glycosylase  39.28 
 
 
363 aa  246  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000495773  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002446  A/G-specific adenine glycosylase  48.15 
 
 
358 aa  245  9.999999999999999e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0492141  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0376  A/G-specific adenine glycosylase  41.03 
 
 
358 aa  245  9.999999999999999e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.798144  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0759  A/G-specific adenine glycosylase  39.3 
 
 
368 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0518  A/G-specific adenine glycosylase  37.44 
 
 
370 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.851283  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4339  A/G-specific adenine glycosylase  37.08 
 
 
353 aa  243  5e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00948332  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0591  A/G-specific adenine glycosylase  39 
 
 
368 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0575  A/G-specific adenine glycosylase  39 
 
 
368 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.424229  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0857  A/G-specific adenine glycosylase  38.81 
 
 
353 aa  242  1e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2267  A/G-specific adenine glycosylase MutY  46.24 
 
 
354 aa  242  1e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2808  A/G-specific adenine glycosylase  37.69 
 
 
368 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3114  A/G-specific adenine glycosylase  38.71 
 
 
368 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2936  A/G-specific adenine glycosylase  38.71 
 
 
368 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1508  A/G-specific adenine glycosylase  38.71 
 
 
368 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.198974  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0337  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  48.11 
 
 
355 aa  240  2.9999999999999997e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.625053  normal  0.0756352 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2183  A/G-specific adenine glycosylase  37.44 
 
 
368 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602702  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2797  A/G-specific adenine glycosylase  37.44 
 
 
368 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0082  A/G-specific adenine glycosylase  38.71 
 
 
368 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0443  A/G-specific adenine glycosylase  39.33 
 
 
359 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0905  A/G-specific adenine glycosylase  42.31 
 
 
384 aa  239  5.999999999999999e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6127  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  36.92 
 
 
368 aa  238  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201611  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0480  A/G-specific adenine glycosylase  45.35 
 
 
368 aa  239  1e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1299  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  42.36 
 
 
357 aa  237  3e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.360149  normal  0.203182 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>