22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3973 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4570  hypothetical protein  45.81 
 
 		 856 aa  691    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3973  hypothetical protein  100 
 
 		 822 aa  1665    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.642221  normal  0.635484 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4439  hypothetical protein  41.26 
 
 		 822 aa  597  1e-169  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4688  hypothetical protein  39.19 
 
 		 836 aa  556  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000356334  unclonable  0.00000000000739764 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3248  outermembrane fimbrial usher protein  25.53 
 
 		 910 aa  56.6  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0215  outermembrane fimbrial usher protein  35.14 
 
 		 875 aa  54.7  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0152317 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0347  TcfC protein  36.49 
 
 		 895 aa  54.7  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0932799 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0340  hypothetical protein  36.49 
 
 		 895 aa  54.3  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.638393 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0036  fimbrial usher family protein  24.65 
 
 		 872 aa  50.8  0.00009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0254  hypothetical protein  38.57 
 
 		 771 aa  50.1  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1504  putative enzyme  22.1 
 
 		 840 aa  48.9  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3657  hypothetical protein  38.57 
 
 		 777 aa  49.3  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.549342 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3964  hypothetical protein  38.57 
 
 		 771 aa  48.9  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01652  hypothetical protein  26.49 
 
 		 911 aa  48.1  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0337  hypothetical protein  32.17 
 
 		 841 aa  47.4  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.365908  normal  0.874038 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3313  conserved hypothetical protein  32.17 
 
 		 841 aa  47  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00253  hypothetical protein  32.17 
 
 		 841 aa  47  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0317  hypothetical protein  32.17 
 
 		 841 aa  47  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0205782  hitchhiker  0.00830158 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3328  hypothetical protein  32.17 
 
 		 841 aa  47  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0301  hypothetical protein  32.17 
 
 		 841 aa  47  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.974052  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00250  predicted aromatic compound dioxygenase  32.17 
 
 		 841 aa  47  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2406  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.99 
 
 		 812 aa  44.3  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>