19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C0340 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_0215  outermembrane fimbrial usher protein  49.94 
 
 		 875 aa  842    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0152317 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0347  TcfC protein  99.22 
 
 		 895 aa  1826    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0932799 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0340  hypothetical protein  100 
 
 		 895 aa  1838    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.638393 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6645  outermembrane fimbrial usher protein  37.37 
 
 		 900 aa  547  1e-154  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000201733 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3248  outermembrane fimbrial usher protein  32.62 
 
 		 910 aa  451  1e-125  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3387  hypothetical protein  33.07 
 
 		 894 aa  410  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3563  hypothetical protein  32.49 
 
 		 900 aa  403  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3278  hypothetical protein  32.56 
 
 		 900 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.887347  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0605  outer membrane fimbrial user protein  32.56 
 
 		 894 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0036  fimbrial usher family protein  31.95 
 
 		 872 aa  381  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3066  hypothetical protein  23.01 
 
 		 809 aa  57.8  0.0000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00683748  decreased coverage  0.00952273 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4439  hypothetical protein  30.66 
 
 		 822 aa  56.2  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3973  hypothetical protein  36.49 
 
 		 822 aa  54.3  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.642221  normal  0.635484 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4688  hypothetical protein  34.18 
 
 		 836 aa  53.5  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000356334  unclonable  0.00000000000739764 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4570  hypothetical protein  34.25 
 
 		 856 aa  50.1  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2708  hypothetical protein  26.07 
 
 		 977 aa  46.6  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0317  hypothetical protein  22.85 
 
 		 841 aa  45.8  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0205782  hitchhiker  0.00830158 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00250  predicted aromatic compound dioxygenase  22.69 
 
 		 841 aa  45.8  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00253  hypothetical protein  22.69 
 
 		 841 aa  45.8  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>